Rab GTPases associate with the surfaces of distinct, intracellular, membrane compartments through their prenyl groups, and they regulate vesicle formation, motility, docking and fusion. Prenylated Rabs are also present in the cytosol, where they are maintained in an inactive state by guanine nucleotide dissociation inhibitor (GDI). Rab9 binds GDI with high affinity, so how does it know when to let go? Suzanne Pfeffer's group previously proposed that a specific factor might catalyse the dissociation of Rab–GDI complexes to allow Rabs to be transferred from GDI onto membranes. And now, in Nature, this group shows that Yip proteins might fulfil this role.
В клетках млекопитающих имеется по крайней мере 5 Yip-type белков, a human Yip3 homologue, как известно, взаимодействует с многочисленными, prenylated Rabs и взаимодействует слабо с GDI. Авт. изучали эффект human Yip3 — ирнтегрального мембранного белка — на комплексы Rab9–GDI. GDI блокирует высвобождение GDP из Rab9, но если добавляется Yip3 к комплексу Rab9–GDI, то Rab9 обменивается нуклеотидами с той же самой скоростью, что и свободный Rab9 белок. Итак, Yip3 не функционирует в качестве фактора обмена guanine нуклеотида. Авт. показали, что Yip3 функционирует как GDI-displacement factor (GDF) для Rab9.
Pfeffer и др. также показали, что мембраны из клеток избыточно экспрессирующих Yip3 рекрутируют существенно больше Rab9 из комплексов Rab9–GDI, чем мембраны из клеток дикого типа. Этот эффект оказался специфичным (anti-Yip3 антитела заметно редуцировали поставку Rab9) и каталитическим (Rab9 рекрутируется до уровня, который в 15 раз выше, чем уровень Yip3 в мембранах).
Yip3 локализуется в позднем Golgi и эндоцитотическом пути, так что авт. исследовали, осуществляет ли Yip3 преимущественно катализ диссоциации GDI от эндоцитотических Rabs, чем из endoplasmic-reticulum и early-Golgi, Rabs. Они показали, что хотя Yip3 м. взаимодействовать слабо с Rabs из разных мест, но он м. катализировать только диссоциацию GDI от эндоцитотичесикх Rabs (таких как Rab9). Эта специфичность функции Yip3 подтверждена на живых клетках с использованием RNA interference.
Pfeffer's группа , следовательно, установила, что Yip3 является GDF, который м. находить эндоцитотические Rabs в эукариотических клетках. Yip белки, в целом, м. выполнять важную роль в нахождении Rab и авт. склняются в пользу модели, сгласно которой Yip белки поставляют Rabs ближе к их финальным мишеням и затем взаимодействия эффекторов стабилизируют Rabs в правильном местоположении.