Репликация и репарация ДНК ассоциированы с разрушениями хроматина, которые нуждаются в последующей повторной сборке нуклеосом. Ацетилирование H3 Lys56 (H3K56ac), который является меткой вновь синтезированного H3, является важным для поддержания стабильности генома во время эти х процессов с ДНК, но механическая роль этого неизвестна. В двух исследованиях установлено участие H3K56ac в обеспечиваемой histone chaperone сборке хроматина вследствие репликации и репарации ДНК у почкующихся дрожжей.

Гистоновые хапероны CAF-1, Asf1 и Rtt106 участвуют в отложении вновь синтезированных гистонов. Li et al. показали, что все три гистоновых хаперона очищаются совместно с H3K56ac, но мутация H3K56 снижает связывание H3 с CAF-1 и Rtt106, но не Asf1. Делеция Asf1, который регулирует H3K56ac, или H3K56ac acetyltransferase Rtt109 также достаточны. чтобы вызвать снижение связывания CAF-1 и Rtt106 с H3. Исследования In vitro выявили более сильное связывание Rtt106 или Cac1 (крупной субъединицы CAF-1) с ацетилированными H3-H4, чем с не модифицированными H3-H4. Итак, H3K56ac способствует связыванию H3 с Rtt106 и CAF-1.

Используя in vitro для сборки нуклеосом авт. также показали, что сборка нуклеосом, использующая экстракты от Rtt109-дефектных или H3K56 мутантных клеток, существенно менее эффективна по сравнению с экстрактами из клеток дикого типа. Сборка нуклеосом редуцируется также в клетках, которые имеют высокие уровни H3K56ac (что достигается делецией соотв. histone deacetylase генов), но дефицитны по CAF-1 и Rtt106. Следовательно, эффективная сборка нуклеосом нуждается в H3K56ac, CAF-1 и Rtt106. Эта потребность была подтверждена измерением отложения H3K56ac на реплицирующейся ДНК, с использованием in vivo иммунопреципитации хроматина. Т.о., модификации вновь синтезированных молекул H3, а именно H3K56ac, могут регулировать сборку этих H3 молекул в нуклеосомы.

Во второй работе Chen et al. изучали повторную сборку хроматина после репарации double-strand break (DSB). Они показали, что DSB сопровождаются резекцией ДНК и разборкой хроматина, но что повторная сборка задерживается в asf1-мутантной линии. Потеря функционального Asf1 также ассоциирует с более высокой чувствительностью к ДНК-повреждающим агентам, несмотря на тот факт, что asf1-мутантные линии имеют нормальные функции репарации ДНК. Авт. показали, что asf1 мутанты обнаруживают удлинненую активацию checkpoint ДНК-повреждений и задержку в повторное вступление в клеточный цикл. Удивительно, потеря histone acetyltransferase Rtt109 вызывает те же самые дефекты повторной сборки хроматина, как и дефицит Asf1, тогда как конституитивно ацетилируемый H3K56 мутантов может выключать checkpoint после репарации ДНК путем стимуляции повторной сборки хроматина. Авт. полагают, что восстановление структуры хроматина, который содержит H3K56ac сигналы для checkpoint ДНК-повреждений, завершает процесс репарации, хотя как checkpoint отключается остается открытым вопросом.

Эти исследования проливают свет на важность сборки нуклеосом после репарации и репликации ДНК для целостности генома.