COUP-TFI, который кодирует ядерный рецептор, экспрессируется градировано (высокий уровень в каудолатеральных частях и низкий в ростромедиальных частях) в неокортексе с самого начало кортикогенеза. С помощью нокаута COUP-TFI у мышей, авт. показали, что этот ген регулирует паттерны экспрессии нескольких регион-специфических маркеров в коре, включая Id2, ROR и cadherin 8. Экспрессия др. intrinsic паттерн формирующих генов , Pax6 и Emx2, не нарушена в головном мозге мутантов, это указывает на то, что COUP-TFI действует на отдельном пути. Регион-специфическая экспрессия COUP-TFI поддерживается после рождения, так что она участвует в поддержании и установлении региональных особенностей мозга.
Паттерны талямокортикальных общений также меняются в головном мозге COUP-TFI мутантов. Обычно проецируемое в зрительный кортекс и в ventrobasal thalamus (VB) теперь lateral geniculate nucleus (LGN) проецируется в соматосенсорный кортекс. Но аксональное мечение выявляет проекции из VB в визуальный кортекс у COUP-TFI мутантов. На базе экспрессии маркерных генов формирование паттерна талямуса, выголядит незатронутым, это указывает на то, что дефект находится в мишенях для аксонов; т.е. в кортексе. Возможно, что COUP-TFI активирует сигналы наведения в коре, которые управляют миграцией талямических аксонов. Однако, Zhou et al. обнаружили, что аксоны, по-видимому, направляются неправильно с того момента, когда они покидают внутреннюю капсулу талямуса, и они полгают, что вряд ли диффундирующие молекулы из коры м. действовать на таком большом расстоянии.
Итак, Zhou et al.выявили роль COUP-TFI в регионализации коры, но многие аспекты функции еще неясны.