Посещений:
CALCIUM-SIGNALLING
Передача Сигналов: Са2+

THE CALCIUM-SIGNALLING SAGA: TAP WATER AND PROTEIN CRYSTALS
Ernesto Carafoli
Nature Reviews Molecular Cell Biology 4, 326 -332 (2003)



(Box 1.)
 |  Timeline


(Рис.1.)
 |  Sydney Ringer.


(Рис.2.)
 |  The control of cellular Ca2+.


(Рис.3.)
 |  The three-dimensional structure of parvalbumin.


(Box 2.)
 |  The structure of the SERCA pump

Links

DATABASES
InterPro: C2 | EF-hand
LocusLink: calbindin | calcineurin | calmodulin kinase II | calsequestrin | troponin c
Swiss-Prot: annexin II | annexin V | Calmodulin kinase IV | DREAM | gelsolin | LTRPC2 | phospholamban | PMCA1 | PMCA2 | PMCA3 | PMCA4 | recoverin | RYR1 | RYR2 | SERCA1 | SERCA2

FURTHER INFORMATION
Ernesto Carafoli's laboratory


Box 4. Са2+ and disease
Several diseases involve proteins that respond to Са2+ or that control Са2+. Disruption of the gene for muscle-specific calpain 3 causes limb-girdle muscular dystrophy type 2A, so the cleavage of unknown substrates by calpain is evidently essencial to muscle-cell life. Alterations in the gene for calpain 10, which lacks the calmodulin-like domain but still contains other Са2+-binding sites, are associated with type 2 diabetes. Defects in non-EF-hand Са2+ sensors produce acute promyelocytic leukemia (annexin II), the antiphospholipid syndrome (annexin V) and familial type of amyloidosis (gelsolin).
Defects in muscle Са2+ transporters can result in cytosolic Са2+ level increases. Malignant hyperthermia is a contracturing condition that is caused by inhalation anaesthetics when mutations are present in the gene for isoform 1 of the ryanodine receptor (RYR1) that make it leaky. In the central core disease, degeneration of the central core od muscle fibers, hypothonia ( a state of abnormally low muscular tension) and proximal muscle weakness are caused by RyR1 gene mutations that induce chronic Са2+ leakiness, which damages the central portion of the fibre. Defects in the RYR2 isoform are involved in two diseases (arrhythmogenic right ventricular dysplasia and stress-induced polymorphic ventricular tachycardia0 that are characterized by sudden death due to cardiac arrythmias. Brody's disease, which is characterized by cramps and defective muscle relaxation, might be linked to defects in the sarco(endo)plasmic reticulum Са2+ ATPase SERCA1 pump, whereas defects in the SERCA2a isoform cause Darier's disease, which is characterized by loss of adhesion between epidermal cells and by abnormal keratinization. A mouse phenotype, which is characterized by hearing defects and is therefore a possible model for human hereditary deafness, is caused by the disruption of the gene for isiform 2 of the plasma-membrane Са2+ pump that is abundant in the outer-ear hair cells of the organ of Corti. Са2+ channelopathies are involved in muscular and retinal diseases. They can involve the pore-forming α1 subunit of L-type plasma-membrane Са2+ channels, whereas defects in the α1 of P-Q channels cause familial hemiplegic migraine, episodic ataxia type 2 and spinocellular ataxia. Mouse channelopathy models have also been described.
Примерно 1,400 грамм кальция присутствует в теле человека, причем менее 10 грамм не оказывается в скелете и зубах. Эти несколько грамм играют чрезвычайно важную качественную роль. Они циркулируют в крови и внеклеточных пространствах, проникают в клетки, чтобы регулировать их наиболее важные активности.
Sydney Ringer впервые установил, что изолированное сердце крысы прекрасно сокращается в водопроводной воде, но но не сокращается в дистиллированной воде. Рингер быстро установил, что субстанций в воде Лондонского водопровода. отвественной за контрактильность является кальций, который составляет 38.3 частей на миллион.

Getting the ball rolling


Неожиданные находки Рингера не вызвали волну исследовательской активности. Идея важной роли Са2+ была в основном проигнорирована. Концепция передачи соганлво Са2+ стартовала лишь в 1940 годы, когда были сделаны важные находки на мышцах Heilbrunn и в работе Bailey. Первый установил, что изолированные мышечные волокна лягушки сокращаются, когда Са2+ добавляется к их разрезанным концам, но не к их поверхности. Следовательно, Са2+ д. проникать внутрь волокна, гдже он активирует сократительные элементы. Bailey показал, что активность АТФазы препаратов миозина стимулируется Са2+ и предположил, что сокращение мышц (которое соответствует активации миозиновой АТФазы) обеспечивается высвобождением Са2+ рядом с миозиновыми филаментами. 10 лет спуся Bozler повторил исследования Bailey и показал, что chelation Са2+ приводит к реляксации мышечных волокон. Наконец, в 1959 Weber показал непосредственно, что актомиозин активируется за счет связывания Са2+.
В этом же году были изолированы митохондрии и Hasselbach и Makinnose в 1961 и Ebashi и Lipman в 1962 пузырьки саркоплазматического ретикулема. Эти эксперименты показали, что Са2+ д. транспортироваться через мембраны этих органелл, это и послужило поворотным пунктом в исследованиях Са2+.

Controlling Са2+ in the cell


Если Са2+ необходим, чтобы высвобождать сигналы к мишеням, которые контролируют важные процессы, то его внутриклеточная концентрация д. регулироваться очень точно. Концентрация кальция в цитозоле обычно поддерживается на уровне 100-200 нМ (Tsiens). Чтобы поддерживать этот цитозольный уровень, эволюция создала многочисленные белки, способные связывать Са2+ и/или транспортировать из цитозоля, уменьшая тем самым конц. свободного кальция до пределов, которые необходимы для его сигнальной функции. Это делается возможным с помощью специальной координации химии Са2+, которая позволяет ему быть связанным с помощью полостей нерегулярной формы, таких как те, что обычно образуются четвертичной структурой белков. Белки, которпые связывают или взаимодействуют с Са2+ м. подразделить на два класса - те, которые только связывают или взаимодействуют с Са2+, чтобы регулировать его его концентрацию (буфферизация Са2+ и Са2+-транспортирующие белки) и те, которые связывают Са2+, чтобы декодировать его сигнал (сенсоры Са2+).

Са2+-buffering and Са2+-transporting proteins

Белки, которые регулируют концентрацию внутриклеточного Са2+, м. находиться в цитозоле, в органеллах или они м.б. присущи мембранам. Растворимые Са2+-buffering белки в цитозоле и органаллах являются кислоыми белками, которые м. накапливать большие количества Са2+. Как правило, они обладают низким сродством к Са2+. Важным Са2+-buffering белком в sarco(endo)plasmatic ретикулеме является calsequestrin, а гнаиболее интеречным Са2+-buffering белком в цитозоле является parvalbumin, который принадлежит к семейству EF-hand Са2+-сенсорных белков. Однако, т.к. парвальбумин, по-видимому, не участвует в процессе передачи сигналов Са2+, хотя все др. Са2+-сенсорные белки делеают это, то считается, что он является Са2+-buffering белком.
Белки, присущие мембранам, м. создавать и менять форму сигналов Са2+ за счет своей функциии в качестве каналов, АТФаз (насосов), или обменников (exchangers) ? которые транспортируют Са2+ поперек мембран (Рис. 2). Са2+ каналы обеспечивают проникновение Са2+ в клетку и его выход из сарко(эндо)плазматического ретикулема. В плазматической мембране Са2+ каналы регулируют свою пропускуную способность за счет изменения эл. напряжения, за счет взаимодействия с лигандом или просто за счет плохо еще изученного механизма, который связан с высвобождением внутриклеточных хранилищ Са2+. Напряжением регулируемые каналы имеются нескольких субтипов, из которых L-типа, который являются мишенью для широко используемых антогонистов Са2+, охарактеризован лучше всего. Наиболее важными из каналов, оперируемых лигандом, являются регулируемые нейротрансмиттерами, а средни них, glutamate-operated каналы изучены наиболее сильно. В сарко(эндо) плазматическом ретикулеме открытие Са2+ каналов регулируется с помощью самого Са2+ - процесс Са2+-индуцированного высвобождения Са2+ - но их открытие нуждается также в лигандах подобных inositol-(1,4,5)-trisphosphate (Ins(1,4,5)P3) или в определенных типах клеток в др. эндогенном лиганде, cyclic ADP ribose, которая высвобождает Са2+ через каналы, которые известны как ryanodine рецепторы. Изоформа 1 этого рецептора (RYR1) экспрессируется реимущественно в скелетных мышцах, тогда как изоформа 2 (RYR2) экспрессируется в сердце и головном мозге. Связь между активацией рецепторов плпзматической мембраны и продукцией Ins(1,4,5)P3, хорошо изучена , но данные о связи между рецепторами плазматической мембраны и продукцией циклической АДФ рибозы бедны. Считается, что циклическая АДФ рибоза образуется внеклеточно с помощью эктоэнзима и, следовательно, д.б. импортироваться для клеточной функции. Свободная АДФ рибоза - продукт NAD+ гидролиза и разрыва циклической АДФ рибозы - которая продуцируется вне клетки, как было показано, открывает вход Са2+ канала, который известен как long transient receptor potencial channel 2 (LTRPC2). Наконец, производное никотиновой кислоты NADP+ - NAADP+ - является последним дополнением к семейству Са2+-мобилизирующих мессенджеров.
И плазматическая мембрана и внутренняя митохондриальная мембрана содержат Na+/Са2+ exchangers (NCX и MNCX, соотв.), которые экспортируют Са2+ из клетки и митохондриального матрикса, соотв. Высокая производительность NCX плазматической мембраны осоенно активна в возбудимых клетках, которые нуждаются в периодических выбросах больших количеств Са2+. Менее охарактеризованы митохондриальный обменник MNCX, он также осоебнно активен в возбудимых клетках. В то время как плазматической мембраны NCX обменник меняет три Na+ на один Са2+ и , следовательно, отвечает за трансмембранный градиент Na+ и Са2+ и тем самым за различия в напряжении поперек мембраны, обменник MNCX, по-видимому, обменивает два Na+ на один Са2+. Это электрически нейтральная операция MNCX делает возможным экспорт Са2+ из митохондрий в присутствии высоких отрицательных мембранных потенциалов, которые поддерживаются на матричной стороне внутренней мембраны митохондрий с помощью респираторной цепи. Плазматические мембраны эукариот также содержат Са2+ АТФазу (PMCA насос), которая поддерживает концентрацию цитозольного Са2+ на уровне покоя в 100-200 нМ. Ее активность регулируется с помощью калмодулина, а также др. факторов. Две изоформы насоса РМСА1 и РМСА4 являются повсеместными, тогда как РМСА2 и РМСА3 присутствуют только в специализированных клетках, таких как нейроны. Некоторые клетки ( напр., специализированные нейроны Кортиева органа) содержат только форму РМСА2, которая является укаороченной с С-конца и которая м. регулироваться по-другому в отличие от др. изоформ, т.к. ее сродство к калмодулину м.б. очень низким.
Важным в области мембранных Са2+ транспортеров является определение четвертичной структуры sarco(endo)plasmic reticulum Са2+ ATPase (SERCA pump). Выявлена структура ее Са2+-связанной (Е1) и свободной от Са2+ (Е2) конформации, которая подкрепляет предположение о мембранной топологии и молекулярном механизме накачки. SERCA1 изоформа эксперессируется преимущественно в быстро-сокращабющихся мышцах, тогда как SERCA2 экспрессируется в многочисленных немышечных тканях также. Существуют также сплайс-формы. Важным аспектом функции накачки SERCA является регуляция с помощью мембранам присущего белка phospholamban, N-терминальный гидрофильный домен которого взаимодействует с активным центром насоса, чтобы делать егьо неактивным. Фосфорилирование двух соседних остатков фосфоламбана отсоединяет его от насоса и снимает его ингибирование.

Са2+ sensors

EF hand белки являются наиболее важными и лучше всего охарактеризоваными Са2+ сенсорами. Они связывают Са2+ используя helix-loop-helix мотив ( имеется от 2 до 12 таких мотивов в разных EF-hand белках), которые связывают Са2+ с атомами кислорода некоторых инвариантных остатков (Рис. 3). Описаны вариации в паттерне координации. Напр., атомы кислрода из соседних спиралей м. связывать Са2+. Др. Са2+ сенсоры - напр., аннексины, gelsolin и белки, которые содержат С2 домены (компактный β-сендвич из двух 4-нитчатых β-листков) - также следует упомянуть, хотя их роль плохо изучена. Са2+ сенсоры обычно модулируют энзимы-мишени, которые не являются собственно Са2+ сенсорами, а являются энзимами, которые м. непосредственно модулироваться с помощью Са2+, т.е. они являются подлинными Са2+ сенсорами. Т.к. Са2+ является обычно аллостерическим металлом, то энзимы никогда не присоединяеются к нему посредством его каталитического сайта; однако, из правила существуют исключения...
Членом основателем семейства EF-hand белков был Са2+-buffering белок парвальбумин. Его кристаллическая структура установлена Kretsinger и Nickholds в 1973 (Рис. 3) и его основной Са2+-связывающий принцип экстраполирован на остальные блеки. Семейство EF-hand белков сейчас включает сотни членов, наиболее изучен калмодулин. Процессинг Са2+ сигналов для подходящих энзимов-мишеней состоит из двух последовательных конформационных изменений EF-hand белков. Первое происходит, когда Са2+ соединяется с EF-hand белком, второе происходит, когда EF-hand белок взаимодействует с энзимом-мишенью и спадается в шпилько-образуню структуру вокруг специфического связывающего домена.
Некоторые др EF-hand белки, напр., хорошо известный тропонин С как Са2+ рецептор в миофибриллах, recoverin как 'actor' в процессе зрения и calbindin, экспрессия которого контролируется витамином D. Недавно установлено. что калбиндин активирует инозитол монофосфатазу, которая является важным энзимом сигнального пути фосфоинозитидов. Наконец, группа EF-hand белков, которые коллективно называются neuronal Са2+ sensors, обкспечивают нейрональные функции, такие как высвобождение нейротрансмиттеров и активация семейства К+ каналов.

Spatial and Temporal control of Са2+


Обычно передача сигналов начинается как элементарное событие, которое непосредственно влияет на соседние мишени, но затем распространяется, чтобы повлиять и на удаленные активности. Сигнал м. путешествовать в форме волны или в виде повторяющихся всплесков (spikes) разной частоты и амплитуды. Усиление сигнала в целом объясняется с помощью дифузии Са2+ от места инициального высвобождения к соседним хранилищам, где он запускает дальнейшее высвобождение Са2+. В свою очередь это д. "активировать" дальнейшие хранилища с помощью аутокаталитического процесса. Са2+ д.б., следовательно, наиболее важным фактором в амплификации сигнала (Са2+ индуцировованное высвобождение Са2+), но д.б.неэффективным в запуске инициального высвобождения Са2+ в отсутствие вторичных мессенджеров. Это снавнимо с обнаружением, что продукция вторичных мессенджеров необходима для инициального элементарного сигнала. Berridge et al. подробно обсуждают механизмы, лежащие в основе элементарных событий, которые известны как "пуффы"('puffs'), когда они возникают из Ins(1,4,5)P3 рецепторов и 'sparks', когда они обусловливаются ryanodin/cyclic ADP ribose рецепторами. Интенсивно изучаемые осцилляции Са2+ являются эффективным путем передачи сигналов Са2+ к мишеням, которые нуждаются в длительном присутствии Са2+ без повреждаеющих эффектов его постоянных повышений. Др. Са2+-модулирующим событием , которое необходимо лишь для быстрого высвобождения пространственно ограниченного сигнала Са2+ (мышечное сокращение - наилучший пример), не нуждается в повторяющихся всплесках (spiking) Са2+.
Упоминаемые динамичные "хранилища Са2+" - это сарко(эндо)плазматический ретикулем. Berridge и др. открыли, что Ins(1,4,5)P3 вызволяет Са2+ из пузырьков эндоплазматического ретикулема. Эукариотические клетки, однако, содержат также и др., находящиеся в мембранах, хранилища Са2+. Способность митохондриона накапливать Са2+ была установлена еще раньше. В митохондриях впервые выявлено осциллирующее поведение сигналов Са2+. Однако, митохондриальные хранилища обладают собственным осциллирующим поведением.

The receiving end of the Са2+ signal


Возникнув сигнал Са2+ меняется пространственно и во времени и декодируется с помощью Са2+ сенсоров, воспринимающие мишени транслируют сообщение в функцию. Некоторые функции родственн хорошо изученным молекулярным процессам, которые привлекают лишь специфические (committed) Са2+ сенсоры; напр., мышечное сокращение, которое является результатом получения Са2+ сообщения от EF-hand белка тропонина С. Др. важные функции-мишени сообщений Са2+ более сложны и включают нейротрансмиссию, экзоцитоз и секрецию, клеточный цикл и родственные процессы оплодотворения яиц. Сложные Са2+-модулируемые функции часто используют предварительную активацию общих 'collectors' сообщений Са2+, расположенных ниже их инициального декодирования с помощью сенсоров, подобных калмодулину. Коллекторы, которые активируются с помощью Са2+, затем распространяют сообщение к мишеням, расположенным ниже. Эти коллекторы являются Са2+-активируемыми протеин киназами и фосфатазами, которые являются центральными элементами в регуляции многих клеточных функций. Одним из примеров критической роли протеин киназ и фосфатаз является транскрипция генов. Две регулируемые калмодулином киназы - calmodulin kinase IV и II - и калмодулином регулируемая фосфатаза calcineurin, контролируют трнаскрипцию генов посредством своего влияния на cAMP response element binding protein (CREB), транскрипционный фактор, который связывает цАМФ чувствительный элемент. Более того, гены м.б. активированы с помощью Са2+ непосредственно, как это происходит в случае EF-hand транскрипционного репрессорного белка DREAM.
Формирование и хранение памяти - это др. пример трансдукции сообщений Са2+ с помощью фосфорилирования, которое в этом случае обеспечивается calmodulin kinase II. Процессы, эксплуатирующие свойства этой киназы - это ее мультимерная структура, позволяющая ей декодировать частоты осцилляций Са2+. Са2+-обусловленный процесс аутофосфорилирования делает индивидуальные субъединицы энзима нечувствительными к Са2+, так что они оказываются способными "запоминать" синаптические события в течение временных границ оборота белка.

The dark side of the Са2+ signal


Существенным признаком передачи сигналов Са2+ является обратимость сигнала, устойчивое увеличение концентрации Са2+ выше субмикромолярного уровня м. гасить функцию передачи сигналов Са2+. Такое устойчивое увеличение м. также постоянно активировать гидролитическую активность, главным образом протеаз, это является событием, которое несовместимо с жизнью клетки. Патологические процессы часто повреждают плазматические мембраны и тем самым обусловливают избыточные количества Са2+ в клетке, это заставляет митохондрии использовать энергию дыхания, чтобы накапливать Са2+ и фосфаты. Хотя этим выкупается драгоценное для клетки время, это только временно, т.к. энергия, которая используется для накопления Са2+, получается из синтеза АТФ, это приводит к недостатку АТФ для дальнейшей накачки избыточного Са2+ из цитозоля. Если повреждающий агент не будет быстро удален, то этот эффект для клетки окажется смертельным. Это острая Са2+ катастрофа, однако, лишь один из возможных исходов. Менее заметны генетические патологии, которые связаны с прерыванием передачи сигналов Са2+, затрагивающим белки, которые контролируют Са2+ и его сообщения ( напр., мембранные транспортеры и Са2+ сенсоры) или белки-мишени для Са2+ сообщений (напр., протеаза calpain). Следовательно, передача сигналов Са2+ м. влиять на здоровье человека.
Хотя токсическая гибель клеток характеризует темную сторону передачи сигналов Са2+, др. форма клеточной гибели, которая также м.б. связана с нарушением передачи сигналов Са2+, не имеет негативных последствий. Апопотоз является одним из способос декодирования Са2+ сигнала в процессе обновления органа и его ремоделирования. Исполнителями апоптоза являются протеолитические энзимы, которые известны как каспазы, которые м.б. связаны с Са2+ более, чем одним способом. Напр., они м.б. активированы факторами, которые высвобождаются из митохондрий через большие неселективные 'permeability transition' поры, отверстия, которые м.б. запущены в матриксе. Кроме того, каспазы м. расщеплять Са2+ насосы плазматической мембраны, это будет постоянно повышать уровень клеточного Са2+ выше границ, совместимых с жизнью клетки.

Кальций: Передача Сигналов: Ремоделирование

CALCIUM SIGNALLING: DYNAMICS, HOMEOSTASIS AND REMODELLING
Michael J. Berridge, Martin D. Bootman, H. Llewelyn Roderick
Nature Reviews Molecular Cell Biology 4, No 7, 517 -529 (2003); doi:10.1038/nrm1155




Рис.1.
 | Calcium-signalling dynamics and homeostasis.


Рис.2.
 | Calcium-mobilizing messengers and modulators.


Рис.3.
 | Cardiac calcium-signalling module.


Рис.4.
 |  A calcium-induced calcium-signalling remodelling hypothesis.


Рис.5.
 |  Signalling pathways that participate in the control of compensatory hypertrophy.


Box 2
 |  Multimolecular complexes of calcium-signalling components

Links

DATABASES
LocusLink: AKAP | CaBP | calsequestrin | CaMKII | Ins(1,4,5)P3Rs | mGluRs | NMDARs | NCX | phospholamban | PLCβ | PMCA | RYRs | SERCA | syntaxin
SwissProt: FKBP12.6 | GKAP | PR130 | PSD95 | SNAP-25 | spinophilin | yotiao
Ca2+ is a highly versatile intracellular signal that operates over a wide temporal range to regulate many different cellular processes. An extensive Ca2+-signalling toolkit is used to assemble signalling systems with very different spatial and temporal dynamics. Rapid highly localized Ca2+ spikes regulate fast responses, whereas slower responses are controlled by repetitive global Ca2+ transients or intracellular Ca2+ waves. Ca2+ has a direct role in controlling the expression patterns of its signalling systems that are constantly being remodelled in both health and disease.

  • Ca2+ является многоцелевым внутриклеточным сигналом, который оперирует в широких временных пределах, чтобы регулировать множество различных клеточных процессов. Эта сигнальная система использует 'on' реакции, которые вводят Ca2+ в клетку и 'off' реакции, которые выводят его из цитоплазмы.
  • Обширный инструментарий передачи сигналов Ca2+ используется для сборки клеточно-специфичных сигнальных систем, которые довольно сильно отличаются пространственной и временной динамикой. Каналы в плазматической мембране и endoplasmic/sarcoplasmic ретикулёме ответственны за реакции "вкл", тогда как насосы и обменники выполняют реакции "выкл".
  • Многие из этих Ca2+-сигнальных компонентов организованы в макромолекулярные комплексы, в которых Ca2+-сигнальные функции выполняются внутри очень локальных условий. Эти комплексы м. оперировать как автономные единицы, которые м.б. умножены или сммешаны и использованы для создания больших, более отличающихся сигнальных систем, как, напр., в случае передачи сигналов Ca2+ в сердце.
  • Быстрые высоко локализованные всплески Ca2+ регулируют быстрые реакции, тогда как повторяющиеся глобальные транзиты (transients) или внутриклеточные волны Ca2+ контролируют медленные реакции. Клетки отвечают на такие осцилляции, используя сложные механизмы, включая и способность интерпретировать изменения в частоте, а такая модулируемая частотами передача сигналов м. регулировать специфические реакции, такие как экзоцитоз, состояние митохондриального redox потенциала и дифференциальная транскрипция генов.
  • Операции систем передачи сигналов Ca2+ постоянно находятся под контролем внутыреннего quality-assessment механизма, который м. реагировать, изменяя свойства своих испускаемых сигналов. Предлагается гипотеза, согласно которой Ca2+ сам по себе обладает важными функциями в этом внутреннем оценочном (assessment) механизме посредством ремоделирования своего собственного сигнального пути.
  • Некоторые важные болезненные состояния (гипертензия, болезни сердца, диабет, маниакальная депрессия, б-нь Алцгеймера) м.б. результатом аномального ремоделирования путей передачи сигналов Ca2+. Напр., Ca2+ играет чрезвычайную роль в ремоделировнаии, которое происходит во время как гипертрофии сердца, так и congestive сердечной недостаточности.
  • Сайт создан в системе uCoz