Посещений:
Рекомбинация

Горячие Точки

WHERE THE CROSSOVERS ARE: RECOMBINATION DISTRIBUTIONS IN MAMMALS
Liisa Kauppi, Alec J. Jeffreys, Scott Keeney
Nature Reviews Genetics 5, No 6,413 -424 (2004); doi:10.1038/nrg1346




Рис.1.  | The PCR approach for recovering crossover molecules directly from sperm DNA.


Рис.2.  | Graphical presentation of linkage-disequilibrium data.


Рис.3.  | Highly localized recombination activity in the human major histocompatibility complex class II region.


Рис.4.  | The meiotic recombination pathway in budding yeast.


Рис.5.  | Nonrandom distribution of double-strand breaks in budding yeast, revealed by different resolutions of gel analysis.


Рис.6.  | Comparison of crossover hot-spot locations in the human and mouse major histocompatibility complex class II region.

Links

DATABASES
Entrez: ADA | ARE1 | HIS4 | Lmp2 | LRP5 | PGM1 | SHOX | Spo11 | TAP2

FURTHER INFORMATION
Alec Jeffreys' laboratory | GermOnline (a web database for information about germ cell biology, including meiosis) | International HapMap Project | Scott Keeney's laboratory

Until recently, recombination studies in humans and mice had identified only a few anecdotal examples of crossover hot spots. Recently, the pace of discovery has accelerated. In every genomic segment that has been examined at sufficiently high resolution, recombination events have a punctate recombination distribution: they are clustered within small (1–2-kb) regions that are surrounded by large stretches of recombinationally suppressed DNA. Here, we review progress in understanding the distribution of mammalian recombination events, tie mammalian results together with informative studies in budding yeast and discuss the consequences of these findings for genome diversity and evolution.

  • События мейотической рекомбинации распределены неслучайно по геному.
  • Методы одиночных молекул для выявления рекомбинантных молекул ДНК непосредственно из ДНК спермиев позволят проводить рекомбинационный анализ у млекопитающих с высоким разрешением.
  • Недавние исследования показали, что большинство событий мейотическорй рекомбинации (и у дрожжей и у млекопитающих) происходят в высоко локализованных горячих точках (толщиной в 1-2 kb), тогда как остальная ДНК является "холодной".
  • Горячие точки рекомбинации у мышей и людей являются местами инициации и разрешения как кроссоверных, так и некроссоверных конверсий генов.
  • Изучение модельных организмов, прежде всего, почкующихся дрожжей, предоставило прямые указания на молекулярные механизмы, лежащие в основе активности горячих точек у млекопитающих.
  • Первичным детерминантом распределения рекомбинаций у дрожжей является распределение мест double-strand breaks (DSBs), которые инициируют рекомбинацию. Рекомбинационные горячие точки являются DSB горячими точками.
  • Частоты DSBs у дрожжей предопределяются с помощью полно-масштабных структурных свойств хромосом, также как и с помощью локальной структуры хроматина.
  • В принципе, региональная изменчивость в частотах кроссоверов м. также отражать различия в вероятности, что данные DSB будут давать кроссоверов в качестве оппозиции по отношению к некроссоверным продуктам.
  • Тот факт, что горячие точки рекомбинации являются сильно локализованными и разделяются рекомбинационно "холодной" ДНК, важен для структуирования генома на неравновесно сцепленные и гаплотипные (linkage disequilibrium (LD)/haplotype) блоки.
    • Сайт создан в системе uCoz