Orthodenticle (otd/Otx2) Family
Evolutionary conservation of otd/Otx2 transcription factor action: a genome-wide microarray analysis in Drosophila Haiqiong Montalta-He, Ronny Leemans, Thomas Loop, Martin Strahm, Ulrich Certa, Michael Primig, Dario Acampora, Antonio Simeone, Heinrich Reichert Genome Biology 2002 3(4): research0015.1-0015.15 `http://genomebiology.com/2002/3/4/research/0015`
(Рис.1.) \| Normalized average difference (Avg Diff) of one pair of replicate arrays for each experimental condition in a log₁₀ scale (Рис.2.) \| Known transcripts differentially expressed in response to overexpression of otd, grouped according to functional classes (Рис.3.) \| Known transcripts differentially expressed in response to overexpression of Otx2, grouped according to functional classes (Рис.4.) \| Transcripts differentially expressed in response to overexpression of otd and in response to overexpression of human Otx2, grouped according to functional classes (Табл.1.) \| Numbers of transcripts differentially regulated by overexpression of otd or Otx2 (Табл.2.) \| Classification of transcripts differentially expressed in response to Otx2 and otd overexpression (Табл.3.) \| Comparison of change folds between oligonucleotide arrays and RT-PCR	Гомеобоксные гены семейства orthodenticle (otd)/Otx выполняют законсервированную роль в эмбриогенезе головы и головного мозга. Эксперименты по замещению генов показали, что ген Drosophila otd и гены ортологи Otx млекопитающих функционально эквивалентны, избыточная экспрессия любого гена у нулевых мутантов Drosophila или мыши м. устранять дефекты развития головы и головного мозга. Олигонуклеотидные массивы, представляющие 13,400 известных генов Drosophila, использованы для изучения дифференциальной экспрессии генов у мух, у которых или Drosophila otd ген или Otx2 ген человека избыточно экспрессировали. Идентифицировано 287 транскриптов, которые обнаруживали высоко достоверные изменения в уровне экспрессии в ответ на избыточную экспрессию otd и идентифицировано 682 транскриптов, обнаруживающих высоко достоверные изменения в уровнях экспрессии в ответ на избыточную экспрессию Otx2. Среди них, 93 обнаруживали изменения дифференциальной экспрессии в результате повышенной экспрессии или otd, или Otx2, и для 90 из них сравнимые изменения наблюдались при обоих экспериментальных условиях. Предполагается, что эти транскрипты являются общими нижестоящими мишенями гена otd мух и гена Otx2 человека у Drosophila. Это указывает на то, что примерно одна треть otd-регулируемых транскриптов реагирует также на избыточную экспрессию Otx2 гена человека у Drosophila.

Гомеобоксные гены семейства orthodenticle (otd)/Otx выполняют законсервированную роль в эмбриогенезе головы и головного мозга. Эксперименты по замещению генов показали, что ген Drosophila otd и гены ортологи Otx млекопитающих функционально эквивалентны, избыточная экспрессия любого гена у нулевых мутантов Drosophila или мыши м. устранять дефекты развития головы и головного мозга.

Олигонуклеотидные массивы, представляющие 13,400 известных генов Drosophila, использованы для изучения дифференциальной экспрессии генов у мух, у которых или Drosophila otd ген или Otx2 ген человека избыточно экспрессировали. Идентифицировано 287 транскриптов, которые обнаруживали высоко достоверные изменения в уровне экспрессии в ответ на избыточную экспрессию otd и идентифицировано 682 транскриптов, обнаруживающих высоко достоверные изменения в уровнях экспрессии в ответ на избыточную экспрессию Otx2. Среди них, 93 обнаруживали изменения дифференциальной экспрессии в результате повышенной экспрессии или otd, или Otx2, и для 90 из них сравнимые изменения наблюдались при обоих экспериментальных условиях. Предполагается, что эти транскрипты являются общими нижестоящими мишенями гена otd мух и гена Otx2 человека у Drosophila.

Это указывает на то, что примерно одна треть otd-регулируемых транскриптов реагирует также на избыточную экспрессию Otx2 гена человека у Drosophila.