WMZ: Z191701361450 WMR: R209318204033 |
|
G-protein-coupled receptors (GPCRs) являются самым большим классом мишеней для современных разработчиков лекарств. Но создание новых GPCR-нацеленных соединений задерживается из-за отсутствия прямой структурной информации о взаимодействиях между GPCRs и их лигандами. Новый взгляд в Proceedings of the National Academy of Sciences на исследования с использованием solid-state NMR для выяснения конформации пептида агониста neurotensin, связанного с одним из своих GPCRs, neurotensin type-1 receptor (NTS-1)
Neurotensin является нейропептидом в 13-аминокислот, который модулирует сосудистуюти эндокринную функции. И пептид полной длины и его в 6 фминокислот С-конец (NT(8–13)) соединяется с sub-nanomolar сродством с NTS-1 (однин из GPCR). Такое связывание с высоким сродством предотвращает использование solution-state NMR, поэтому Marc Baldus и др. оптимизировали solid-state NMR, чтобы провести сравнительный анализ свободного и связанного NT(8–13) с атомным разрешением. Миллиграм препарата рецептора высокого качества получен Reinhard Grisshammer и сотр.
Чтобы сделать доступными NMR сигналы от связанного с лигандом и исключить сигналы от буфферных компонентов, детергентов и липидов, NT(8–13) униформно метили NMR-активными изотопами 13C и 15N с помощью solid-phase пептидного синтеза. Анализ спектра от оптимизированных двухмерных 13C NMR экспериментов с этим меченным пептидом показали, что свободный NT(8–13) остаётся в основном неструктуированным. Однако, в присутствии функционального, lipid-reconstituted NTS-1 крыс, полученного с помощью Escherichia coli системы экспрессии, остов NT(8–13) приобретал определенную конформацию β-нити.
Эта структурная модель рецептором связанного пептида м. представлять собой жизнеспособную матрицу для трехмерных pharmacophore-based поисков в химических библиотеках непептидных лигандов, которые м.б. использоаны для лечения. В общем эти данные проливают свет на solid-state NMR как пригодный инструмент для выясрнения структурной сложности высокого сродства взаимодействий GPCR–лиганд.
|