Посещений:
Вирус СПИДа: Эволюция

THE CAUSES AND CONSEQUENCES OF HIV EVOLUTION
Andrew Rambau, David Posada, Keith A. Crandall, Edward C. Holmes
Nature Reviews Genetics 5, 52 -61 (2004); doi:10.1038/nrg1246




Рис.1.  | Key aspects of the HIV life cycle.


Рис.2.  | Evolutionary history of the primate lentiviruses.


Рис.3.  | The phylogenesis of HIV.


Рис.4.  | Contrasting patterns of intra- and inter-host evolution of HIV.


Рис.5.  | Multiple drug resistance induced by recombination.


Рис.5.  | Analysing rates of nucleotide substitution in HIV

Табл.1 Название

Links



DATABASES
CDC database of infectious diseases: AIDS
GenBank: HIV-1 | HIV-2 | SIVcpz | SIVgsn | SIVsm
LocusLink: CCR5 | CD4 | CXCR4

FURTHER INFORMATION
HIV drug resistance databases | HIV drug resistance databases | HIV sequence database | Software and links for estimating rates of viruses | Software and links for estimating recombination | UNAIDS AIDS epidemic update 2003 | VaxGen
Understanding the evolution of the human immunodeficiency virus (HIV) is crucial for reconstructing its origin, deciphering its interaction with the immune system and developing effective control strategies. Although it is clear that HIV-1 and HIV-2 originated in African primates, dating their transmission to humans is problematic, especially because of frequent recombination. Our ability to predict the spread of drug-resistance and immune-escape mutations depends on understanding how HIV evolution differs within and among hosts and on the role played by positive selection. For this purpose, extensive sampling of HIV genetic diversity is required, and is essential for informing the design of HIV vaccines.
  • Наличие генетического разнообразия HIV является результатом множественных межвидовых переносов к людям от Африканских нечеловекообразных приматов.
  • HIV-1 возник у шимпанзе и является результатом трёх отдельных переносов к людям; напротив, HIV-2 наиболее тесно связан с линиями в sooty mangabey и является результатом , по крайней мере 4-х переносов.
  • Самый недавний общий предшественник HIV-1 группы M (вирус, который вызывает огромное большинство инфекций по всему миру), как было подсчитано, возник в 1930s, хотя более 'древние' вирусы нуждаются ещё в подтверждении этого.
  • Субтипы HIV-1 возникли как следствие эффекта основателия и неполной выборочности.
  • В ходе распространения инфекции позитивный естественный отбор оказался доминантным способом эволюции HIV внутри отдельных пациентов.
  • В дополнение к эпидемии как целому, стохастические процессы оказались более важными для эволюции вируса между пациентами. Пока мало доказательств, что различия в приспособленности между линиями предопредляли их популяционные структуру и распределение.
  • Генетическая рекомбинаия явилась фундаментальным механизмом для эволюции HIV.
  • Разработка лекарственного лечения существенно увеличивает жизненные ожидания и качество жизни для тех, кто является HIV позитивным, но развитияе лекарственной устойчивости является главным осложнением.
  • Рекомбинация м. очень быстро свести вместе мутации устойчивости ко многим лекарствам во время комбинированной терапии.
  • Разработка вакцины для HIV является чрезвычайно медленным процессом, лишь немногие вакцины-кандидаты, прошедшие phase III клинических испытаний, демонстрируют свою неэффективность.
  • Высокоя скорость эволюции и является тем средством, которое меняет паттерн разнообразия HIV с опасной скоростью. Сл вакцины нацеливаются на постоянно меняющуюся мишень.


    • Сайт создан в системе uCoz