Недавно в PNAS, Jorgenson et al. (1) представили крупномасштабное genome-wide association study (GWAS), чтобы идентифицировать генетические варианты, ассоциированные с эректильной дисфункцией. Jorgenson et al. (1) анализировали эректильную дисфункцию с помощью GWAS базы данных от 36649 мужчин разной этнической принадлежности в Kaiser Permanente Northern California Genetic Epidemiology Research в когорте взрослых здоровых и старых мужчин. Они идентифицировали генетический вариант rs17185536 на хромосоме 6 вблизи гена single-minded family basic helix-loop-helix transcription factor 1 (SIM1) , который достоверно ассоциировал с риском эректильной дисфункции (с вероятностью успешного исхода для T аллеля = 1.26, P = 3.40E-25) (1). Далее Jorgenson et al. (1) анализировали эректильную дисфункцию по базе данных GWAS у 222358 мужчин из UK Biobank, и повторно обнаружили эту ассоциацию (с вероятностью успешного исхода для T аллеля = 1.25, P = 6.80E-14). Было установлено, что у мышей Sim1 экспрессируется в развивающихся почках и ЦНС (2-4). Jorgenson et al. (1) далее тестировали энхансерную активность rs17185536 risk и reference аллеля в эмбриональных почках людей в 293T клетках (1). Они установили, что по сравнению с пустым вектором, rs17185536-T (risk) аллель обладает достоверной энхансерной активностью, а rs17185536-C (reference) аллель - нет (1). Jorgenson et al. (1) пришли к выводу, что rs17185536-T аллель или другие аллели, ассоциированные с эректильной дисфункцией в этом регионе могут регулировать экспрессию SIM1. Однако, Jorgenson et al. (1) не смогли непосредственно оценить ассоциацию rs17185536 с экспрессией SIM1. Пока остается неясной ассоциация rs17185536 варианта с экспрессией SIM1. Здесь мы оценивали ассоциацию между rs17185536 и экспрессией SIM1, используя две базы данных по экспрессии локусов количественных признаков (eQTLs). Первая eQTLs база данных из NephQTL базы данных, включала когорты human kidney tissues glomerulus (n = 136) и tubulointerstitium (n = 166) при Nephrotic Syndrome Study Network (5). MatrixEQTL была использована для осуществления анализа eQTLs в почечных клубочках и интерстициуме канальцев (5). Вторая база данных eQTLs из Genotype-Tissue Expression (GTEx) Project (version 7), которая включала 11688 выборок из 53 тканей и 714 доноров (6). В GTEx, анализ линейной регрессии был использован для анализа eQTLs с помощью stQTL, исходя из additive модели и коррекции по нескольким критическим ковариансам, включая top 3 генотипирование основных компонентов; генотипирования платформ; 15, 30, 45 и 60 вероятностными подсчетами экспрессии остаточных факторов; и для мужского пола (6-9). Уровень достоверности определялся как P < 0.05. В NephQTL базе данных результаты не показали достоверной ассоциации между экспрессией rs17185536 и SIM1 в гломерулярной такни почек человека и в tubulointerstitium (Table 1). В GTEx (version 7), rs17185536 оказался доступен только в 10 из 53 тканей. Результаты показали, что аллель rs17185536-T может достоверно регулировать повышенную экспрессию SIM1 в клетках трансформированных фибробластов (P = 1.61E-02) и в гипоталямусе головного мозга человека (P = 6.69E-04) (Table 1). Важно, что ассоциация между rs17185536 и SIM1 экспрессией проходит множественные тестируемые коррекционные пороги из 0.05/12 = 4.17E-03. Итак, наши данные подчеркнули ассоциацию между rs17185536 и SIM1 экспрессией в гипоталамусе головного мозга человека и могут представлять важную информацию о роли rs17185536 в эректильной дисфункции.