THE 3'–5' EXONUCLEASES Nature Reviews Molecular Cell Biology 3, 364 -376 (2002) | |
(Рис.1.) | | Structure of a DNA polymerase polypeptide that contains a 3'–5' proofreading exonuclease. (Рис.2.) | Functional domains of selected 3'–5' exonucleases. (Рис.3.) | Intra- and intermolecular proofreading. (Рис.4.) | Architecture of the replicative DNA polymerase III holoenzyme from E. coli. |
В последнее время идентифицировано несколько новых 3'–5' exonucleases. In vitro исследования этих энзимов позволили выявить некоторые их потенциальные функции in vivo, а некоторые организмы с дефектами 3'–5' exonucleases обнаруживают повышенную чувствительность к опухолям, особенно в условиях стресса. Рассматривается роль 3'–5' exonucleases в качественном контроле синтеза ДНК, где они действуют в качестве проверяющих считывание exonucleases для DNA polymerases во время репликации, репарации и рекомбинации ДНК.
в Обзоре суммированы 3'–5' exonucleases и их возможная роль в синтезе ДНК. DNA polymerases необходимы для поддержания интеграции генома во время процессов репликации и репарации ДНК, translesion синтеза ДНК, рекомбинации ДНК, контроля клеточного цикла и функции DNA-damage-checkpoint.
Ассоциированная активность 3'–5' exonuclease позволяет polymerase удалять неправильно вставившиеся нуклеотиды и гарантирует высокую точность синтеза ДНК, которая обязательна для правильной репликации.
По своей функции 3'–5' exonucleases м.б. подразделены на внутренние, ассоциированные с полимеразой энзимы или независимые автономные энзимы. Ассоциированные с полимеразой экзонуклеазы включают Escherichia coli pol I, бактериофаговые полимеразы и эукариотические pols δ, alt ε и γ. Автономные эндонуклеазы включают TREX1 и TREX2 энзимы млекопитающих.
Среди вновь открытых экзонуклеаз Werner syndrome (WRN) protein; p53; MRE11 (которая участвует в репарации двойной нити); два checkpoint proteins, RAD1 и RAD9; APE1 (участвует в репарационной эксцизии репарации); и VDJP белок, который участвует в V(D)J рекомбинации.
|