Посещений:
Сверхсемейство Динаминов

THE DYNAMIN SUPERFAMILY: UNIVERSAL MEMBRANE TUBULATION AND FISSION MOLECULES?
Gerrit J. K. Praefcke, Harvey T. McMahon
Nature Reviews Molecular Cell Biology 5, No 2,133 -147 (2004); doi:10.1038/nrm1313




Рис.1.  | Dynamin-superfamily members in animals and plants.


Рис.2.  | Domain structure of the human dynamin superfamily.


Рис.3.  | GTP-binding motifs.


Рис.4.  | Oligomerization of dynamins.


Рис.5.  | Functions of dynamins.


Рис.6.  | GTPase activity and lipid distortion.


Box 1.  | Shibire


Box 5.  | Crystal structures of GTPases

Табл.1 Functions of dynamin-superfamily members

Табл.2 Dynamin-superfamily members in different species*

Табл.3 Comparisons of nucleotide binding and hydrolysis

Links

DATABASES
Flybase: Fzo1 | shibire
Interpro: amphyphysin | dynamin
Saccharomyces genome database: Mgm1 | Vps1
Schizosaccharomyces pombe GeneDB: Msp1
Swiss-Prot: atlastin | DymA | GBP1 | Mammalian dynamin 1 | Mammalian dynamin 2 | Mammalian dynamin 3 | mitofusin | MxA | MxB | OPA1 | Ras
TAIR: ADL2 | ADL6 | ARC5

FURTHER INFORMATION
Dynamin homepage | Dynamin web site | GTPase domain web site | Dynamin assembly | PH domain web site | PRD domain web site | DymA/GBP structures | GTP-binding motifs web site | GTP-binding residues web site | Shibire web site | Oligomerization web site | The OMIM OPA1 entry | More dynamin information | Mx proteins
Dynamins are large GTPases that belong to a protein superfamily that, in eukaryotic cells, includes classical dynamins, dynamin-like proteins, OPA1, Mx proteins, mitofusins and guanylate-binding proteins/atlastins. They are involved in many processes including budding of transport vesicles, division of organelles, cytokinesis and pathogen resistance. With sequenced genomes from Homo sapiens, Drosophila melanogaster, Caenorhabditis elegans, yeast species and Arabidopsis thaliana, we now have a complete picture of the members of the dynamin superfamily from different organisms. Here, we review the superfamily of dynamins and their related proteins, and propose that a common mechanism leading to membrane tubulation and/or fission could encompass their many varied functions.

  • Классические dynamins принадлежат сверхсемейству, которое включает dynamin-подобные белки, optic atrophy 1 (OPA1), mitofusin и Mx белки.
  • На базе гомологии последовательностей, структуры доменов и биологических функций мы выявили членов сверхсемейства от дрожжей и растений до человека.
  • Было предположено, что все члены сверхсемейства являются связанными с мембранами зависящими от олигомеризации GTPases.
  • На базе структурных и биохимических сравнений оказалось возможным тестировать функции всех членов этого свехсемейства с использованием сайт-направленного мутагенеза.
  • В результате высказывается предположение, что все члены dynamin-сверхсемейства являются mechanochemical GTPases, которые функционируют в разделении (scission) или tubulation мембран.
  • Механохимический механизм, описанный для динамина, приложим ко всем известным биологическим функциям сверхсемейства: отделению пузырьков, разделению и слиянию митохондрий, цитокинезу и антивирусной активности.
    • Сайт создан в системе uCoz