Наш геном состоит на 99% из ДНК, которая не кодирует какой-либо белок. Она часто описывается как "Темная Материя" генома, эта "некодирующая ДНК" считается очень важной для понимания всех аспектов биологии человека, включая болезни и эволюцию.

В Johnson лаборатории недавно был создан инструмент, базирующийся на технологии CRISPR-Cas9, названный "DECKO," который может быть использован для делеции любых желаемых кусочков некодирующей ДНК. Уникальным преимуществом DECKO является то, что он использует две индивидуальные sgRNAs, действующие подобно двум "молекулярным ножницам", которые вырезают кусочек ДНК. Такой подход широко используется, но не как програмное обеспечение, доступное для конструирования пар sgRNAs, которые необходимы, при проектировани делеционных инструментов, которое экономит время.

Исследователи, под руководством Carlos Pulido, создали програмное обеспечение снабжающее информацией, названное CRISPETa, гибкое решение для обеспечения CRISPR делеционных экспериментов. Исследователи сообщают CRISPETa, какой регион они желают делетировать и програмное обеспечение в ответ предлагает набор оптимизированных пар sgRNAs, которые могут быть использованы непосредственно экспериментаторами. Одним из ключевых свойств является то, что оно может обеспечивать создаение проектируемых пар в высоком масштабе, исходя из нужд будущего эксперимента.

Исследователи показали, CRISPETa инструмент эффективно делетирует желательные для них мишени в клетках человека. Наиболее важно то, что эти регионы, которые дают молекулы РНК, дают такие РНК с соотв. делецией.

Помимо сегодняшнего использования в качестве базового исследовательского инструмента, CRISPR может быть также использована в будущем как мощное терапевтическое средство, для устранения мутаций, вызывающих болезни.

CRISPETa разработан для использования не экспертами, так что он вполне пригоден для исследований ученых из вполне скромных экспериментальных лабораторий. Такие пользователи смогут, напр., делетировать подозреваемый функциональный регион некодирующей ДНК и протестировать последствия на клеточном и молекулярном уровне. Это програмное обеспечение окажется также потенциально ценным для групп, намеревающихся использовать CRISPR делеции с терапевтическими целями, напр., делетируя регион некодирующей ДНК, который подозревается как причина болезненного состояния.