Investigation of LINC00493/SMIM26 Gene Suggests Its Dual Functioning at mRNA and Protein Level

by Daria Konina 1,2,*,Peter Sparber 2OrcID,Iuliia Viakhireva 2,Alexandra Filatova 2,*OrcID andMikhail Skoblov 2OrcID 1

Moscow Institute of Physics and Technology, Phystech School of Biological and Medical Physics, 141701 Dolgoprudny, Russia

2 Research Centre of Medical Genetics, Laboratory of Functional Genomics, 115478 Moscow, Russia

* Authors to whom correspondence should be addressed. Academic Editor: Luca Agnelli

Int. J. Mol. Sci. 2021, 22(16), 8477; https://doi.org/10.3390/ijms22168477 Received: 19 July 2021 / Revised: 4 August 2021 / Accepted: 5 August 2021 / Published: 6 August 2021 (This article belongs to the Special Issue Non-coding RNA Biogenesis and Function 2021)? View Full-Text Download PDF Browse Figures Citation Export

Количество генов для длинных не кодирующих РНК (lncRNA) сравнимо с белок кодирующими генами, однако, лишь небольшое количество lncRNAs описаны как функциональные. Ранее было установлено, что lncRNAs могут участвовать во многих ключевых клеточных процессах, включая регуляцию экспрессии генов и пост-транскрипционных уровней. Гены lncRNA могут содержать небольшую открытую рамку считывания (sORFs), а недавние исследования продемонстрировали, что некоторые возникающие в результате белки могут играть важную биологическую роль. В данной работе мы исследовали широко экспрессирующуюся lncRNA LINC00493. Мы установили структуру транскрипта LINC00493, его клеточную локализацию и влияние на физиологию клетки. Наши данные продемонстрировали, что LINC00493 оказывает влияние жизнеспособность клеток специфически в зависимости от типа клеток. Более того, недавно было показано, что LINC00493 имеет sORF, которая транслируется в небольшой белок SMIM26. Результаты нашего нокаута и избыточной экспрессии подтвердили, что как LINC00493/SMIM26 транскрипт, так и белок влияют на жизнеспособность клеток, но противопложными способами. View Full-Text Figure 3

М. Скоблов: Помимо белок-кодирующих генов, в геноме человека есть ещё огромное количество белок-некодирующих генов. И они пока ещё очень мало изучены, хотя для многих показана их функциональная значимость в различных молекулярных процессах, и для некоторых даже изучена роль в патогенезе наследственных заболеваний (мы кстати недавно написали хороший обзор на эту тему - doi: 10.1186/s12920-019-0487-6).
У нас в лаборатории мы тоже изучаем длинные некодирующие РНК...