Хотя репликация сама по себе происходит исключительно во время S фазы, программирование этого процесса начинается на ст. G1 sклеточного цикла, когда любой из источников компетентен к запуску через формирование пре-репликативного комплекса. Тот факт, что это м.б. осуществлено только в G1 является важным аспектом контроля репликации, т.к. он гарантирует, что каждый источник будет использован только однажды в каждом цикле. Сходным образом, инструкции по предопределению времени, когда каждый из источников буде использован в S фазе, также обеспечивается во время G1. Так, у дрожжей, в которые вносили recombinase распознающие последовательности, чтобы фланкировать поздно-реплицирующиййся источник, который расположен рядом с толомерой, индукция рекомбиназной активности в специфическое время приводила к тому, что фрагмент с источником высвобождался из теломерных регуляторных последовательностей в разные предтерминированные моменты клеточного цикла. Появление рекомбинации после того, как клетка пройдет через первые несколько часов G1, проявится продукцией эписомальных ДНК фрагментов, которые уже предетерминированы реплицироваться поздно в S фазе. Напротив, отсоединение до G1 обусловливает потрею контроля и возникающие плазмиды будут ревертировать к ранней репликации. Эти результаты указывают на то, что cis-действующие последовательности необходимы в ранней G1, чтобы настроить временной профиль репликации, как только это произойдет, эти элементы больше не нужны (Рис. 3).