Посещений:
ПЕРВИЧНЫЕ РЕСНИЧКИ



Роль Zfp423 в передаче сигналов Shh

Zfp423 Regulates Sonic Hedgehog Signaling via Primary Cilium Function.
Hong C-J, Hamilton BA
PLoS Genet (2016), 12(10): e1006357. doi:10.1371/journal.pgen.1006357

Zfp423 encodes a 30-zinc finger transcription factor that intersects several canonical signaling pathways. Zfp423 mutations result in ciliopathy-related phenotypes, including agenesis of the cerebellar vermis in mice and Joubert syndrome (JBTS19) and nephronophthisis (NPHP14) in humans. Unlike most ciliopathy genes, Zfp423 encodes a nuclear protein and its developmental expression is complex, leading to alternative proposals for cellular mechanisms. Here we show that Zfp423 is expressed by cerebellar granule cell precursors, that loss of Zfp423 in these precursors leads to cell-intrinsic reduction in proliferation, loss of response to Shh, and primary cilia abnormalities that include diminished frequency of both Smoothened and IFT88 localization. Loss of Zfp423 alters expression of several genes encoding key cilium components, including increased expression of Tulp3. Tulp3 is a direct binding target of Zfp423 and reducing the overexpression of Tulp3 in Zfp423-deficient cells suppresses Smoothened translocation defects. These results define Zfp423 deficiency as a bona fide ciliopathy, acting upstream of Shh signaling, and indicate a mechanism intrinsic to granule cell precursors for the resulting cerebellar hypoplasia.


Рисунки к статье


Мозжечковые granule cell precursors (GCPs) являются важной моделью развития нейронов и местом клинически важных онтогенетических аномалий. Пролиферация GCP является очень чувствительной к происходящему из клеток Пуркинье sonic hedgehog (Shh) в широком динамическом диапазоне [1-3]. Повышение или снижение передачи сигналов Shh может существенно менять динамику GCP, чтобы преобразовать мозжечок [4]. Соотв., независимая от лигандов передача сигналов Shh пути является распространенным признаком медуллобластомы, наиболее распространенной опухоли головного мозга у детей [5-7], и путь передачи сигналов Shh является предметом разработки терапевтического вмешательства [8-10]. Передача сигналов Shh осуществляется первичными ресничками, куда многие компоненты доставляются для создания сфокусированного сигнального модуля [11-14], она необходима для экспансии GCP [15]. Как передача сигналов Shh интегрируется с передачей сигналов, влияющих на пролиферацию, миграцию и дифференцировку GCP изучено недостаточно.
Посредством альтернативных взаимодействий со многими путями передачи сигналов и транскрипции, Zfp423 (и его человеческий ортолог, ZNF423) прекрасно расположен, чтобы интегрировать внеклеточные сигналы в когерентную онтогенетическую реакцию. Zfp423 впервые был описан (как Roaz) благодаря ингибирующему взаимодействию с EBF (Olf1) helix-loop-helix транскрипционными факторами [16]. Zfp423 является также коактиватором для активируемых с помощью BMP SMADs [17, 18], для рецепторов ретиноевой кислоты [19, 20] и Notch внутриклеточного домена [21]. Интересно, что активности Zfp423 на EBF и лигандами-активируемые факторы, по-видимому, оказывают взаимно ингибирующий эффект, подтверждая его функцию интеграции в сеть. ZNF423 также, по-видимому, является мишенью при некоторых раковых опухолях и обнаруживает низкую экспрессию в нейробластоме [20] или эпигенетическое замалчивание с помощью Polycomb repressive complex 2 в глиоме [22] , что ассоциирует с плохим прогнозом.
Zfp423-дефицитные мыши обнаруживают разнообразные онтогенетические дефекты, включая полностью проявляющуюся потерю червячка мозжечка [23-25] и изменчивую потерю полушарий мозжечка, зависимую от генов модификаторов и др. факторов [26]. Zfp423-дефицитные животные дефектны также в отношении развития переднего мозга - включая гипоплазию гиппокампа и несовершенное мозолистое тело [23, 24], и обонятельный нейрогенез [27], и индукцию жировой ткани [28, 29].
Hildebrandt с сотр. идентифицировали мутации в ZNF423 человека среди пациентов с диагнозом цилиопатия [30]. Пациенты из всех трех описанных ZNF423 семей обнаруживают гипоплазию червячка мозжечка или Joubert Syndrome, в то же время два имели также nephronophthisis и др. клинические проявления. Были выявлены эффекты мутаций пациентов на пролиферацию и реакцию на повреждения ДНК, представляющие новый патогенетический механизм проявлений цилиопатий, но не были исследованы структура или функции ресничек. Так воспроизводят ли мутации ZNF423 и Zfp423 фенокопии цилиопатий, действуя на нижестоящие события передачи сигналов, или представляют bona fide цилиопатии, затрагивающие функцию в ресничках вышестоящей передачи сигналов.
Полученные нами результаты проливают новый свет на Zfp423-зависимые механизмы. Предложены совершенно отличные модели для гипоплазии мозжечка у Zfp423 мышей и человека. Базируясь на экспрессии Zfp423 gene-trap в постнатальных клетках Пуркинье, одна группа предложила клеточно неавтономный механизм, обусловленный снижением продукции Shh [25], т.е. обнаруживаются в некоторых клетках Пуркинье избирательные мутации [31]. Гибридизация In situ , однако, выявила экспрессию Zfp423 как в вентрикулярной зоне, так и в external germinal layer (EGL) развивающегося мозжечка, что целиком согласуется с GCP-intrinsic механизмом [23, 24]. Мы показали, что GCPs экспрессируют Zfp423 белок in situ и в первичной культуре, потерявшей Zfp423 блокирование их способности отвечать на Shh, изменение морфологии ресничек, снижение транслокации Smoothened и увеличение экспрессии некоторых генов. связанных с ресничками. включая Tulp3. Устранение избыточной экспрессии Tulp3 восстанавливает частоту транслокаций Smoothened. Наши результаты демонстрируют прирожденную для GCP роль Zfp423, стоящего выше передачи сигналов Shh и подтверждают избыточную экспрессию генов мишеней, таких как Tulp3 как мишеней для улучшения функции клеток, дефицитных по ZNF423/Zfp423.

Discussion


Наша работа предоставляет на головном мозге мышей и культурах клеток человека, впервые механистическую связь между фенотипами цилиопатии. вызываемой ZNF423/Zfp423, и функцией первичных ресничек. Поскольку тяжесть фенотипа и диапазон вовлечение органов варьируют, но гипоплазия червячка мозжечка составляет уникальный постоянный признак у описанных трех ZNF423 дефицитных пациентов [30] и при пяти Zfp423 мутациях мыши на разных линейных генетических фонах [23-26]. Предыдущая работа на мышах продемонстрировала потерю пролиферации предшественников [23], хотя место действия осталось невыясненным, то ли это внутренне присущие клеткам (potentially cell-autonomous) механизмы в клоне гранулярных клеток или клеточно неавтономные механизмы, обусловленные экспрессией Shh в клетках Пуркинье. Анализ модельных клеточных культур, ранее обнаруживших дефектные реакции на повреждения ДНК в качестве нового клеточного механизма действия мутаций ZNF423 у пациентов [30], но не были определены эффекты на первичные реснички и остался открытым вопрос, действительно ли ZNF423 может также действовать как вышестоящий в ресничке, чтобы регулировать её функцию, или как нижестоящий, смягающий её эффекты. Результаты, полученные здесь, демонстрируют роль для человеческого и мышиного гомологов функции в ресничке и внутренне присущего свойства предшественникам гранулярных клеток, действующих, по крайней мере, частично путем усиления экспрессии TULP3.
4 линии доказательств указывают, что Zfp423 является настоящим геном цилиопатии. Во-первых, рецессивная поте6ря функции и потенциально доминантные мутации дают фенотипы спектра цилиопатий, включая гипоплазию червячка мозжечка у мышей и людей, nephronophthisis у людей и разные степени др. последствий, которые могут отражать силу аллелей или генетические, средовые или стохастические модификаторы [23, 24, 26, 30]. Во-вторых, наш анализ изображений показал, что поскольку Zfp423-нулевые животные первоначально продуцируют реснички с нормальной частотой, потеря Zfp423 приводит к аномальному распределению морфологических отклонений. На изображениях с двумя маркерными белками реснички на мутантных клетках GCPs, в виде групп, выглядят более широкими вблизи основания (Figs 3 and 4), где располагаются некоторые белки Joubert Syndrome и nephronophthisis [45-48], и стремятся быть более длинными. Структуры в основании действуют, чтобы регулировать доставку сигнальных гурзов в и из реснички [49, 50]. Это поразительное отличие морфологии ресничек может быть объяснено измененным временным профилем динамичных состояний, т.к. диапазоны измерений в основном перекрываются между генотипами, несмотря на имеющиеся различия в распределении. Хотя возможно, что некоторая часть сдвига в Ac-αTub-базирующихся измерений может быть обусловлена изменениями в локальных концентрациях этой модификации у мышей, нокдаун ZNF423 у DAOY модели не столь драматически изменяет общий уровень Ac-αTub (Fig 5C). Кроме того, любое изменение локального уровня Ac-αTub может само по себе указывать на функциональное изменение динамики ресничек, т.к. ацетилирование стабилизирует микротрубочки аксонемы, а деацетилирование необходимо для разборки [51, 52]. В-третьих, передача сигналов посредством первичной реснички функционально дефектна после потери активности Zfp423 . Zfp423-истощенные первичные GCPs оказываются нечувствительными к экзогенному Shh (Fig 2). ZNF423-истощенные клетки DAOY медуллобластомы постоянно оказываются дефицитными в отношении транслокации в ресничку Smoothened (Fig 5) и IFT88 (Fig 6), которые необходимы для нормального процессинга передачи сигналов [12, 13, 53-55] и особенно для экспансии GCPs [15]. Снижение транслокации IFT88 также наблюдается в мышиных GCPs in situ (Fig 6), хотя наблюдаемая нами повышенная длина противоречит отсутствию или сильному укорочению ресничек, наблюдаемому в Ift88 дефицитных клетках [56, 57]. В-четвертых, мы нашли изменения в уровнях экспрессии ключевых компонентов ресничек, которое характерно для ZNF423-knockdown DAOY клеток и Zfp423-мутантных GCPs и указывает на нарушения передачи сигналов, по крайней мере, одного из тех, которые функционально важны и, скорее всего, обусловлены непосредственной регуляцией. TULP3 лучше всего подтвержденная мишень для Zfp423 в нашем анализе. TULP3 является ингибитором передачи сигналов Shh и потеря Tulp3 у мышей приводит к усилению передачи сигналов Shh [58-60]. На клеточном уровне, TULP3 регулирует поставки в реснички как с помощью ретроградного транспорта, так и с помощью проникновения в ресничку посредством её взаимодействия с IFT-A [61, 62]. ChIP эксперименты с первичными GCPs с двумя разными антителами против Zfp423 показали, достоверное обогащение сайта Tulp3 интрона 1, которое было предсказано ранее на модели культуры P19 клеток [32]. Функциональное устранение TULP3, вызываемое с помощью истощения ZNF423 в DAOY модели, в основном устраняет дефекты транслокации Smoothened в клетках с нокдауном ZNF423 (Fig 9).
Хотя Zfp423 необходим для митогенной реакции на Shh ex vivo, остаточная пролиферация в клетках с нокдауном и в EGL нулевых животных отличается от средней линии, показывая, что Zfp423 не является строго необходимым для всех митогенных реакций в GCPs. Более того, DAOY модель обнаруживает остаточную транслокацию IFT88 и Smoothened-EGFP в клетках с нокдауном. Одной из возможностей может быть то, что митогенный ответ GCPs является более чувствительным к потере Zfp423 при культивировании ex vivo, чем когда GCPs in situ или трансформированы в DAOY модели - поэтому неразумно ожидать, что внешнесредовые факторы и присущие клеткам различия будут иметь отношение к становлению клеточной линии и смогут усиливать пролиферативную реакцию. Напротив, (или дополнительно), может оказаться, что IFT-независимая диффузия Smoothened в ресничку [50] будет создавать умеренный уровень передачи сигналов, которая будет насыщенной на низких уровнях Shh, чем путь, зависимый от транслокации, что подтверждается различиями в чувствительности к Smoothened-EGFP и IFT88 локализации в ресничках DAOY клеток (Fig 6E).
Избыточная экспрессия Tulp3 может оказаться неожиданным кандидатом на роль ограничения транслокации Smoothened. Хотя Tulp3 противодействует передаче сигналов Shh, потеря Tulp3 не влияет на поставку Smoothened [61, 63]. Скорее Tulp3, как полагают, подавляет передачу сигналов Shh путем локализации Gpr161, чья активация повышает уровень cAMP, чтобы способствовать расщеплению Gli белков в их репрессорные формы [62]. Однако, этот хорошо задокументированный механизм базируется на на потере функции Tulp3 и он может обладать не только ингибирующим эффектом , когда Tulp3 экспрессируется существенно выше нормального урвоня, как ву случае ZNF423/Zfp423 дефицитных клеток (Figs 7 and 9). Избыток Tulp3 д. в принципе рекрутировать дополнительные ингибирующие молекулы в ресничку или титруют компоненты, ограничивающие поставку Smoothened, такие как Gprasp2 или Pifo [64, 65]. Также возможно, что избыток Tulp3 затрагивает состояние клеток способом, который косвенно влияет на транслокацию IFT88 и Smoothened или на концентрацию в первичной ресничке. Необходима проверка таких гипотез, которые не являются взаимно исключающими. Кроме того, поскольку Zfp423 вносит вклад в регуляцию нескольких генов, связанных с цилиопатиями, то полная степень молекулярных последствий, скорее всего, более сложна, а взаимодействия между аномально регулируемыми компонентами могут быть необходимы, чтобы полностью понять молекулярные механизмы в основе анатомических фенотипов у пациентов и модельных мышей.
Наши результаты обнаруживают определенное сходство с теми, что наблюдаются с цилиогенными транскрипционными факторами семейства RFX и Foxj1 [66, 67], но имеются и важные отличия. RFX белки крайне консервативные регуляторы, активирующие стержневые компоненты для образования подвижных ресничек, а потеря активности RFX приводит к потере или укорочению ресничек [68-72]. Foxj1 является геном мишенью для Shh, который также активирует компоненты, которые делают возможным формирование подвижных ресничек и которые достаточны для управления их образования, с дополнительными эффектами на первичные реснички при некоторых условиях [73-76]. Восстановление экспрессии генов мишеней частично ослабляет клеточные фенотипические отклонения [77]. Напротив, ZNF423 пациенты и Zfp423 мышиные модели имеют фенотипы более типичные для дефектов неподвижных ресничек, особенно при гипоплазии червячка мозжечка [23, 24, 30] и Zfp423 не обязателен для появления ресничек. Zfp423 необходим для эффективной передачи сигналов в ресничках клеток мозжечка и в клеточных моделях. Zfp423, по-видимому, модулирует компоненты, часто как негативный регулятор, и мы установили улучшение одного кле6точного фенотипа при ослаблении избыточной экспрессии лучше усего описанной мишени репрессии, TULP3, в DAOY клеточной модели.
Полученные результаты демонстрируют механизм передачи сигналов, комплементарный реакции на повреждения ДНК (DDR) Ю продемонстрированной Chaki et al. [30], для фенотипических отклонений нейронального развития у ZNF423-дефицитных пациентов и мышей, мутантных по ортологу Zfp423. Кроме того, представлена структурная и функциональная база для снижения передачи сигналов Shh в клетках гранулярных предшественников, наши результаты подчеркивают, что потеря Zfp423 репрессивной функции на Tulp3 и потенциально на др. гены является ключевым компонентом фенотипического отклонения.