Два паралога flotillin 1А и flotillin 1В кодируют ассоциированные с мембранами белки. Обе мРНК присутсвуют во время оогенеза и на стадиях дробления. После начала зиготической транскрипции flotillin 1 транскрипты впервые обнаруживаются в эмбриональной эктодерме и их уровень увеличивается в презумптивной нейральной эктодерме при образовании нервной трубки. По мере дифференцировки нервной трубки транскрипты flotillin 1 оказываются наиболее многочисленны в в дорсальной половине, с особенно высокой экспрессией в дорсальных первичных нейронах. На стадии ранней хвостовой почки выявляется дополнительная экспрессия в параксиальной мезодерме. Позднее flotillin 1А экспрессируется в мезенхиме бранхиальных дуг, в лежащей поверх бранхиальной эктодерме и в дорсальной сомитной мезодерме, тогда как экспрессия flotillin 1В ограничена дорсальной частью нервной трубки и сенсорными структурами головы.