Polycomb Repressive Complex 2 (PRC2) катализирует метилирование гистона H3 Lys27, и выполняет критические роли во время развития и при болезнях многочисленных систем. Его каталитическая субъединица EZH2 представляет собой ядерную мишень для длинных не-кодирующих РНК (lncRNAs) , которые представляют собой новый класс эпигенетических регуляторов и участвуют в разных клеточных процессах. LncRNAs характеризуются высокой ткане-специфичностью; однако, мало известно о тканевом профиле взаимодействующих с EZH2 lncRNAs.

Был осуществлен глобальный скрининг связывающих EZH2 lncRNAs в тканях, включая головной мозг, легкие, сердце, печень, почки, кишечник, селезенку, семенники, мышцы и кровь с помощью комбинирования РНК иммуно-преципитации и РНК секвенирования. Было идентифицировано 1328 EZH2-связывающих lncRNAs, среди которых 470 были общими, по крайней мере, для двух тканей, тогда как 858 были обнаружены только в одной из тканей. Идентифицирован РНК мотив со специфической вторичной структурой, обнаруживаемый в ряде lncRNAs, хотя и не во всех связывающих EZH2 lncRNAs. Эти EZH2-связывающие lncRNAs были разбиты на 4 категории, включая межгенные lncRNA, анти-смысловиые lncRNA, родственные интронам lncRNA и родственные промоторам lncRNA, подтвердили разнообразие регуляций с помощью цис- и транс-механизмов. Родственная промоторам lncRNA Hnf1aos1 соединяется с EZH2 специфически в печени, свойство сходное с его спаривающимся кодирующим геном Hnf1a, подтвердив важность нашего исследования. Помимо хорошо известных EZH2-соединяющихся lncRNAs, таких как Kcnq1ot1, Gas5, Meg3, Hotair и Malat1, большинство lncRNAs было впервые описано, как ассоциированные с EZH2.

Итак, было установлено, что EZH2-взаимодействующие lncRNAs существуют в разных тканях и была подтверждена критическая роль lncRNAs во время клеточной дифференцировки и созревания.