|
||||||
---|---|---|---|---|---|---|
HOW PROTEINS MOVE LIPIDS И LIPIDS MOVE PROTEINSHein Sprong, Peter van der Sluijs, Gerrit van Meer Nature Reviews Molecular Cell Biology 2, 504-513 (2001) | ||||||
Метаболические функции часто
компартментализованы внутри мембранами
очерченных компартментов в клетках
эукариот. Каждая клеточная мембрана
содержит униклаьный набор белков для
своих специализированных функцийЮ
однако основой строительных блоков
являются липиды (Box 1).
Boxes
Липиды обеспечивают механическую стабильность и имеют сильную тенденцию формирровать закрытые структуры. В то же самое время липиды позволяют уютно устроиться связанным с мембранами белкам в мембранах и гарантируют достаточную гибкость для отпочковывания пузырьков и слияния мембран. Бислой, созданный из прототипов мембранных phospholipid phosphatidylcholine, обладает всеми этими характеристиками в test tube. Однако множество типов липидов необходимо для точного предопределния физических свойств данной мембраны в клетке. Более того, клеточные мембрны содержат много сигнальных липидов, которые передают сигналы путем взаимодействия со специфическими белками (Box 2).
Клетки используют как структурные, так и сигнальные свойства липидов для контроля транспорта мембран, гарантируя тем самым уникальный молекулярный состав каждого связанного со мембранами компартмента вдоль Активность каждого липида
предопределяется его локальной
Links
| Selectivity in lipid transportРазличия в составе липидов между клеточными органеллами не м.б. объяснена только локальным метаблолизмом. Напр., плазматическая мембрана и endoplasmic reticulum (ER) имеют разный состав липидовнесмотря на тот факт, что некоторые липиды плазматических мембран синтезируются в ER, и ипиды постоянно транспортируются между двумя мембранами Помимо Что направляет транспорт липидов? Во-первых,
во время роста мембран фосфолипиды
должны пересекать мембраны ER,
митохондрий и перокисом, а glucosylceramide д.
двигаться поперек мембран Гольджи для
сложного биосинтеза гликолипидов. Во-вторых,
phosphatidylserine и phosphatidylethanolamine д. двигаться в
цитозольный листок плазматической
мембраны для поддержания ее
трансдвуслойной асимметрии. В-третьих,
вдоль экзоцтотического и
эндоцитотичекого путей необходимо
транспортировать sphingolipids, насыщенные
фосфолипиды и холестерол в одном
направлении из ER и Гольджи в
плазматическую мембрану и
эндоцитотические мембраны, тогда как
ненасыщенные фосфлипиды нуждаются в
транспорте в противоположном
направлении. В-четвертых, этот транспорт
в эпителиальных клетках усложняется тем,
что glycosphingolipids и sphingomyelin д.б. больше, чем
phosphatidylcholine вдоль пути, идущего к
апикальной поверхности, чем вдоль
пути, идущему к базолатеральной
поверхности. Наконец, phospholipids (а
иногда и холестерол) д.б.
транспортированы из ER в митохондрии и
пероксисомы, органеллы. которые не
связаны, по-видимому, ведикуляным транспотром.
Energy-independent translocators. Спонтанное
движение amphipathic липидов через липидный
двуслой обычно занимает полчаса (Рис.2), что очень медленно по сравнению с латеральной диффузией, тогда как липиды
проходят расстояние μm в секунду.
Наблюдение, что фосфолипиды и их аналоги
транслоцируются с легкостью через ER
мембрану (от секунд до минут) ведет к
общей концепции, что это движение
обеспечивается белками и первой
ступенью на пути выделения
транслокаторов, была ER flippase, которая не
нуждается в энергии и м. действовать
двунаправлено и не является специфичной
для phosphatidylcholine. Др. кандидатом на роль
субстрата для flippase является вновь
синтезировнный phosphatidylethanolamine, который
транслоцируется в просвет ERза 30 мин. Др.
фосфолипиды, которые д. пересекать ER
мембрану, - это dolichol-phosphoglycolipids и glycosylphosphatidylinositols Сходная энергия-независимая
транслокация происходит в направлении
просвета органелл glycosphingolipid glucosylceramide
в Гольджи. С др. стороны, комплекс
гликолипидов, синтезированных из
glucosylceramide в люминальном листке,
неспособен транслоцироваться обратно в
циозольный листок мембраны. Белок
ответственный за транслокацию glucosylceramide
в просвет Гольджи не выявлен. Даже
жирные кислоты легко пересекают
мембраны с помощью семейства fatty acid
transport proteins (FATPs), которые облегчают
поступление экзогенных жирных кислот
через плазматическую мембрану. Наконец, scramblase
м. отвечать за двунаправленный
транспорт липидов через плазматическую
мембрану во время сигнальных событий и
апоптоза. Как следствие, phosphatidylserine,
который обычно ограничен
цитоплазматическим листком Energy-dependent translocators. Энергия-независимые транслокаторы позволяют липидам
эквилибрировать между листками двуслоя.
Energy-independent translocators allow lipids to equilibrate between the two leaflets of the bilayer. Все движения в одном направлении м. управляться различиями в концетрации,
которые м. поддерживаться или
постоянным синтезом или за счет
уменьшения количества липидов на одной
стороне мембраны. Напротив, до.
транслокаторы м. использовать энергию, в
основном АИФ, чтобы перемещать липиды
против концентрационного градиента и
тем самым сооздавать transbilayer асимметрию
липидов (Box 3). Последний тип обнаруживаетсяT в
основном в плазматичесаких мембранах.
Энергия-зависимая транслокация липидов
впервые показана для аминофосфолипидов phosphatidylserine и phosphatidylethanolamine. Ответственный белок, plasma membrane aminophospholipid translocase, как полагают, обеспечивает
главную активность, которая изменяет
симметричное распределение липидов,
обнаруживаемое в ER, на ассиметричное
расположение липидов в плазматических
мембранах млекопитающих. Она снижает присутсвие
phosphatidylserine на клеточной поверхности и
тем самым общую подвижность липидных
молекул от наружного к цитоплазматическому листку бислоя, это
усиливает латеральное давление в листке
и возможно вызывает эндцитоз. Лучшим
кандидатом на эту роль белка с aminophospholipid translocase активностью является P-type ATФase,
названная ATФase II, но убедительные
доказательства пока отсутствуют.
Предполагается, что действие этой
aminophospholipid flippase противостоит действию,
направленному наружу, энергия-зависимой floppase.
Участие ATP-binding cassette Др ABC транспортеры участвуют в
транспорте стерола. Нарушение оттока
холестерола из плазматических
мембран в экзогенный Proteins involved in monomeric lipid transport. Липиды м обмениваться междв мембранами
и как одиночные молекулы. Т.к. клеточные
мембраны разделены водной фазой, то
липиды должны десорбироваться из
мембраны в жидкую фазу, диффундируя
через нее в проникая в противоположную
мембрану Скорость спонтенного
обмена, которая ограничивается на
ступени десорбции, низка для
большинства мембранных липидов Lipid segregation during vesicular transport. Хотя органеллы вдоль секреторных и
эндоцитотических путей связаны с
двунаправленным везикулярным
транспортом Как клетки поддерживают низкий
уровень холестерола в ER?
Предполагаетсяф. что внутриклеточное
распределение холестерола в
основном управляется за счет ео
выского сродства к sphingolipids. Холестерол
должен постоянно выводиться из ER и Гольджи
непрямо, а с помощью антероградной
сортировки sphingolipids. Вновь
синтезированные сфинголипиды в trans Гольджи и trans-Гольджи network (TGN) м. вытягивать холестерол как из
близко расположенного ER, так и цитозоля.
Холестерол затем участвует в (или
индуцирует) sphingolipid/phosphatidylcholine фазе
отделения (Рис. 3). Холестерол имеет также высокое
сродство к ненасыщенному phosphatidylserine,
указывая тем самым на то, что
цитоозольный листок плазматической
мембраны, который богат ненасыщенными phosphatidylserine и phosphatidylcholine, также содержит высокую концентрацию
холестерола. Итак, disaturated
glycerophospholipids и холестерол м.
отсортировываться в направлении
плазматической мембраны путем
образования латеральных доменов на
цитозольной поверхности Гольджи.
Сегрегация sphingolipid–phosphatidylcholine является, по-видимому, основным свойством липидного сортинга в Гольджи. Однако, сортировка в дистальных частях Гольджи iнаиболее сложна. Несколько путей транспорта пузырьков берут начало в trans Гольджи и TGN. За исклбючением glycerolipids, которые транспортируются в ретроградном направлении, мало известно о том, как липиды на антероградных путях к (апикальной и базолатеральной) клеточной поверхности выбирают секреторные гранулы, эндосомы и др. специализированные компартменты, такие как меланосомы. Такая же сложность наблюдается в системе эндосом. Эксперименты с флюоресцентными зондами показали, сортировка липидов на эндоцитоический путь м. следовать тем же принципам, что и в Гольджи. Напр., сортировка происходит в ранних эндосомах, т.к. большинство жидких зондов направляется к recycling эндосомам, тогда как менее жидкие липиды поступают в поздние эндосомы. Специфичность была обнаружена и для транспорта из эндосом в TGN. Поздние эндосомы обнаруживают дополнительную сложность, т.к. они сортируют субнабор белков и липидов, включая phosphoglycerolipid lysobisphosphatidic acid (LBPA), в пузырьки, которые отшнуровываются в просвет эндосом. Более того, sphingolipids, холестерол и белки м. покидать просвет поздних эндосом, неизвестным пока способом. Он связна с LBPA и некоторыми холестерол-связывающими белками и блокируется многими условиями затрагивающими гидролиз sphingolipid. Physical и biochemical role of lipidsБелки и энергия существенны для
поддержания гетерогенного
распределения липидов в клетке (Box 3) за счет локального метаболизма и селективного транспорта. В то же самое
время, латеральные различия в
композиции липидов используются для
сортировки белков, тогда как нарушения
на уровне сигнальных липидов
использются для регуляции различных
аспектов везикулярного транаспорта
белков; а transbilayer транслокация и
локальные изменения биофизических
свойств липидов использются для
отшнуровки пузырьков.
Sphingolipid domains sort proteins. Мембраны,
которые содержат в основном sphingomyelin, с
или без золестерола, толще тех, что
состоят из phosphatidylcholine и холестерола,
которые в свою очередь толще тех, что
состоять только из phosphatidylcholine. Это
указывает на то, что
sphingolipid–cholesterol домены толще, чем
окружающая часть мембраны (Рис.3). Клетки вероятно используют это
свойство для сортировки мембранных
белков, которые вставляются в
плазматические мембраны из белков Гольджи
за счет длины их трансмембранных
доменов (Рис. 4). Напр., трансмембранные домены
белков плазматических мембран имеют
длину в 20 остатков, тогда как эти же
домены белков в Гольджи имеют длину
только в 15 остатков. Дискретное
увеличение мембраны в толщине позволяет
осуществлять сортировку различных
популяций мембранных белков.
Привлекательной альтернативой является
предположение, что мембраны
постепенно утолщаются вдоль cis–trans
оси Golgi и что распределение мембранных белков в
цистернах Гольджи происходит в
соответствии с длиной их
трансмембранных доменов.
Sphingolipid–cholesterol домены распознаются с
помощью GPI-anchored белков на наружном
листке плазматической мембраны и с
помощью palmitoylated трнасмембрнанных
белкаов. Домены на цитозольной стороне
заселены периферическими белками,
несущими myristoyl (C14:0) и palmitoyl (C16:0)цепи, и не
содержат prenylated белков (Рис. 4). Установлено, что glycosphingolipid glucosylceramide необходим на цитозольной
поверхности для транспорта membrane-spanning
белков от Гольджи в меланосомы.
<вшм>Цитозольный и люминальный домены м.
удерживаться вместе с помощью белков с
достаточно длинным трансмембранным
доменом (Рис. 4), но они м. удерживаться вместе и
просто благодаря свойствам
составляющих их липидов. Домен
колокализации на плазматической
мембране продемострирован для
ацетилированного, холестерол-связывающего
белка caveolin на цитозольной
поверхности Исключение liquid-ordered доменов из
ретроградного транспорта м.б
обусловлено преимущественным
расположением этих ригидных
доменов в плоских частях цистерн с liquid-disordered
доменом фосфолипидов, занимающих
искривленные края, из которых
отшнуровываются ретроградные COPI
пузырьки. Или COPI оболочки специфически
рекрутируются в liquid-disordered части мембран. Ригидные домены
должны затем заканчиваться в TGN остатках
после удаления всего ретроградного
материала и двигаться обычным
способом к плазматической мембране, не
проходя ступень отпочковывания. Чтобы
закрепиться и слиться транспортный
пузырек нуждается в собственном Phosphoinositides in membrane budding и fusion. Первоначально сигнальные функции phosphoinositides приписывались продуктам распада PtdIns(4,5)P2 , генерируемых stimulus-activated phosphoinositide-specific phospholipase C. Diacylglycerol (DAG) активирует протеин киназу C и inositol-1,4,5-trisphosphate (Ins(1,4,5)P3) открывать Ca2+ каналы в ER (Box 2). Недавно было установлено, что клетки используют phosphoinositides все-таки прямо для регуляторных функций. Они образуют мембран-связывающие сайты для растворимых белков и тем самым рекрутируют цитозольные белки в мембраны, стабилизируя белковые комплексы на мемобранах или актививруя мембранные белки. Phosphoinositides участвуют в передаче сигналов, в цитоскелет-мембранных взаимодействиях и в отпочковывании пузырьков от мембран и слиянии пузырьков с мембранами. Специфичность каждого phosphoinositide базируется на его структуре, его локализации и времени его синтеза , модификации и гидролиза. Т.к, в тоже самое время phosphoinositide обнаруживаются в комплексах с различными белками на определенных мембранах, то дополнительные сайты связывания для белков должны присутствовать на их мембранах-мишенях. Phosphoinositides являются продуктами и субстратами для различных киназ, phosphatases, и для phospholipases C и D, которые м. быстро изменять уровень определенного phosphoinositides в специфических регионах мембраны. Регуляция активности этих энзимов создает базу эффективной пространственной и временной регуляции везикулярного транспорта. PtdIns3P обнаруживается в эндосомах ( их
внутренних мембранах) у дрожжей и в
клетках животных. У дрожжей он
существеннен для сортировки белков в
вакуоли. В клетках млекопитающих он
участвует в различных аспектах
транспорта эндосом. PtdIns3P распознается с
помощью FYVE domains широкого круга белков, а его
синтез с помощью 3'-kinase и гидролиз в
эндосомах или вакуолях охарактеризован
детельно. Однако, многие изоформы phosphatidylinositol 3-kinase (PI3K) млекопитающих фосфорилируют также и др.
phosphoinositides.
PtdIns(3,4)P2, PtdIns(4,5)P2 и PtdIns(3,4,5)P3 распознаются pleckstrin homology (PH) domains ряда белков , которые
функционируют в плазматической
оболочке, участвуя в транспорте эндомом
и передаче сигналов. Они рекрутируются,
напр., белками на путях COPI-зависимого
транспорта между Гольджи и ER и в Гольджи Наконец, общий липидный состав Гольджи
м. модулировать транспорт пузырьков.
Связанный с мембраной
phosphoinositol/phosphatidylcholine-связывающий белок,
phosphoinositol/phosphatidylcholine-transfer protein PITP, как полагается, регулирует
взаимодействие между липидным
метаболизмом и секреторной функцией Гольджи
во всем Гольджи DAG пуле. По неизвестным причинам, каждый
липид, по-видимому, существенен для
нормального везикулярного транспорта.
Curvature in vesicle budding. Для
отшнуровки пузырька необходимо
искривление мембраны и создание
липидного дисбаланса поперек бислоя.
На уровне headgroups, наружный листок
пузырька диаметром 60-nm содержит в 1.5раза
большее число липидных молекул, чем
внутренний листок. he number of lipid molecules of the
inner leaflet. Это м. создавать проблему для ER и
возможно для cis Гольджи мембран,
где липиды м. свободно пересекать бислой.
В этих гибких мембранах сборка COP
оболочек, по-видимому, важна для
отпочковывания. Однако, отличная
ситуация в мембранах, в которых липиды
не подвергаются свободному 'flip-flop',
таких как плазматическая мембрана, TGN или
эндосомы. Предполагается, что ATФ-consuming aminophospholipid
транслокатор, 'flippase', управляет
отпочковыванием пузырьков от
плазматической мембраны путем
расширения области цитоплазмаического
листка при уменьшении облсасти
нецитоплазматического листка бислоя.
Coats м., следовательно, контролировать
искривление и локализацию листка.
Эндоцитоз ингибируется во время митоза,
по-видимому, в результате
инактивации необходимых белков,
повышения натяжения мембран. Снижение
натяжения, которое регулируется
взаимодействиями между цитоскелетом и
плазматической мембраной через PtdIns(4,5)P2
на цитозольной стороне. восстанавливает
эндоцитоз и phosphoinositide rрегуляторную
систему.
Отдельно от положительного изгибания
формирующейся почки, крайнее ,
негативное искривление м. возникать в
месте слияния (добавления) мембран (Рис. 5). Коническая форма некоторых липидов делает их идеально приспособленными
для монтажа в области сужения.
Отпочковывание различных типов
транспортных пузырьков использует
конверсию инвертированных конусов,
lysophosphatidic acid (LPA), у конусы, phosphatidic acid,с
помощью acyltransferase endophilin.
Phosphatidic acid гидролизуется с помощью phosphohydrolase
в DAG , имеющего даже более коническую
форму. Образование LPA использует
действие phospholipases D и A2.
Phospholipase D активируется во рвемя
отшнуровки пузырьков. Активность phospholipase A2
, по-видимому, необходима для
tubulation мембран Гольджи, которые м. иметь
сходную функцию для сортировки белков,
что и перемещение пузырьков между
разными цистернами хранилищ Гольджи (vesicle
percolation).
В поздних эндосомах почки пузырьков
образуются как в направлении цитозоля,
так и в направлении просвета эндосом.
Управлющие силы, лежащие в основе
формирования почек в просвет и tubulation,
неизвестны, но это событие связано с
сортировкой мембран и нуждается в LBPA на
люминальной поверхности. Почкование в
двух направлениях м.м. резделено во
времени: на стадии созревания эндосом
почкование в направлении цитозоля мб.
блокировано, что делает возможным
почкование в противоположном
направлении; на позддней стадии
почкование пересматривается.
Накопление липидов лизосомами при
некоторых болезнях м.б. связано с
обструкцией этого последнего
перехода.
|