Посещений: 
Белки с Мотивом dsRBMs
|
|
THE
DOUBLE-STRANDED-RNA-BINDING MOTIF: INTERFERENCE AND MUCH MOREBin Tian, Philip C. Bevilacqua, Amy Diegelman-Parente, Michael B.Mathews Nature Reviews Molecular Cell Biology5, 1013 -1023 (2004); doi:10.1038/nrm1528 |
|
|
Рис.1. | Secondary and tertiary structural elements in RNA.
Рис.2. | Two views of the dsRBM structure.
Рис.3. | Sequence logo of the dsRBM.
Рис.4. | Domain structures of dsRBM proteins.
Табл.1 Domains associated with dsRMBs in several species
Табл.2 Functions of dsRBM proteins and the roles of their RNA ligands*
Двунитчатая и высоко структуированные РНК долгое время считались как ключевые игроки в клеточных процессах от созревания и локализации РНК до антивирусной реакции у высших организмов. Выяснение метаболизма и функции таких РНК связано с идентификацией и исследованием белков. которые содержат мотив связывания двунитчатой РНК.
|
Многие белки, которые взаимодействуют с высоко структуированными РНК содержат мотивы связывания двунитчатых РНК (dsRBMs). Хорошо известные примеры включают nucleases RNase III и Dicer, протеин киназу PKR, RNA deaminases (ADARs) и Staufen, белок, который ответственен за локализацию мРНК.
dsRBM принимает α-β- β- β топологическую структуру с законсервированными остатками в критических местах, в частности в С-терминальном третьем мотиве. Три области dsRBM участвуют в контакте A-формной РНК вдоль одной из сторон (face) спирали без оборачивания вокруг неё.
dsRBM взаимодействует с РНК дуплексом без явной специфичности последовательностей. Однако, некоторые dsRBM белки обнаруживают высокую степень специфичности к субстрату, которая м. иметь важное биологическое значение.
dsRBM ассоциирует с ~20 др. доменами в белках всех эукариот, большинства eubacteria, некоторых вирусов и одного Archaeon. Эволюционно продвинутые организмы имеют большие количества dsRBM белков, чем низшие виды.
Когда имеется несколько dsRBMs в одном белке, то кооперация между ними м. приводить к более высокому сродству к РНК, а некоторые dsRBMs м. адоптировать активности, иные, чем связывание dsRNA, напр., участие в межбелковых взаимодействиях.
dsRBM белки участвуют в мириадах клеточных функций от RNA interference до антивирусных механизмов и др. типов пост-транскрипционной регуляции генов. Дуплексные РНК м.б. субстратами, модуляторами или грузами для dsRBM
белков. Существуют обширные взаимодействия между dsRBM белками. Некоторые участвуют в одних и тех же клеточных путях, таких реакция на интерферон и RNA interference, тогда как некоторые, по-видимому, модулируют функции др. белков.
Сайт создан в системе
uCoz