Посещений:
Evgenia Ntini, Annita Louloupi, Julia Liz, et al. Long ncRNA A-ROD activates its target gene DKK1 at its release from chromatin. Nature Communications, 2018; 9 (1) DOI:10.1038/s41467-018-04100-3 | |
---|---|
|
A-ROD enhances DKK1 transcription with a quasi-cis mechanism. Model for A-ROD-mediated recruitment of EBP1 and regulation of DKK1 transcription at release from the chromatin-associated template, and within the physical proximity of the pre-established chromosomal interaction Клетки нашего тела, как известно, подразделяются на несколько компартментов со специализированными функциями. ДНК содержит нашу генетическую информацию и располагается в ядре клетки, где контролируется продукция генами. Ядро подразделяется на растворимую нуклеоплазму и нерастворимый хроматин. мРНК кодирует белки, а процесс трансляции происходит в цитоплазме. С др. стороны, длинные некодирующие РНК преимущественно работают в ядре, где они являются важными компонентами, контролирующими экспрессию генов.
Внимание коллектива исследоватей было привлечено к длинным не-кодирующим РНК, которые могут усиливать продукцию специфических мРНК, а значит и белков в клетках рака груди. Они показали, что экспрессия длинных не-кодирующих РНК может приводить к исключительно высоким уровням экспрессии специфических генов. Они установили не только где, но и сколько определенных длинных не-кодирующих РНК продуцируются, но и также, как длинные не-кодирующие РНК динамически распределяются внутри клеток. Авт. показали, что длинная не-кодирующая РНК, наз. A-ROD (Activating Regulator Of DKK1 expression) является единственной функциональной в тот момент, когда продукт высвобождается с хроматина в нуклеоплазму. Во время этой переходной фазы она может привлекать транскрипционные факторы -- белки, контролирующие синтез с др. генов -- на специфические сайты ДНК, чтобы усилить экспрессию гена. После полного высвобождения из хроматина, A-ROD оказывается больше неактивной как усиливающая длинная не-кодирующая РНК. A-ROD действует как лассо, которое может выбрасываться с ДНК, чтобы отлавливать белки.
Стратегии по целенаправленному воздействию на экспрессию РНК в цитоплазме, нуклеоплазме и хроматине сильно отличаются. Исследователи полагают, что эти различия могут быть использованы, чтобы оптимизировать подходы по целенаправленному воздействию на РНК-зависимые процессы при болезнях. Следующей целью является идентификация большего количества не-кодирующих РНК с функцией лассо, чтобы полностью понять и потенциал и пригодность для регуляции экспрессии генов.
|