Chromatin loops are selectively anchored using scaffold/matrix-attachment regions Henry H. Q. Heng, Sandra Goetze, Christine J. Ye, Guo Liu, Joshua B. Stevens, Steven W. Bremer, Susan M. Wykes, Juergen Bode, and Stephen A. Krawetz JCS 2004 117: 999-1008. [Abstract][Full Text]
Хроматиновые волокна ранжированы в живых клетках в виде независимых петель, закрепленных на ядерном матриксе или хромосомных поддерживающих остовах (scaffold). Специфические последовательности ДНК, называемые scaffold/matrix-attachment regions (S/MARs) действуют как якоря для таких петель, но неясно, насколько гибки эти якоря. Henry Heng и др. выявили, что S/MAR-обусловленное закрепление петель является избирательным и динамическим (см. p. 999). Авт. вносилиодиночные и множественные копии S/MAR конструкций в трансгенных мышей и в трансфицированные линии кеток. Затем они использовали флюоресцентную in situ гибридизацию, чтобы проверить, где на ядерном матриксе или петлях хроматина расположены последовательности S/MAR. Когда вносились множественные S/MARs, то только некоторые из идентичных последовательностей использовались в качестве якорей для ядерного матрикса; даже одиночные копиии интегрированых S/MARs м.б. выявлены в хроматиновых петлях скорее, чем ассоциированными с ядерным матриксом. Heng и др. пришли к выводу, что S/MARs необходимы, но недостаточны для образования петель хроматина и они предложили модель регуляции транскрипции/репликации, согласно которой S/MARs избирательно используются для перемещения генов, предназначенных для транскрипции или репликации из хромосомной петли в ядерный матрикс.