FOXA1

Lupien, M. & Eeckhoute, J. et al. FoxA1 translates epigenetic signatures into enhancer-driven lineage-specific transcription. Cell 132, 958–970 (2008) Article
FURTHER READING de la Serna, I. L., Ohkawa, Y. & Imbalzano, A. N. Chromatin remodelling in mammalian differentiation: lessons from ATP-dependent remodellers. Nature Rev. Genet. 7, 461–473 (2006) Article	Эпигенетические метки играют ключевую роль в установке транскрипционных программ, которые предопределяют специфические типы клеток, но неясно, как метки интерпретируются, чтобы-- обеспечивать дифференциальную транскрипцию. Новое исследование показало, что транскрипционный фактор FOXA1 соединяется с метилированным энхансером и открывает хроматин, чтобы облегчить доступ др. транскрипционным факторам. Forkhead транскрипционный фактор FOXA1 известен как пионерский фактор в развитии некоторых органов и раковых опухолей, соединяясь с цис-регуляторными элементами и рекрутируя транскрипционные факторы, чтобы индуцировать транскрипцию. Используя иммунопреципитацию хроматина в комбинации с анализом микромассивов (ChIP-chip), Brown с коллегами идентифицировали сайты связывания для в раковых клетках груди и простаты. Большинство сайтов в обеих линиях обнаруживались в энхансерах скорее, чем в промоторных областях, и не были общими с др. типами клеток и были ассоциированы с генами, которые уникально экспрессировались в данной линии. Когда авт. наблюдали за эпигенетическими метками, которые были ассоциированы со связыванием FOXA1, то они обнаружили достоверную избыточную представленность активирующих меток H3K4me1 и H3K4me2 (histone H3 monomethylated и dimethylated at lysine 4, соотв.) вокруг сайтов связывания. Искусственное снижение уровней этих меток с помощью избыточной экспрессии demethylase, снижало уровни связывания FOXA1, показывая тем самым, что это связывание происходит в ответ на метки скорее, чем вызывает их. Вместо этого, связывание FOXA1 вызывает увеличение чувствительности к DNase I в этих сайтах, на которые они рекрутируются, показывая тем самым, что связывание FOXA1 ведет к открытию структуры хроматина - свойству, которое ассоциирует с повышенной транскрипцией. Это подтверждает модель, согласно которой FOXA1 действует инициальный считыватель эпигенетической сигнатуры и затем открывает хроматин, позволяя рекрутировать др. транскрипционные факторы, которые генерируют программу экспрессии клеток. Интересно бы посмотреть, оперируют ли др. пионерские транскрипционные факторы за счет сходных механизмов.

Эпигенетические метки играют ключевую роль в установке транскрипционных программ, которые предопределяют специфические типы клеток, но неясно, как метки интерпретируются, чтобы-- обеспечивать дифференциальную транскрипцию. Новое исследование показало, что транскрипционный фактор FOXA1 соединяется с метилированным энхансером и открывает хроматин, чтобы облегчить доступ др. транскрипционным факторам.

Forkhead транскрипционный фактор FOXA1 известен как пионерский фактор в развитии некоторых органов и раковых опухолей, соединяясь с цис-регуляторными элементами и рекрутируя транскрипционные факторы, чтобы индуцировать транскрипцию. Используя иммунопреципитацию хроматина в комбинации с анализом микромассивов (ChIP-chip), Brown с коллегами идентифицировали сайты связывания для в раковых клетках груди и простаты. Большинство сайтов в обеих линиях обнаруживались в энхансерах скорее, чем в промоторных областях, и не были общими с др. типами клеток и были ассоциированы с генами, которые уникально экспрессировались в данной линии.

Когда авт. наблюдали за эпигенетическими метками, которые были ассоциированы со связыванием FOXA1, то они обнаружили достоверную избыточную представленность активирующих меток H3K4me1 и H3K4me2 (histone H3 monomethylated и dimethylated at lysine 4, соотв.) вокруг сайтов связывания. Искусственное снижение уровней этих меток с помощью избыточной экспрессии demethylase, снижало уровни связывания FOXA1, показывая тем самым, что это связывание происходит в ответ на метки скорее, чем вызывает их. Вместо этого, связывание FOXA1 вызывает увеличение чувствительности к DNase I в этих сайтах, на которые они рекрутируются, показывая тем самым, что связывание FOXA1 ведет к открытию структуры хроматина - свойству, которое ассоциирует с повышенной транскрипцией.

Это подтверждает модель, согласно которой FOXA1 действует инициальный считыватель эпигенетической сигнатуры и затем открывает хроматин, позволяя рекрутировать др. транскрипционные факторы, которые генерируют программу экспрессии клеток. Интересно бы посмотреть, оперируют ли др. пионерские транскрипционные факторы за счет сходных механизмов.