Посещений:
РибоПереключатели

Структура и Функция

GENE REGULATION BY RIBOSWITCHES
Maumita Mandal & Ronald R. Breaker Об авторах
Nature Reviews Molecular Cell Biology 5, 451 -463 (2004); doi:10.1038/nrm1403




Рис.1.  | Structural model and allosteric changes of a coenzyme-B12 riboswitch.


Рис.2.  | Coenzyme-B12-riboswitch structure and gene-control function.


Рис.3.  | Consensus sequences and structures for known riboswitch classes.


Рис.4.  | Differences in ligand specificity and switch direction for purine-specific riboswitches.


Box 2.  | RNA analysis by in-line probing


Box 3.  | Thermosensors and T-boxes


Box 4.  | Transcription attenuation and protein-mediated RNA switches

Links

DATABASES
Entrez: btuB | glmS | lac repressor | prfA | pbuX | rpoH | tyrS | ydhL | xpt
Riboswitches are complex folded RNA domains that serve as receptors for specific metabolites. These domains are found in the non-coding portions of various mRNAs, where they control gene expression by harnessing allosteric structural changes that are brought about by metabolite binding. New findings indicate that riboswitches are robust genetic elements that are involved in regulating fundamental metabolic.

Riboswitches являются структурными доменами внутри некодирующих частей некоторых мРНК, где они служат в качестве чувствительных к метаболитам генетических переключателей. Связывание метаболитов вызывает аллостерические изменения в мРНК, которые являются причиной изменений в процессах генной экспрессии, таких как терминация транскрипции и инициация трансляции.
Riboswitches представлены двумя доменами: aptamer и expression platform. Аptamer является высоко законсервированным даже у отдалённо родственных организмов и служит в качестве точного сенсора для своих метаболитов мишеней. Еxpression platform является более вариабельной по последовательностям и структуре, т.к. она м. функционировать предположительно с помощью одного из многих структурных форм, чтобы контролировать экспрессию генов.
Экспериментальные данные, которые сегодня известны относительно функции riboswitch это данные 30-летней давности. Недавние исследования подтвердили, что разнообразие gene-control 'mysteries', описанное в литературе в последнюю декаду, м.б. объяснено присутствием 7 самостоятельных классов riboswitches.
Аptamer домены riboswitches обнаружили неожиданную избирательность и специфичность, которая хорошо сравнима с белковыми рецепторами. Эти находки вместе с возможностью, что современные riboswitches м.б. эволюционно тянутся от родоначальной формы ген-контролирующей системы, указывают на то, что характеристики эффективности riboswitches конкурентно способны с теми, которые осуществляются с помощью белков.
Механизмы генного контроля с помощью бактериальных riboswitches в основном базируются на окончании транскрипции и инициации трансляции. Однако, открытие riboswitch, которые обладают функцией ribozyme, и доказательства, которые указывают на то, что эукариоты м. использовать riboswitches для контроля сплайсинга, указывают на потенциал более значительного разнообразия функции riboswitch и у родоначальных и современных организмов.
Новые исследования показали, что бактерии экспрессируют многочисленные новые РНК мотивы и малые не кодирующие РНК. Эти находки указывают на то, что ещё больше riboswitches будет идентифицировано и что riboswitches, по-видимому, являются существенной формой генетического контроля у бактерий.
Сайт создан в системе uCoz