Shopland, L. S. et al. Clustering of multiple specific genes and gene-rich R-bands around SC-35 domains: evidence for local euchromatic neighborhoods. J. Cell Biol.162, 981-990 (2003) | | | |
FURTHER READING Lercher, M. J. et al. A unification of mosaic structures in the human genome. Hum. Mol. Genet.12, 2411-2415 (2003) | | | |
WEB SITE
Is there a higher level genomic organization of protein-coding genes — do they cluster together at common nuclear structures? This is the question that Jeanne Lawrence and colleagues now address in The Journal of Cell Biology
Впервые авт. исследовали, имеется ли специфическое для типов клеток кластрирование множественных специфических генов вокруг общих доменов — доменов, котоые обогащены мРНК метаболическими факторами — что противоречит идее, что метаболические факторы просто накапливаются на транскриптах индивидуальных высоко активных генов. И в самом деле они нашли, что разные гены и транскрипты м. ассоциировать с одним и тем же SC-35 доменом в одно и то же время, даже если они находятся на разных плечах одной и той же хромосомы.
Lawrence и др. также показали, что доменовая ко-ассоциация коррелирует также, даже еще теснее, с хромосомным 'linkage' — богатыми генами рано реплицирующимися R дисками, ассоциированными с SC-35 доменами более часто, чем с бедными генами G дисками — и что ассоциация между R дисками и SC-35 доменами еще теснее.
Из-за тесного прямого сцепления некоторых дисков с SC-35 доменами авт. предположили, что ассоциация хромосомных соседей с SC-35 доменом м.. испытывать влияние со стороны присутствующих высоко экспрессирующихся и сплайсированных генов. И они объяснили, что богатые генами R диски формируют больше контактов с SC-35 доменами, т.к. они имеют больше ассоциирующих с доменами последовательностей. Эта работа представляет собой "fundamental and new concept relating nuclear and chromosomal organization" , в которой SC-35 домены действуют "...as functional centers for a multitude of clustered genes, forming local euchromatic 'neighbourhoods'."