В сердце мыши апоптоз обнаруживаеися в эндокардиальных подушках и миокарде со стадии Е11.5 и до 3-го дня после рождения. В миокарде желудочков больше апоптических клеток обнаруживается в левом желудочке. Апоптоз присутствует как в трабекуляных, так и папиллярных мышцах. В тракте оттока гибнущие клетки обнаруживаются в эндокардиальных подушках прежде чем они сольются для образования конотрункальной перегородки (Е11.5-Е12.5) и достигают пика во время образования перегородки (Е13.5). В атриовентрикулярных эндокардиальных подушках гибель клеток обнаруживается при слиянии ткани подушек на ст. Е12.5 и 13.5. Установлено, что запрограммированная гибель клеток регулируется факторами ростаBMP ВМР4 и FGF2, in vitro. ВМР4 индуцирует, тогда как FGF2 ингибирует апоптоз. Итак, апоптоз наблюдается в областях, где происходит слияние или ремоделирование ткани.