Передача сигналов Hedgehog (Hh) существенна для дифференцировки клеток и формирования паттерна ткани во время эмбриогенеза. Неконтролируемая активация этого пути может приводить к туморогенезу. Скрининг по всему геному с использование двунитчатой РНК (dsRNA) выявил более 500 потенциальных регуляторов передачи сигналов Hh. Результаты этого исследования подтверждают, что альтернативный сплайсинг и дефосфорилирование играют важные, ранее неизвестные роли в модуляции передачи сигналов Hh.

Соединение Hh с трансмембранным рецептором Patched (Ptc) обусловливает Ptc-контролируемую репрессию др. трансмембранного белка, Smoothened (Smo), это позволяет тем самым zinc-finger транскрипционному фактору Cubitus interruptus (Ci) транскрибировать Hh гены мишени, включая и Ptc. Nybakken et al. используя dsRNA, чтобы деградировать специфические белки в клетках Drosophila , трансфицированных Hh репортером и конструкцией, экспрессирующей полной длины Hh. Новые регуляторы передачи сигналов Hh, идентифицированные с помощью этого метода, включают многие рибосомальные гены, компоненты протеосом, членов COP1 комплекса, protein phosphatase 2A (PP2A) и киназы Cdk9 и Pitslre.

Всего 74 рибосомальных белков, как было установлено, редуцируют передачу сигналов Hh, если их количество уменьшалось с помощью dsRNA, это возможно отражает постоянную потребность в коротко живущих сигнальных компонентах. Авт. идентифицировали также 20 членов 26S протеосом в качестве позитивных регуляторов передачи сигналов Hh, несмотря на тот факт, что ранее идентифицированные компоненты ubiquitin ligase комплекса SCF, такие как Supernumerary limbs (Slimb), действуют как негативные регуляторы. Эти находки подтверждают, что разные механизмы целенаправленной доставки (targeting) д. контролировать деградацию позитивных и негативных Hh регуляторов. 7 стержневых субъединиц везикулярного trafficking комплекса COP1, как было установлено, также позитивно регулируют пердачу сигналов Hh у Drosophila и мышей. Наконец, киназы Cdk9 и Pitslre, по-видимому, выполняют законсервированные роли в регуляции Hh у мух и млекопитающих, но регулируют ли они передачу сигналов посредством известных эффектов на транскрипцию или сплайсинг, предстоит еще выяснить.

Неожиданно большое количество белков, участвующих в сплайсинге - в основном в выборе места сплайсинга - и в экспорте РНК, проявляют себя как потенциальные регуляторы Hh. Идентификация PP2A также заслуживает внимание, т.к. ни одна из фосфатаз ранее не была замечена в участии в передаче сигналов Hh. Способность менять передачу сигналов Hh посредством регуляции сплайсинга и дефосфорилирования драматически увеличивает сложность этого пути.