Посещений:
Репарация Метилированных Оснований

REPAIRING DNA-METHYLATION DAMAGE
Barbara Sedgwick
Nature Reviews Molecular Cell Biology 5, No 2, 148 -157 (2004); doi:10.1038/nrm1312




Рис.1.  | Sites of methylation on the bases and sugar–phosphate backbone of DNA.


Рис.2.  | Demethylation of stable O-methylated-DNA lesions by the Escherichia coli Ada DNA-methyltransferase.


Рис.3.  | Oxidative dealkylation of 1-methyladenine and 1-ethyladenine in DNA by Escherichia coli AlkB.


Рис.4.  | Conserved domains of AlkB-family proteins.


Box 1.  | Mechanisms of DNA repair of N- and O-methylated bases in DNA


Box 2.  | Mechanisms of DNA repair of N- and O-methylated bases in DNA

Links

DATABASES
Entrez: MutT | Dut
Swiss-Prot: AAG | ABH1 | ABH3 | Ada | AidB | AlkA | AlkB | CYP2E | Ogt | PCNA | Tag
Weizmann institute GeneCards homepage: DEPC-1 | LOC121642
Methylating agents modify DNA at many different sites, thereby producing lethal and mutagenic lesions. To remove all the main harmful base lesions, at least three types of DNA-repair activities can be used, each of which involves a different reaction mechanism. These activities include DNA-glycosylases, DNA-methyltransferases and the recently characterized DNA-dioxygenases. The Escherichia coli AlkB dioxygenase and the two human homologues, ABH2 and ABH3, represent a novel mechanism of DNA repair. They use iron–oxo intermediates to oxidize stable methylated bases in DNA and directly revert them to the unmodified form.

  • Метилирующие агенты возникают эндогенно, появляются в окружающей среде и используются в химиотерапии. Они повреждают основания ДНК во многих местах, генерируя тем самым мутагенные и токсичекие повреждения.
  • После воздействия на Escherichia coli метилирующими агентами, по крайней мере, индуцируются три репарирующие ДНК активности, которые репарируют вредные повреждения ДНК. Эти активности следующие: AlkA (3-methyladenine-DNA-glycosylase), Ada (O6-methylguanine-DNA-methyltransferase) и AlkB (1-methyladenine-DNA-dioxygenase). Эти активности законсервированы от бактерий до человека.
  • AlkA вырезает 3-methyladenine и некоторые др. поврежденные основания из ДНК, тем самым генерирует сайт, лишенный основания, тогда как Ada непосредственно деметилирует O6-methylguanine и O4-methylthymine за счёт переноса метильных групп на себя в своём суицидальном действии.
  • AlkB и два гомолога человека недавно были охарактеризованы как α-ketoglutarate-Fe2+-dependent dioxygenases. Они используют iron–oxo промежуточные образования, чтобы окислить метильные группы у 1-methyladenine и 3-methylcytosine в ДНК. Метильные группы высвобождаются в виде формальдегида, а поврежденные основания превращаются обратно в аденин и цитозин.
  • Повреждения 1-methyladenine и 3-methylcytosine возникают в однонитчатой ДНК, так что AlkB и её гомологи м. действовать в репликационой вилке ДНК или в местах транскрипции. AlkB и ABH3 человека м. также участвовать в репарации РНК.
    • Сайт создан в системе uCoz