Посещений:
RAB GTPases

Целенаправленная Доставка

TARGETING RAB GTPases TO DISTINCT MEMBRANE COMPARTMENTS
Suzanne Pfeffer, Dikran Aivazian
Nature Reviews Molecular Cell Biology 5, No 11, 886 -896 (2004); doi:10.1038/nrm1500




Рис.1.  | The structures of the bovine and yeast GDP-dissociation inhibitors (GDIs).


Рис.2.  |  e topology of human Yip3/PRA1.


Рис.3.  | A phylogenetic-tree analysis of the Yip1 and Yip2 membrane-protein families.


Рис.4.  | A model for the membrane recruitment of Rab proteins.


Box 1  |  Rab delivery to and retrieval from intracellular membranes/span>

Табл.1 Characterized Yip-family members and their interactions

Табл.2 Mammalian Yip proteins

Links

DATABASES
Saccharomyces genome database: Bos1 | Sec22 | Yif1 | Yip1 | Yip2 | Yip3 | Yip4 | Yip5 | Ypt1 | Ypt31
Swiss-Prot: GDIα | GDIβ | Rab1 | Rab1B | Rab2 | Rab3A | Rab5 | Rab7 | Rab9 | REP

FURTHER INFORMATION
Entrez Gene | Entrez Protein | Genomics Institute of the Novartis Research Foundation

Supplementary information

nrm1500-s1.pdf   Portable Document Format file (19K)
Rab GTPases являются ключевыми для событий поставок в мембраны в эукариотических клетках. Клетки человека содержат более 60 Rab белков, которые локализуются в отдельных компартментах. Установление структуры monoprenylated Rab GTPase, соединяющейся с ингибиторам GDP-диссоциации, предоставляет новые молекулярные детали, которые имеют отношение к моделям доставки Rab. Дальнейшее открытие интегрального мембранного белка, который м. диссоциировать prenylated Rab белки от ингибитора GDP-диссоциации дают новые указания на механизмы локализации Rab.
  • Rab GTPases важны для отпочковывания, подвижности, пришвартовки и слияния транспортных пузырьков. Клетки человека содержат более 60 Rabs, которые располагаются в разных мембранных компартментах. Их С-теримнальный гипервариабельный домен содержит важную и определенно нацеленную информацию.
  • Rab GTPases стабильно prenylated на своих С-концах и эта модификация ведет к их стабильной ассоциации с клеточными мембранами. Однако, Rabs м.б. удалены из мембран с помощью белка, который известен как GDP-dissociation inhibitor (GDI), который держит фракцию каждого Rab в цитозольном пуле в устойчивом состоянии.
  • Комплексы prenylated Rabs и GDI содержат всю информацию, небходимую для их аккутатной доставки в мембрану. Кристаллизация Rab–GDI комплексов предоставила интресную инфофрмацию относительно механизма, с помощью которого Rabs извлекаются из своих мембранных мишеней и возвращаются в их мембранный источник.
  • Структура дрожжевого (Saccharomyces cerevisiae) GDI, который связан с Rab1 (Ypt1) выявляет карман в дне GDI, который который приспособлен к размещению prenyl группы. Кроме того, второй отдельный prenyl-связывающий сайт был идентифицирован, он также м.б. важным для функции GDI.
  • Семейство белков — известных как Ypt-interacting proteins (Yips) — участвует во взаимодействии с Rab–GDI комплексами, чтобы завершить the доставку Rab GTPases в мембраны. Yip3 диссоциирует эндосомные Rabs от GDI, но он не функционален в отношении endoplasmic reticulum/Golgi Rabs, которые связаны с GDI.
  • Геном человека содержит 16 Yip-родственных белков, которые м. б. сгруппированы в 7 подсемейств, 6 из которых законсервированы у дрожжей. Yips, по-видимому, имеют разные локализации и появляться в виде гетеродимеров.
  • Yip белки м.б. представлены в самостоятельных путях membrane-trafficking, чтобы предоставлять инициальные сайты достижения мембран для prenylated Rab GTPases. Встав на определенный путь, Rabs м.б. стабилизированы путём взаимодействий с Rab-специфичными, ниже стоящими эффекторными белками.
    • Сайт создан в системе uCoz