RNA Nuclear Export
РНК: ЭКСПОРТ из ЯДРА
ORIGINAL RESEARCH PAPER Yang, J. et al. Two closely related human nuclear export factors utilize entirely distinct export pathways. Mol. Cell 8, 397-406 (2001) | PubMed |
Известны два пути ядерного экспорта РНК. Неполностью сплайсированные транскрипты вируса Mason-Pfizer обезьян связывают фактор ядерного экспорта TAP посредством consensus transport element (CTE), и направляются к ядерным порам в результате прямого взаимодействия между TAP и FG-повторами набора nucleoporins. Сходный путь, по-видимому, используется для глобального ядерного экспорта клеточных мРНК, хотя непонятно, как они м. связываться с TAP. Неполностью сплайсированные транскрипты human immunodeficiency virus-1 , с др. стороны, связываются с вирусным белком Rev. Rev, в свою очередь, взаимодействует с exportin Crm1, который направляет транскрипты к разным наборам nucleoporins.
NXF3 является очень близким гомологом TAP, но содержит делецию в С-терминальном nucleoporin-связывающем домене. Yang et al. установили, что NXF3 м.б. UV-перекрестно связан in vivo с эндогенной poly(A+) РНК, которая снует между ядром и цитоплазмой, и м. действовать как фактор экспорта, если искусственно связан с РНК. Неожиданно авт. обнаружили, что вместо прямого взаимодействия с нуклеопоринами подобно TAP, NXF3 взаимодействует с NUP214 и RAB/hRIP - связывающим профилем, характерным для Rev. Подобно Rev, NXF3 связывается с Crm1 посредством leucine-rich nuclear-export сигнала.
Итак, несмотря на 52% идентичность с TAP и одинаковые клеточные функции, NXF3 использует совсем др. молекулярный механизм. Но в то время как TAP повсеместен и возможно участвует в экспорте большинства клеточных РНК, NXF3 в основном экспрессируется в тестисах, указывая тем самым на ткане- и возможно РНК-специфичную функцию.


ORIGINAL RESEARCH PAPER Narry Kim, V. et al. The Y14 protein communicates to the cytoplasm the position of exon-exon junctions. EMBO J. 20, 2062-2068 (2001) | Article | PubMed |
FURTHER READING Kataoka, N. et al. Pre-mRNA splicing imprints mRNA in the nucleus with a novel RNA-binding protein that persists in the cytoplasm. Mol. Cell 6, 673-682 (2000). | PubMed |


Информация о корректности процессинга РНК, доставляемая в цитоплазму

Сплайсинг не только удаляет интроны, но и м. изменять композицию мРНК-белок (mRNP) комплексов, которые важны для сообщения цитоплазме, что произошло с РНК в ядре.
Y14 - белок, который связывает РНК spliceosome-зависимым способом и остается связанным с мРНК в цитоплазме - является подходящим кандидатом для обеспечения такого молекулярного импринта.
Narry Kim, Jeongsik Yong и др. микроинъецировали радиомеченную pre-mRNAs в ооциты и следили за сплайсингом и ядерным экспортом, разделяющим их на ядерную и цитоплазматическую фракции. Путем смешивания этих фракций со специфическими антисмысловыми деоксиолигонуклеотидами и RNase H, мРНК расщеплялась сиквенс-специфическим образом. Были использованы anti-Y14 антитела, чтобы показать, что лишь специфические РНК фрагменты ко-иммунопреципитируются с Y14. Далее было установлено, что Y14 связывается с минимальной областью, расположенной на 20 нуклеотидов выше границ exon-exon соединений после сплайсинга, которые не обладают общими последовательностями.
Характер расщепления с помощью RNase H был идентичен в ядерной и цитоплазматической фракциях, указывая на то, что Y14 остается связанным с мРНК после экспорта из ядра. Др белок Aly/REF, также связывает мРНК в ядре, но не ко-иммунопреципитируется с мРНК в цитоплазме. Значит во время или после ядерного экспорта Aly/REF диссоциирует от мРНК, что согласуется с его ролью белка, курсирующего между ядром и цитоплазмой.
Белок Y14, по-видимому, действует как молекулярный imprint, указывая цитоплазме, где ранее были интроны. Помимо возможной роли в ядерном экспорте или turnover мРНК, локализации или транспорте внутри цитоплазмы, выскащзывается привлекательная теория, что Y14 связвающийся рядом с exon-exon соединениями участвует в nonsense-mediated decay (NMD), процессе, при котором транскрипты, содержащие кодоны преждевременного окончания трансляции, деградируют, позволяя появляться С-терминально укороченным белкам. Во время трансляции нормальной мРНК Y14 (локализованный поверх exon-exon соединений) удаляется. Т.к. кодон терминации у высших эукариот обычно расположен в последнем экзоне мРНК, то к тому времени, когда транслирующая рибосома достигает его, белки Y14 д.б. удалены. Однако, если нонсенс мутация возникает выше финального exon-exon соединения, то оставшиеся нижестоящие Y14 комплексы будут маркировать эти транскрипты для деградации.
Сайт создан в системе uCoz