Аспекты компакции хромосом охарактеризованы достаточно хорошо, но мало известно о компакции ДНК высшего порядка. В двух работах - группы Hirano в
Current Biology и Bustamante и др. в
Science - описана компакция ДНК у
Xenopus laevis с помощью комплекса condensin-I и у
Escherichia coli с помощью condensin MukBEF, соотв.
Используя технику манипуляции с одиночными молекулами группа Hirano показала. что ДНК обратимо компактизуется при наличии слабых растягивающих сил в присутствии condensin I способной к гидролизации ATP. Увеличение растягивающих сил даёт в основном дискретное увеличение в виде расширений ДНК конец-в-конец, а размер увеличений привел эту группу к предположению, что condensin I компактизует ДНК путём внесения петель, вдоль ДНК. Используя ту же технику Bustamante и др. показали, что MukBEF кооперативно компактизует ДНК в повторяющиеся, стабильные структуры ATP-binding-зависимым способом. Растягивание ДНК превращает её в растянутую серию повторяющихся ступеней (steps), которые неожиданно оказались идентичными во всех последующих экспериментах. Кроме того, компакция ДНК после такого растяжения происходила в отсутствие ATP и свободной MukBEF. Было предположено, что MukBEF нуждается в связывании с ATP для формирования нечувствительных к силе (force-insensitive), внутримолекулярных контактов и для полимеризации вдоль ДНК. Они также предположили, что force-sensitive, внутримолекулярные контакты между двумя головками каждой молекулы MukBEF формируют петли ДНК и индуцируют компакцию.