В apolipoproteinB (APOB) мРНК деаминирование цитозина на урацил генерирует стоп-кодон, это ведет к синтезу более короткой изоформы белка. Минимальной белковой потребностью для редактирования APOB мРНК является фермент deaminase APOBEC1 и auxiliary factor ACF.
Последовательности мотивов в APOBEC1 и ACF напоминают домены, которые присутствуют в ADAR (adenosine deaminases that act on RNA) семействе энзимов, которые содежат каталитический деаминазный домен и богатый аргинином/глицином домен. Кроме того, ACF имеет предположительно домен связывания двунитчатой РНК, который присутствует у ADAR белков.
Изолированы еще три белка, которые являются гомологами APOBEC1 (AID, APOBEC2 и phorbolin1); однако, они неспособны редактировать APOB мРНК и пока неясно, являются ли они РНК-редактирующими энзимами.
Имеются три высоко гомологичных ADAR энзима у млекопитающих. ADAR1 и ADAR2 м. конвертировать специфические аденозины в иозины (inosines) в пре-мРНК. Большинство транскриптов, которые отредактированы, являются специфическими для ЦНС.
Хотя ADAR1 и ADAR2 обнаруживают перекрывающуюся специфичность in vitro, эксперименты с трансгенными мышами показали, что эти энзимы не м. компенсировать один др. и что каждый из них необходим для редактирования специфических транскриптов.
В некоторых примерах, обнаруживается связь между РНК редактированием и сплайсингом, причем редактирование нуждается в эффективном сплайсинге.
ADARs редактируют транскрипты в 5' и 3' нетранслируемых областях, а также в экзонных и интронных областях. Это создает возможность того, что редактирование РНК выполняет и др. роли в клетках помимо генерации разнообразия кодонов. Напр., оно м. также функционирповать в транспорте или стабильности РНК.
Имеется связь у мышей между неспособностью редактировать glutamine/ arginine сайты в транскриптах glutamate-gated ion channel receptor B и эпилепсией. А гипер-редактирование вирусных транскриптов м.б. ассоциировано с некоторыми фатальными болезнями.
Сайт создан в системе
uCoz
