Посещений:
Транскрипция: Механизмы

Роль Не Транслируемой РНК В2
Allen, T. A. et al. The SINE-encoded mouse B2 RNA represses mRNA transcription in response to heat shock. Nature Struct. Mol. Biol. 11, 816–821 (2004)

Espinoza, C. A. et al. B2 RNA binds directly to RNA polymerase II to repress transcript synthesis. Nature Struct. Mol. Biol. 11, 822–829 (2004)
FURTHER READING
Wassarman, K. M. RNA regulators of transcription. Nature Struct. Mol. Biol. 11, 803–804 (2004)


Наиболее известными регуляторами транскрипции являются белки, а механизмы, которые они используют для контроля транскрипции хорошо охарактеризованы. Однако в последние годы был идентифицирован ряд РНК, которые регулируют транскрипцию, по-видимому. с помощью др. механизмов. Два сообщения вNature Structural and Molecular Biology Kugel и Goodrich групп описывают идентификацию одного из таких РНК регуляторов — мышиной B2 РНК — которая ингибирует транскрипцию путём соединрения с RNA polymerase II (Pol II).
B2 является малой не кодирующей РНК, которая транскрибируется с помощью RNA polymerase III (Pol III). Изучая транскрипционную реакцию на тепловой шок - которая характеризуется всеобщей репрессией Pol-II-обеспечиваемой транскрипции и усилением активности некоторых хитшоковых генов, таких как Hsp70 - Kugel, Goodrich и др. нашли, что уровень ядерной B2 РНК увеличивается.
Когда они специфически ингибировали Pol III, то установили, что уровни B2 РНК и Pol-II-обусловленной транскрипции остаются неизменными после теплового шока. Это указывалдо на то, что Pol-III-обусловленная транскрипция каким-то образом участвует в блокировании Pol-II-обеспечиваемой транскрипции. В самом деле, B2 РНК ингибировала Pol-II-обеспечиваемую транскрипцию in vitro, тогда как в клетках мышей, которые были истощены по B2 РНК, уровни мРНК оставались постоянными после теплового шока.
Затем Kugel, Goodrich и др. попытались охарактеризовать механизм, с помощью которого B2 РНК ингибирует транскрипцию. Добавление B2 РНК к минимальной reconstituted транскрипционной системе, которая содержит очищенную Pol II и три генеральных транскрипционных фактора, вызывает мощное и специфическое подавление транскрипции. Увеличение концентрации Pol II в системе требует добавления высоких концентраций B2 РНК для ингибирования транскрипции, тогда как избыток любого из общих транскрипционных факторов не влияет на потребность в B2 РНК. Раньше авт. показали, что B2 РНК ко-иммунопреципитируется с Pol II heat-shock-специфическим образом. Всё это подтверждает, что B2 РНК нацелена непосредственно на Pol II, чтобы ингибировать транскрипцию. Связывающий сайт был найден в ранее охарактеризованном RNA-docking сайте на Pol II.
Авт. добавляли B2 РНК in vitro транскрипционную реакцию на разных стадиях и установили, что только если она добавляется до образования транскрипционного pre-initiation комплекса B2 РНк блокирует транскрипцию полностью. Кроме того, B2 РНК ингибирует продукцию очень коротких (свыше 3-х нуклеотидов) транскриптов. Так, Kugel, Goodrich и др. пришли к заключению, что ингибирование м. происходить во время или перед началом инициации транскрипции. Они показали, что в механистических терминах это ингибирование транскрипции затрагивает связывание B2 РНК с пре-иниационным комплексом на промоторе, это делает комплекс не функциональным.
Понимание, как B2-РНК-обусловленная репрессия транскрипции м.б. выявлена является задачей будущего - авт. уже показали, что эффект B2 РНК обратим. Др. интересная загадка, это как гены, такие как Hsp70 м. транскрибироваться не смотря на присутствие B2 РНК.
Сайт создан в системе uCoz