Посещений:
Семейство Ромбоидов

Intramembrane proteolysis

PROTEOLYSIS WITHIN THE MEMBRANE: RHOMBOIDS REVEALED
Matthew Freeman
Nature Reviews Molecular Cell Biology 5, No 3, 188 -197 (2004); doi:10.1038/nrm1334.




Рис.1.  | Rhomboids are intramembrane serine proteases.


Рис.2.  | The basis of Spitz targeting.


Рис.3.  |  A rhomboid controls bacterial intercellular signalling.


Рис.4.  | The role of yeast mitochondrial rhomboid.


Рис.5.  | Site-2-protease cleavage of SREBP in the Golgi apparatus.


Box 1.  | Regulation of Spitz processing by Star and Rhomboid-1

Табл.1 Proposed functions of all characterized rhomboids

Links

DATABASES
Entrez: aarA
Flybase: Aph-1 | Gurken | Notch | Pen-2 | Rhomboid-1 | Rhomboid-2 | Rhomboid-3 | Rhomboid-4 | Rhomboid-7 | SREBP | Spitz | Star | TACE
Saccharomyces genome database: Ccp1 | Mgm1 | Rbd1
Swiss-Prot: PARL | RHBDL1 | RHBDL2

FURTHER INFORMATION
Matthew Freeman's laboratory | MEROPS, the peptidase database | Nature Horizon symposium on proteases

The rhomboids are a recently discovered family of serine proteases with the unusual property of cleaving proteins within their transmembrane domains. They are the most widely conserved polytopic membrane proteins discovered so far. Although not much is known about the spectrum of their biological roles, it is already clear that rhomboids control events as diverse as growth factor signalling and mitochondrial membrane dynamics. As with other intramembrane proteases, the molecular details of how proteolysis can occur in a lipid bilayer remain mysterious.

  • Rhomboids вновь открытое семейство сериновых протеаз, законсервированных в ходе эволюции.
  • В отличие от всех остальных сериновых протеаз, rhomboids не расщепляют растворимые субстраты, а вместо этого разрезают белковые трансмембранные домены внутри липидного бислоя. Это аналогично внутримембранному расщеплению белков, которое катализируется presenilins, signal-peptide peptidase и site-2 protease, которые неродственны внутримембранным протеазам из др. механистических классов.
  • Rhomboids впервые были охарактризованы у Drosophila melanogaster, где Rhomboid-1 является первичным активатором внутриклеточной передачи сигналов с помошью рецепторов epidermal growth factor. Все rhomboids, которые были изучены, высвобождают белки в направлении наружу от клетки или в просвет; это отличает их от др. внутримембранных протеаз, которые почти все высвобождают цитоплазматические домены белков.
  • Хотя биологическая роль rhomboids в большинстве организмов ещё неизучена, имеется субкласс митохондриальных rhomboids, которые, по крайней мере, у дрожжей контролируют ремоделирование митохонриальной мембраны путём расщепления dynamin-подобного белка, известного как Mgm1. Один бактериальный rhomboid был изучен, оказалось, что он регулирует эмиссию quorum-sensing сигналов.
  • Как и в отношении др. внутримембранныых протеаз, мало известно и о каталитических механизмах rhomboids. Высоко законсервированные и каталитически существенные остатки, как полагают, формируют каталитическую триаду, сравнимую с той, что у классических растворимых сериновых протеаз, но как они оперируют в контексте катализа в липидном бислое, неясно.Все внутримембранные протеазы имеют множественные трансмембранные домены и скорее всего они создают гидрофильные микро-условия вокруг каталитического центра.
  • Внутримембранный протеолиз выходит на сцену как распространённый и разносторонний сигнальный механизм, который используется для контроля большого разнообразия биологических событий.
    • Сайт создан в системе uCoz