Peptide nucleic acids (PNAs), по-видимому, более пригодны для целей гибридизации, чем МО олигомеры благодаря своему более высокому сродству по отношениюю к ДНК и РНК, более строгой дискриминации mismatch и резистентности к протеазам и нуклеазам, хотя PNAs менее растворимы, чем МО и не дают фенотипов нокдауна генов у эмбрионов рыбок данио.
Высоко расстворимыый аналог PNA, состоящий из alternating
trans-4-hydroxyl-L-proline PNA и phosponate PNA (HypNA-pPNA) (Рис. 1 D), был синтезирован и охарактеризован. Так, гомоолигомеры, негатиыно заряженные HypNA-pPNA, обнаруживают выдающиеся гибридизационные свойства в отношениии ДНК и РНК в растворах, сохраняя при этом mismatch дискриминацию и резистентность к нуклеазам/протеазам.
Сравнивали гибридизационную силу, эффективность нокдауна и mismatch дискриминацию МО олигонуклеотдов с HypNA-pPNA олигомерами. Было установлено, что HypNA-pPNA 18-меры гибидизируются с 25-мерной РНК столь же сильно, как и 25-мерыне МО и что два HypNA-pPNA mismatches снижают температуру плавления РНК до 18оС. У эмбрионов рыбок данио 18-мерные HypNA-pPNA обладают потенциалом, сравнимым с 25-мерынми МО как агенты нокдауна в отношении chordin, ntl и uroD с более высокой mismatch stringency. Более того что специфический 18-мернай HypNA-pPNA даёт dharma (известный также как bozozok)-/- фенотип, которого не даёт и 25-мерный МО.
Сайт создан в системе
uCoz