Jan Faix1, and Klemens Rottner Current Opinion in Cell Biology Volume 18, Issue 1 , February 2006, Pages 18-25 / doi:10.1016/j.ceb.2005.11.002
Filopodia are rod-like cell surface projections filled with bundles of parallel actin filaments. They are found on a variety of cell types and have been ascribed sensory or exploratory functions. Filopodium formation is frequently associated with protrusion of sheet-like actin filament arrays called lamellipodia and membrane ruffles, but, in comparison to these structures, the molecular details underpinning the initiation and maintenance of filopodia are only just beginning to emerge. Recent advances have improved our understanding of the molecular requirements for filopodium protrusion and have yielded insights into the inter-relationships between lamellipodia and filopodia, the two ‘sub-compartments’ of the protrusive actin cytoskeleton.
Рис.1. | Formins from different species are strongly enriched in filopodia tips. (a) A Dictyostelium cell expressing GFP-tagged full length dDia2 was fixed and labelled with anti-GFP antibodies to visualize dDia2 (green) and with phalloidin to visualize F-actin (red). The merged image shows strongest dDia2 accumulation at the ends of filopodial actin bundles. Scale bar, 5 µm. (b) Phase contrast (left) and fluorescence (right) images of a mouse melanoma cell moving on laminin and expressing full-length human Drf3/mDia2 fused to EGFP. Note that filopodium, but not lamellipodium, protrusion coincides with significant Drf3 accumulation. Representative frames from a time-lapse series. Numbers on the right give time elapsed in seconds and scale bar equals 2µm.
Рис.2. Schematic model depicting the molecular activities promoting the formation, protrusion and retraction of filopodia. Grey bars represent actin filaments. During the initiation phase, a filopodium tip complex (FTP) is assembled, presumably at or very close to the plasma membrane. Note that some FTP proteins (such as formins) accumulate exclusively at these sites, whereas others, for example Ena/VASP or IRSp53 family proteins, are also found at the tips of lamellipodia (see Table 1). In addition, the FTP may contain proteins required both for actin filament nucleation and for reorganization of pre-existing filaments. The latter step is thought to include the removal of capping proteins from actin filament barbed ends and subsequent filament elongation by actin monomer addition (blue squares). Notably, de novo nucleation by factors other than Arp2/3 complex would have to be accompanied by rapid association to or anchorage into pre-existing cortical filaments. Force generation is mediated by actin polymerization at the tip, presumably driven by the action of formins, and by cross-linking of parallel nascent filopodial actin filaments by actin-bundling proteins (green bars). During later stages of filopodium protrusion, actin-bundling proteins such as fascin stabilize elongating actin filaments also in the shaft of the filopodium (red bars). Filopodium protrusion is positively and negatively regulated by filament elongation and actin rearward flow, respectively. Given that the rate of rearward flow in filopodia is more or less constant as observed in growth cone filopodia [35], net filopodium retraction occurs upon reduction or abolishment of tip elongation. For the sake of simplicity, the potential function of myosins is not depicted.
Actin-based protrusion is the first step in cell crawling. In the last two decades, the studies of actin networks in the lamellipodium and Listeria's comet tail advanced so far that the last goal of the reductionist agenda — reconstitution of protrusion from purified components in vitro and in silico — became viable. Earlier models dealt with growth of and force generation by a single actin filament. Modern models of tethered ratchet, autocatalytic branching, end-tracking motor action and elastic- and nano- propulsion have recently helped to elucidate dynamics and forces in complex actin networks. By considering these models, their limitations and their relationships to recent biophysical data, progress is being made toward a unified model of protrusion.
Рис. 1
Исследование нового пространства во время клеточной миграции обеспечивается с помощью выпячиваний богатых актином органелл по фронту клетки, сопровождаемых их слипанием с внеклеточным матриксом или клетками и затем перемещением тела клетки. Лучше всего охарактеризована структура выпячиваний lamellipodium, сравнимых с 'псевдоподиями' у Dictyostelium, который строится из плотной сети разветвленных или поперечно связанных актиновых филамент [1,2]. Постоянные lamellipodium выпячивания и морщины (ruffling), часто сопровождаемые образованием пучков из параллельных актиновых филамент, очень часто называют filopodia [3], которые особенно наглядны у индивидуальных клеток, таких как фибробласты или ростовые конусы аксонов, но часто также наблюдается свободный фронт листка мигрирующей ткани. Хорошо известные примеры последнего обнаруживаются во время стадий развития Drosophila и C. elegans, называемые дорсальным закрытием и вентральным включением соотв., при которых филоподии от противоположных слоев ткани приближаются др. к др и вносят вклад в zippering этих эпителиальных слоев [4]. Ламеллиподии в клетках B16-F1 меланомы или фибробластов часто содержат пучки актиновых филамент, называемых microspikes, которые остаются включенными в ламеллиподии во время постоянных выпячиваний [3]; эти микрошипы могут развиваться в филоподии путем выпячиваний за пределы края lamellipodium ([5] и Figure 1b). В соответствии с этим определением микрошипы никогда не подвергаются выпячивания за пределы xy-плоскости lamellipodium, в то время как филоподии делают это часто. Прикрепления филопоидальных выпячиваний в контактах субстрата, называемых фокальными комплексами [6], м. поддерживать поведение последних, в то время как микрошипы участвуют в инициации этих сайтов зарождающихся контактов ниже lamellipodium [2]. Т.к. ориентация огромного большинства пучков микрошипов не является перпендикулярной фронту ламеллиподий, их выпячивания, которые исключительно управляют полимеризацией актина на их кончиках [7], это сопровождается значительными боковыми движениями в отношении субстрата и lamellipodium, с быстрыми изменениями в направлении, вызывая тем самым частые столкновения и слияния индивидуальных микрошипов или филопоидальных пучков [3]. Однако, молекулярные аппаратные средства, управляющие динамическим поведением этого комплекса, пока неуловимы. Интересно, что неспособные к выпячиваниям периферические пучки актиновых филамент, известные как втягивающие волокна, которые часто ассоциируют со сторонами или тылом мигрирующих клеток, могут превращаться в филоподии, когда выпячивания втягиваются обратно [5]. Др. клеточные отростки, которые, как полагают, связаны с филоподиями, включают myopodia на дифференцирующихся мышечных клетках [8], лимфоцитарные и щетинистого края микроворсинки и стереоцилии на клетках улитки [9,10].
Signalling to filopodium formation
Как и в случае др. выступающих клеточных базирующихся на актине структур, таких как стрессовые волокна и оборки (ruffles) мембран, некоторые сигнальные пути, как полагают, управляют выпячиванием филоподий. Не является неожиданностью, что большинство из них участвует в активации и последующем связывании эффекторов Rho-семейства GTPases [11]. Образцом такого сигнального пути у позвоночных определенно является Cdc42-обусловленное образование филоподий [6], которое, как чаще всего полагают, управляется за счет прямого взаимодействия с белками подсемейства WASP (haematopoietic WASP и повсеместного N-WASP), хорошо известными активаторами сборки актиновых филамент, катализируемой Arp2/3-комплексом [12]. Первоначальные исследования показали, что активация Cdc42, стимулируемая, напр., воздействием bradykinin, вызывает образование microspike/filopodium [13], которые во многих типах клеток амплифицируются за счет одновременной супрессии активности Rac [6]. Две линии доказательств указывают на прямую связь между активацией Cdc42 и N-WASP-обусловленной полимеризацией актина в или на кончиках филоподий. Во-первых, ко-экспрессия обоих белков в клетках COS генерирует исключительно длинные нитевидные филоподии [14]; во-вторых, в экспериментах in vitro продемонстрирована способность Cdc42 совместно с, напр., phospholipid PIP2 [15], раскрывать авто-ингибируемую конформацию N-WASP , приводя к нуклеации Arp2/3-зависимых актиновых филамент (rev. [12]). Однако, первоначальные ожидания, что филоподии нуклеируются посредством комплекса Cdc42-WASP-Arp2/3, не подтвердились недавними исследованиями с использованием time-lapse микросокпии и инактивации генов. В противоположность ламеллиподиям комплекс Arp2/3, по-видимому, отсутствует в пучках микрошипов в фибробластах и B16F1 ламеллиподий [5,16]. Более того, делеция гена N-WASP в клетках мышей не устраняет Cdc42-индуцированных филопоидальных выпячиваний [17,18]. Особенно в связи с наблюдениями ростовых конусов филоподий [19], попытки определить какое-либо специфическое скопление этого белка на кончиках филоподий с помощью или GFP-нагруженных N-WASP или антител, специфичных для эндогенных белков, оказались безуспешными (Faix and Rottner, unpublished). Кроме того, WASP нокдаун в Drosophila S2 клетках с помощью RNAi не влиял на морфологию клеток, в частности lamellipodium и filopodium выпячиваний [20]. Наконец, тщательный анализ альтераций клеточной поверхности в Т клетках, лишенных гематопоэтической изоформы WASP, не выявил очевидных дефектов в образовании микроворсинок [9]. Вместо этого, растет количество наблюдений, указывающих на то, что WASP/N-WASP вместо этого функционирует в процессах доставки и эндоцитозе, на что указывает исчезновение интернализации Т-клеточных рецепторов в N-WASP-/- клетках [22]. Несмотря на это, ни одно из этих наблюдений не исключает WASP-Arp2/3-обусловленной сборки актина, чтобы сигнальные процессы действительно достигали кульминации в формировании филоподий, но они мешают вносить существенный вклад в полимеризацию актина на кончиках филоподий.
Недавно ряд дополнительных Cdc42 эффекторов оказался сопричастным к передаче сигналов для сборки актина и можно, следовательно, выявить многообещающие кандидаты, управляющие выпячивания филоподий иерархически ниже Cdc42. Особенно интересен в этом отношении diaphanous родственный formin Drf3, названный mDia2 у мышей [23], который, как было установлено, соединяется не только с Cdc42, но и также с др. Rho-семейства GTPases [24,25]. Др. связь с образованием филоподий может возникать при более детальной характеристике Cdc42 эффектора, insulin receptor substrate p53 (IRSp53), известного также как IRS-58 [26], который благодаря своему взаимодействию с членами семейства Ena/VASP может вносить вклад в эффективное образование филоподий [27]. IRSp53 сегодня относят к семейству белков с подсемейством белков MIM/ABBA [28]. Все эти белки обладают общей интригующей активностью по связыванию в пучки актиновых филамент на своих N концах, обеспечиваемой с помощью домена IMD, чья избыточная экспрессия может по сообщениям индуцировать образование филоподий [28,29]. Наконец, одинаково с группой A p21-activated kinases (e.g. PAK1), группа B PAKs подобных PAK4 и PAK5, которые преимущественно соединяются с Cdc42, также участвует в формировании filopodium, хотя молекулярный механизм, связи этих киназ со сборкой актина остаётся неизвестным [30].
Помимо Cdc42, нескольким из 22 Rho-GTPases млекопитающих также недавно было приписано участие в индукции образования филоподий, если активированы [31], таким как Cdc42 субкласса GTPases Wrch-1, RhoD и Rif; последняя из них, как предполагается, управляет формированием филоподий посредством своего взаимодействия с mDia2 [25]. Согласуется с этими наблюдениями то, что генетическая делеция Cdc42 не устраняет образования филоподий [32]. Т.о., потеря функции Cdc42 по передаче сигналов по выпячиванию филоподий, может быть компенсирована или экспрессией др. Rho GTPases или с помощью GTPase-независимых путей, Напр., увеличение активности c-Abl tyrosine kinase коррелирует с усилением персистенции филоподий и ветвлений нейритов [33], которое оказывается невозможным с помощью избыточной экспрессии доминантно-негативного Cdc42. Более недавние данные по использованию нокаута клеточных линий мышей продемонстрировали существенное снижение количества филоподий во время распространения клеток в отсутствие Abl tyrosine киназ Abl и Arg (Abl related gene), Abl субстрат p62 docking protein (Dok1) и Dok1's партнеров по взаимодействию, Nck1 и Nck2 [34]. Следовательно, Abl-обусловленное фосфорилирование Dok1 может запускать его ассоциацию с SH2 доменами Nck адапторов и тем самым вносить вклад в выпячивания филоподий. Однако, молекулярная связь между этим сигнальным путем и сборкой филопоидального актина остается невыясненной. Недавние исследования подтвердили альтернативный сигнальный путь, ведущий к выпячиванию филоподий в ростовых конусах нейронов у Xenopus, также использующих фосфорилирование тирозинов, но в таком случае участвует как предача сигналов Cdc42, так и фосфорилирование субстратов для Src-family kinase, таких как PAK1 [19]. И снова. прямая связь со сборкой актина на кончиках филоподий остается неустановленной, но в противоположность предыдущим исследованиям, индукция фосфорилирования тирозинов на кончиках филоподий, по-видимому, непосредственно коррелирует с выпячиваниями и, следовательно, с началом сборки актина [35] и совпадает с накоплением Src, Cdc42 и PAK в комплексах кончиков филоподий [19].
Т.к. эти исследования показали всё увеличивающийся список GTPases, kinases и адапторных белков, по-видимому, ассоциированных с сигнальными путями, ведущими е образованию этих пальцеобразных выпячиваний. Однако, точная последовательность событий - включая вовлечению стержневой единицы полимеризации актина, составляющей комплекс на кончиках филоподий, всё ещё до конца не установлена. Такая манящая цель д.включать сравнение ключевых сигнальных путей у позвоночных с таковыми у др., генетически более подходящих модельных организмов, таких как Drosophila и Dictyostelium. Три Rac белка (Rac1A, B и C) , как было установлено, индуцируют образование филоподий у Dictyostelium [36]. Интересно, что один из Dictyostelium diaphanous-related formins, dDia2, рекрутируется на кончики выпячивающихся филоподий (Figure 1) и является существенным для эффективного выпячивания филоподий, предположительно действуя на нижестоящий Rac1A [37]. Эти данные подчеркивают сходство функций для formin, такого как mDia2, в выпячиваниях филоподий у позвоночных [23,25] (Figure 2), хотя значимость этого белка д. б. исследована непосредственно в экспериментах по делециям и RNAi.
The molecular hardware of filopodium protrusion
Наше сегодняшнее понимание молекулярных механизмов образования филоподий всё ещё фрагментарно. Кажется, что большинство из изучаемых систем филоподий возникает их ламеллиподий, указывая тем самым, что ламеллиподиум служит в качестве структуры предшественницы [5,20,38]. Модель дендритной нуклеации выпячивания ламеллоподиума указывает на то, что непрерывная сборка актина происходит за счет ответвления новых филамент от боков или кончиков пред-существующих филамент, с ветвлением, обеспечиваемым с помощью Arp2/3 комплекса и его регуляторов [39]. Филаменты толкают мембрану вперед по мере того, как они удлиняются в результате полимеризации вплоть до тех пор, пока рост не будет блокирован с помощью колючего конца capping белков. Согласно этой модели, такая активность ведет к плотно упакованной сети коротких, жестких и разветвленных филамент, создающих силу, необходимую для выпячивания и подвижности.
Необходимость в capping белках для подвижности также продемонстрирована в реконструированных системах с использованием очищенных компонентов. Arp2/3-зависимая подвижность in vitroListeria и Shigella зависит от capping белков, которые поддерживают высокую концентрацию G-actin, необходимую для однонаправленного роста актиновых филамент на поверхности бактерий [40]. Согласно этому сценарию, высокие активности Arp2/3 и capping белков способствуют выпячиванию ламеллиподий, хотя избыток capping активности, напр., вызываемый деплецией ингибитора capping белков mCARMIL, блокирует целиком выпячивание ламеллоподиума [41].
Какие активности затем способствуют образованию филоподий? В отличие от ламеллоподий филоподии лишены lArp2/3 комплекса и содержат пучки параллельных и линейных филамент актина, которые растут на их кончиках [16,35]. Это указывает на то, что lamellipodia и filopodia формируются с помощью разных молекулярных механизмов, запускаемых разными путями. Интересно, что formins, которые составляют молекулярные машины, генерирующие линейные актиновые филаменты, недавно были локализованы на кончиках филоподий у клетках млекопитающих и Dictyostelium [23,25,37]. Более того, formins, как было установлено, располагаются в колючих концах индивидуальных актиновых филамент, действуя тем самым как processive моторы, которые могут генерировать силы приблизительно в 1.3 pN/filament [42,43]. Наконец, исследования по нокауту и избыточной экспрессии у Dictyostelium показали, что формирование филоподий непосредственно коррелирует с экспрессией Diaphanous-related formin dDia2 [37]. Т.к. formins способны к нуклеации de novo и элонгации пред-существующих актиновых филамент, то понятно, что этот класс белков может генерировать клеточные актиновые структуры в отсутствие др. nucleators, подобных комплексу Arp2/3. Эти данные подкрепляют идею, что lamellipodia и filopodia формируются с помощью независимых механизмов, хотя формальная проверка независимого от комплекса Arp2/3 формирования филоподий всё ещё отсутствует.
Предыдущие данные, однако, подтверждают альтернативный механизм образования филоподий. Детальные исследования с использованием ЭМ и наблюдений живых клеток с помощью GFP слитых белков привели к предположению модели 'convergent elongation' образования филоподий [5]. Она предполагает объединение и избирательное удлинение пред-существующих филамент ламеллиподий в пучки, чтобы сформировать filopodium. Отметим. что существование такого механизма продемонстрировано с помощью зависимой от Arp2/3-комплекса подвижности Listeria, которая может быть сдвинута in vitro в сторону Arp2/3-независимого, исключительно базирующегося на элонгации движения просто с помощью секвестрации Arp2/3-комплекса [44]. Рост филамент в филоподиях инициируется сборкой комплексов в кончиках, обладающих молекулярными активностями, способствующими выпячиванию филоподии, такими как uncapping и/или элонгация. Белки, которые д. обеспечивать uncapping, включают formins, такие как dDia2, которые, как было показано, удаляют колючие концы capping белков in vitro [37]. Важность низкой capping активности в выпячивающихся филоподиях была четко продемонстрирована с помощью массивной индукции таких структур после истощения capping белка у Dictyostelium и в клетках млекопитающих [45,46]. Более того, некоторые эксперименты показали, что содействие сборке актиновых филамент на плазматической мембране, напр., с помощью Ena/VASP белков [47,48], стимулирует выпячивание филоподия [49]. Следовательно, в первом приближении низкая capping активность и высокая скорость элонгации филамент способствуют превращению периферических актиновых структур в филоподии. Однако, тот факт, что деплеция capping белков в Mena/VASP-/- клетках не просто устраняет нокдаун фенотип по capping белку, но и стимулирует ruffling мембран, подчеркивает в пользу дополнительных функций белков Ena/VASP в формировании филоподий. Интересно, что белки Ena/VASP , как было установлено, не только связывают актин в пцчки in vitro, но и также являются критическими для образования филоподий in vivo [50,51]. Т.о., активность по образованию пучков может быть ключевым свойством в образовании филоподий, т.к. доказано участие в этом процессе таких белков, как IRSp53/MIM и fascin [52] (Figure 2), хотя относительный вклад всех этих белков в образование пучков филамент в филоподиях ещё предстоит определить.
Таблица 1. Localizations and biochemical properties of selected actin-binding proteins implicated in filopodia formation.
Protein
Lamellipodium
Filopodium
Biochemical activities
Potential functions
Reference
Arp2/3 complex
Tip + meshwork
–
Generates branched filament arrays
Proposed to generate filaments for
filopodia elongation
[5,16,2039]
SCAR/WAVE 1
Tip
–
Activate Arp2/3-complex; associate in
multi-protein complexes in vivo
Proposed to generate lamellipodial
filaments for filopodium protrusion; function at filopodia tips unknown
[3,12,20,60]
SCAR/WAVE 2/3
Tip
Tip
Formins (mDia2/dDia2)
–
Tip
Nucleate and elongate unbranched filaments;
compete with capping proteins for barbed filament ends
dDia2 essential for efficient filopodia
formation
[25,37,42,43]
Capping proteins
Tip + meshwork
–
Block growth of filament barbed ends
Counteract (excess) filopodium formation
[5,39,41,45,46]
Ena/VASP family
Tip
Tip
Enhance actin polymerization and motility;
reported to exert anti-capping, nucleation and bundling activity;
reported to accelerate Arp2/3 dissociation from activator
Dictyostelium
VASP required for efficient filopodia formation; mammalian family
members implicated in initiation and elongation of filopodia
[5,47,48,61]
Fascin
Meshwork (weak)
Tip and shaft
Bundles actin filaments
Implicated in stabilization of filopodial
actin bundles
[5,52]
IRSp53
Tip
Tip
N-terminal IMD domain bundles actin
filaments
Proposed to drive filopodia formation by
bundling
[28,29,62]
Myosins (myosin-X, VII)
–
Tip
Barbed end directed motor proteins
Proposed to transport cargo to filopodia
tips
[53-56]
Помимо белков, необходимых для нуклеации, элонгации и поперечного связывания актина, увеличиваются доказательства вовлечения нешаблонных миозинов в формирование филоподий. Myosin-X накапливается на кончиках растущих филоподий и его избыточная экспрессия индуцирует образование этих структур [53]. Myosin-X взаимодействует с β-integrins посредством своего FERM домена, а подавление myosin-X с помощью RNAi влияет на интегрином-обусловленную клеточную адгезию, это ведет к предположению, что myosin-X может производительно связывать актиновый цитоскелет с интегринами во время клеточной адгезии или формирования филоподий [54]. Хотя клетки Dictostelium лишены настоящего ортолога myosin-X, они экспрессируют родственный myosin-VII. Сходный с myosin-X, myosin-VII строго концентрируется на кончиках филоподий и мутанты Dictyostelium, лишенные этого белка, обнаруживают нарушенную адгезию, снижение скорости фагоцитоза и почти полное отсутствие филоподий [55]. Более того, недавние исследования myosin-VII связывающих белков привело к идентификации ассоциированного с адгезией talinA [56], который как известно участвует в формировании филоподий. Наконец, взаимодействие myosin-X с Mena указывает на роль в высвобождении Ena/VASP на кончиках филоподий [57]. Всё это указывает на то, что специфические нешаблонные миозины участвуют в базирующемся на актине траспорте молекул клеточной адгезии и возможно др. грузов во время адгезии и/или удлинения филоподий. Дополнительное доказательство роли неконвенционных миозинов в доставке грузов в кончики заполненных актином выпячиваний, получены также при анализе stereocilia на волосковых клетках внутреннего уха. Несколько миозинов, включая myosin Ic, VI, VIIa и XVa, являются существенными для собственно образования stereocilium, а мутации в этих генах ведут к потере слуха и нарушениям баланса у позвоночных и дрозофилы [58]. Из них только myosin-XVa локализуется исключительно на верхушках stereocilia и, каек было показано, постасляет PDZ-домен содержащий белок whirlin на кончики stereocilia, а также на кончики филоподий после экспрессии обоих белков в клетках COS. Наиболее существенно, myosin-XVa-обусловленное рекрутирование whirlin, необходимое для соотв. взаимодействия поверхностей каждого из белков партнеров и функционального motor домена миозина myosin [59]. Хотя точные функции этих моторных белков остаются неизвестны, эти находки строго подтверждают, что на плюс концы направленная моторная активность необходима для накопления составляющих кончиков stereocilia и filopodia.
Concluding remarks
In recent years we have witnessed significant progress in our understanding of the molecular regulation of protrusive cell-membrane structures like lamellipodia and filopodia. Several models for the mechanism of filopodium protrusion have been introduced. A key issue in the field is whether filopodia arise from lamellipodia or can form independently of the latter. As yet, several key modulators of actin filament dynamics have been implicated in affecting filopodium formation, including capping and bundling proteins as well as filament nucleators such as formins. Key questions for future studies include determination of the precise molecular mechanism of filopodium initiation (nucleation versus elongation) and assessment of the relevance of Arp2/3-complex-mediated actin filament assembly for filopodium formation. A full understanding may only come from establishment of the complete molecular inventory of filopodia and of the specific functions of the involved components. Finally, it will be exciting to determine the similarities and differences between the molecular mechanisms of filopodium, microvillus and stereocilium formation.