MECHANISMS OF TRANSCRIPTION-COUPLED DNA REPAIR
Jesper Q. Svejstrup
Nature Reviews Molecular Cell Biology 3, 21 -29 (2002)
Nature Reviews Molecular Cell Biology 3, 21 -29 (2002)
Некоторые типы повреждений нарушающих спираль ДНК блокируют ступень элонгации РНК полимеразы II. Такие блокирующие транскрипцию повреждения обычно репарируются значительно быстрее, чем не-обструктивные повреждения в нетранскрибируемой нити или в геноме в целом. В обзоре рассматривается transcription-coupled repair (TCR) и обсуждается механизм TCR.
(Рис.1.) | Mechanism of nucleotide excision repair and base excision repair.
(Рис.2.) | | Models for the mechanism of transcriptional downregulation in response to DNA damage.
(Рис.3.) | ТеSpeed of repair in an active gene.
(Рис.4.) | Models for transcription-coupled repair.
Measurement of strand-specific DNA repair
(Рис.1.) | Mechanism of nucleotide excision repair and base excision repair.
(Рис.2.) | | Models for the mechanism of transcriptional downregulation in response to DNA damage.
(Рис.3.) | ТеSpeed of repair in an active gene.
(Рис.4.) | Models for transcription-coupled repair.
Measurement of strand-specific DNA repair
Transcription-coupled repair (TCR) - быстрая, предпочтительная репарация транскрибируемой нити активного гена - обнаруживается как у прокариот, так и у эукариот. Этот способ репарации исполняется с помощью nucleotide excision repair (NER) или base excision repair (BER).
Различные факторы позволяют репарационной кухне (machinery) специфически находить транскрибируемую нить и геном в целом, соотв. Хорошо изученные TCR факторы CSA и CSB (дрожжевой Rad26), а также факторы, такие как XPG и TFIIH играют в этом процессе роль.
Клетки, отвечают на ДНК повреждения глобальным подавлением транскрипции. Это м. говорить о нескольких механизмах, работающих сочетанно.
TCR запускается с помощью самой остановившейся полимеразы. В промоторе активного гена, репарация медленная. TCR является чрезвычайно быстрой, наступающей непосредственно ниже сайта инициации транскрипции, по-видимому, из-за того, что TFIIH все еще ассоцирован с полимеразой в этой точке.
Нуклеосомы являются ингибирующими по отношению к NER на нетранслируемой нити (репарация идет медленнее по направлению к сердцевине), тогда как скорость TCR не зависит от присутствия тех же самых нуклеосом.
В транскрибируемой нити, RNA polymerase II (RNAPII) является препятствием для TCR, а Rad26/CSB необходим для того, чтобы преодолеть это препятствие для быстрой репарации.
Несколько моделей предложено для объяснения механизма TCR и все они включают определенного типа устранение RNAPII с места повреждения ДНК.