Посещений:
RISC

Структура и Функция
ASSEMBLY AND FUNCTION OF RNA SILENCING COMPLEXES
Erik J. Sontheimer
Nature Reviews Molecular Cell Biology 6, No 2, 127-138 (2005); doi:10.1038/nrm1568



Рис.1.  | The general pathway of RNAi in vitro.


Рис.2.  | RISC assembly in Drosophila melanogaster.


Рис.3.  |  siRNA asymmetry, dsRNA processing and the implications for RISC assembly.


Рис.4.  | Chemical mechanism of RISC-catalysed target-mRNA cleavage.


Рис.5.  | The PIWI domains of Ago proteins harbour the endonuclease activity of RISC.

Табл.1 Complexes implicated in RISC assembly and function

Табл.2 Biochemically documented RISC-assembly factors and RISC-associated proteins

На пути RNA-interference двунитчатая РНК индуцирует сиквенс-специфическую деградацию мРНК благодаря действию RNA-induced silencing complex (RISC). Недавние исследования явились предоставили первые указания на пути сборки RISC и открыли биохимическую роль критических компонентов RISC. Эти успехи перевели наше механистическое понимание RNA interference на новый уровень и обещают улучшить нашу способность эксплуатировать этот биологический процесс для использования в экспериментальной биологии и медицине.
  • RNA interference (RNAi) является эукариотическим путём регуляции генов, который замалчивает экспрессию специфических генов в ответ на гомологичную двунитчатую (ds)RNA. RNA-induced silencing complex (RISC) собирается на фрагментах short interfering (si)RNA и расщепляет мРНК-мишени, которые гибридизируются с siRNA.
  • У Drosophila melanogaster, RNase-III энзим Dicer2 (Dcr2) - который расщепляет dsRNAs на siRNAs - является важным для сборки RISC, даже если используются предварительно расщепленные siRNAs, чтобы запустить молчание. Dcr2 и ассоциированный dsRNA-связывающий белок R2D2 являются компонентами RISC-loading complex (RLC), который соединяется с siRNAs и экскортирует их на RISC.
  • RISC формируется благодаря пути ATФ-зависимой сборки, который включает ступень раскручивания siRNA. Относительная термодинамическая стабильность концов дуплексной siRNA помогает специфицировать нить, которая обязательно д. участвовать в сборке RISC.
  • RISC является multiple-turnover, зависимым от ионов дивалентных металлов энзимом, который гидролизует фосфодиэфирные связи-мишени, приводя к возникновению 3'-hydroxyl и 5'-phosphate концов.
  • Все RISCs, которые были охарактеризованы, содержали также член семейства белков Argonaute (Ago), что устанавливается по присутствию доменов PAZ и PIWI. Домен PIWI, как недавно было установлено, обладает структурной гомологией с энзимом ribonuclease-H, это позволяет рассматривать его как эндонуклеазу, которая расщепляет мишени мРНК .


    • Links

    DATABASES
    Entrez: AGO1 | AGO2
    Flybase: Ago2 | Armitage | Aubergine | Dcr1 | Dcr2 | Dmp68 | Fmr1 | R2D2 | Spindle-E | Tsn | Vig
    Swiss-Prot: AGO3 | AGO4 | DCR | HIWI
    Wormbase: DCR-1 | RDE-1 | RDE-4

    FURTHER INFORMATION
    Author's laboratory

    Сайт создан в системе uCoz