Post-Transcriptional Gene Silencing (PTGS)
ПОСТ-ТРАНСКРИПЦИОННОЕ МОЛЧАНИЕ ГЕНОВ
A conserved mechanism for post-transcriptional gene silencing? Eleanor M Maine Genome Biology. 2000 1(3): reviews1018.1-1018.4 http://genomebiology.com/2000/1/3/reviews/1018/
(Рис.1.) \| Schematic alignment of tomato RdRP with proteins known to be involved in PTGS in fungus (QDE-1), nematodes (EGO-1), and plants (SGS2/SDE1) (Табл.1) Conserved proteins involved in PTGS	Post-transcriptional gene silencing (PTGS) является обобщенным термином для различных феноменов, которые репрессируют экспрессию генов путем деградации мРНК. Среди белков, связанных с PTGS наиболее широко распространенными и законсервированными являются те, что гомологичны tomato RNA-directed RNA polymerase (RdRP) : Neurospora QDE-1, C. elegans EGO-1, и у Arabidopsis SGS-2/SDE-1 ( Рис. 1). Большинство моделей PTGS у растений постулирует ступень РНК амплификации, которая сопровождается активностью RdRP, однако установлено, что RdRP фактически участвует в PTGS. Белки, родственные очищенной tomato RdRP , теперь связыают с PTGS у разных организмов. Однако, пока не показано, что эти белки обладают RdRP активностью. Они содержат большие области последовательностей, законсервированные в tomato RdRP, которые м. кодировать RdRP активность, но они кроме того содержат обширные области дивергентных последовательностей (Рис.) . У C. elegans, напр., имеется три rrf (RdRP family) гена помимо ego-1. Также, 6 др RdRP-related найдено в геноме Arabidopsis помимо sgs2/sde1. Обнаружены RdRP-related и у многих др. организмов, включая растения, такие как пшеница и петуния, делящиеся дрожжи Schizosaccharomyces pombe. Некоторые из этих генов м. выполнять др. клеточные функции (метаболизм РНК). Ведь ego-1 был идентифицирован как важный для развития зародышевой линии C. elegans и лишь позднее было установлено, что он участвует в RNAi, возможно белок EGO-1 участвует в обоих этих процессах. Др RdRP-related gene, помимо sgs2/sde1, у Arabidopsis не участвуют в PTGS. RdRP-related гены, по-видимому, отсутствуют, по крайней мере у одного оргнаизма, чувствительного к RNAi: Drosophila melanogaster. Или очень низкая гомология этих генов у Drosophila или RNAi у Drosophilaне нуждается в активности RdRP. Др Arabidopsis sgs ген, sgs3, кодирует новый белок. В целом, sgs3 мутанты ведут себя подобно sgs2 мутантам. Возможно, что SGS3 является критическим для PTGS как и SGS2/SDE1. Родственных SGS3 не найдено у др. организмов, включая те, чей геном полностью секвенирован, C. elegans и Drosophila это согласуется с предположением, что SGS3 является специфичным для растений в плане PTGS. Три семейства белков важны для PTGS. Белки с гомологией RNA-directed RNA polymerases: для подавления Neurospora crassa, для RNAi у нематод Caenorhabditis elegans, и ко-супрессии у Arabidopsis thaliana, указывают на то, что одинаковые законсервированные механизмы оперируют у этих различающихся видов.

Post-transcriptional gene silencing (PTGS) является обобщенным термином для различных феноменов, которые репрессируют экспрессию генов путем деградации мРНК.

Среди белков, связанных с PTGS наиболее широко распространенными и законсервированными являются те, что гомологичны tomato RNA-directed RNA polymerase (RdRP) : Neurospora QDE-1, C. elegans EGO-1, и у Arabidopsis SGS-2/SDE-1 ( Рис. 1).

Большинство моделей PTGS у растений постулирует ступень РНК амплификации, которая сопровождается активностью RdRP, однако установлено, что RdRP фактически участвует в PTGS. Белки, родственные очищенной tomato RdRP , теперь связыают с PTGS у разных организмов. Однако, пока не показано, что эти белки обладают RdRP активностью. Они содержат большие области последовательностей, законсервированные в tomato RdRP, которые м. кодировать RdRP активность, но они кроме того содержат обширные области дивергентных последовательностей (Рис.) .

У C. elegans, напр., имеется три rrf (RdRP family) гена помимо ego-1. Также, 6 др RdRP-related найдено в геноме Arabidopsis помимо sgs2/sde1. Обнаружены RdRP-related и у многих др. организмов, включая растения, такие как пшеница и петуния, делящиеся дрожжи Schizosaccharomyces pombe. Некоторые из этих генов м. выполнять др. клеточные функции (метаболизм РНК). Ведь ego-1 был идентифицирован как важный для развития зародышевой линии C. elegans и лишь позднее было установлено, что он участвует в RNAi, возможно белок EGO-1 участвует в обоих этих процессах. Др RdRP-related gene, помимо sgs2/sde1, у Arabidopsis не участвуют в PTGS.

RdRP-related гены, по-видимому, отсутствуют, по крайней мере у одного оргнаизма, чувствительного к RNAi: Drosophila melanogaster. Или очень низкая гомология этих генов у Drosophila или RNAi у Drosophilaне нуждается в активности RdRP.

Др Arabidopsis sgs ген, sgs3, кодирует новый белок. В целом, sgs3 мутанты ведут себя подобно sgs2 мутантам. Возможно, что SGS3 является критическим для PTGS как и SGS2/SDE1. Родственных SGS3 не найдено у др. организмов, включая те, чей геном полностью секвенирован, C. elegans и Drosophila это согласуется с предположением, что SGS3 является специфичным для растений в плане PTGS.

Три семейства белков важны для PTGS. Белки с гомологией RNA-directed RNA polymerases: для подавления Neurospora crassa, для RNAi у нематод Caenorhabditis elegans, и ко-супрессии у Arabidopsis thaliana, указывают на то, что одинаковые законсервированные механизмы оперируют у этих различающихся видов.

A conserved mechanism for post-transcriptional gene silencing?