Посещений:
Principles of bioactive lipid signalling: lessons from sphingolipids
Nature Reviews Molecular Cell Biology 9, 139-150 (February 2008) | doi:10.1038/nrm2329 | |
It has become increasingly difficult to find an area of cell biology in which lipids do not have important, if not key, roles as signalling and regulatory molecules. The rapidly expanding field of bioactive lipids is exemplified by many sphingolipids, such as ceramide, sphingosine, sphingosine-1-phosphate (S1P), ceramide-1-phosphate and lyso-sphingomyelin, which have roles in the regulation of cell growth, death, senescence, adhesion, migration, inflammation, angiogenesis and intracellular trafficking. Deciphering the mechanisms of these varied cell functions necessitates an understanding of the complex pathways of sphingolipid metabolism and the mechanisms that regulate lipid generation and lipid action.
Рис.1. | An overview of the roles of sphingolipids in biology. Рис.2. | Sphingolipid metabolism and interconnection of bioactive sphingolipids. Рис.3. | Parallel networks of sphingolipid signalling. Рис.4. | Transport and transbilayer movement of bioactive sphingolipids. Рис.5. | Examples of ceramide signalling pathways and their role in stress responses. Рис.6. | SK–S1P receptors and signalling. Box 1 | Compartmentalization of pathways of sphingolipid metabolism Box 2 | Unique and particular properties of bioactive lipids DATABASESOMIM
|
Хотя концепция 'bioactive lipids' - широко определяется как изменения в уровнях липидов, которые вызывают функциональные последствия - прошли десятилетия в процессе её создания и только начинаем извлекать доход в последние 20 лет и в 21-м веке она становится в центр исследований клеточной биологии. Запоздалое признание имеет свои корни в более ранних априорных представлениях об исключительной роли липидов в энергетическом метаболизме и в структуре мембран, это предупредило более широкое толкование функциональной роли липидов. Эти препятствия в первую очередь возникли из-за множества врожденных трудностей работы с липидами, их энзимами и их мишенями.
В своем пионерском исследовании в 1950s, Hokin and Hokin наблюдали быстрый оборот inositol phospholipids на срезах поджелудочной железы, который стимулировался с помощью acetylcholine1. Однако, значение этого наблюдения для клеточной функции оставалось относительно невостребованным в течение нескольких лет, до тех пор, пока diacylglycerol (
Исследования последних 40 лет также установили eicosanoids (и др. продукты метаболизма arachidonic кислоты) в качестве ключевых меж- и внутриклеточных липидных сигнальных молекул, которые прежде всего участвуют в обеспечении или разрешении воспалительной реакции3. Дальнейшие исследования показали, что большинство минорных продуктов метаболизма inositol phospholipid, таких как phosphatidylinositol-3,4,5-trisphosphate (PtdIns(3,4,5)P3), также служат в качестве ключевых промежуточных образований в передаче клеточных сигналов. Др. производные glycerolipid регуляторные молекулы включают phosphatidic acid (PA), monoacylglycerols и anandamide (лиганды кандидаты для cannabinoid рецепторов), lyso-phosphatidic acid и platelet activating factor (PAF).
Др. группой биоактивных липидов, которая вышла из тени в последние два десятилетия, являются sphingolipids. Первым из них был идентифицирован sphingosine, который обнаруживает плейотропные эффекты на протеин киназы и др. мишени. Sphingosine и родственный ему sphingoid bases играют роль в регуляции актинового цитоскелета, эндоцитоза, клеточного цикла и апоптоза4 (Fig. 1). Ещё больший упор был сделан на сфинголипидах ceramide и sphingosine-1-phosphate (S1P). Ceramide обеспечивает большинство реакций на клеточные стрессы, включая регуляцию апоптоза5 и клеточного старения6, тогда как S1P играет критическую роль в клеточной жизнеспособности, миграции клеток и воспалении7 (Fig. 1). Недавние добавления к семейству биоактивных сфинголипидов включают ceramide-1-phosphate (C1P, который играет роль в воспалении и переносе пузырьков8-10), glucosylceramide (который участвует в post-Golgi трафике и резистентности к лекарствам11,12), lyso-sphingomyelin и dihydroceramide. Introducing the sphingolipid family
Метаболизм сфинголипидов появляется в основном у эукариот, но обнаружен также род бактерий Sphingomonas. Пути метаболизма сфинголипидов обладают уникальной метаболической точкой вхождения (serine palmitoyl transferase; SPT), которая формирует сначала сфинголипид на de novo пути, и уникальной точкой выхода, Complexities of sphingolipid signalling В осмыслении передачи клеточных сигналов в основном преобладает каноническая парадигма cyclic АМФ, при этом существует путь линейной передачи сигналов, в котором участвуют рецепторы, циклаза, цАМФ и цАМФ-зависимая протеин киназа, и в которой цАМФ выполняет сигнальную функцию. Однако, передача сигналов sphingolipid проявляется дополнительными слоями сложности по сравнению с путем цАМФ. В отличие от относительной простоты биохимически изолированного цАМФ пути, энзимы липидного метаболизма интимно связаны др. с др., генерируя взаимосвязанную сеть (Fig. 2), которая служит для регуляции не только уровней индивидуальных биоактивных липидов, но и также их метаболического взаимопревращения. Более того, имеются множественные пути, которые могут оперировать параллельно (Fig. 3). Также в отличие от растворимых молекул цАМФ, биоактивные сфинголипиды обладают гидрофобными свойствами; следовательно, физиологическое окружение биоактивных липидов по большей части ограничено биологическими мембранами. Итак, критический и уникальный набор свойств действует в клетке, чтобы предопределить субклеточную локализацию sphingolipid-опосредуемых путей и и транспорта биоактивных липидов поперек и между мембранами.
Интересно, что клеточные уровни др. биоактивных сфинголипидов обнаруживают те же сценарии с высоким сходством30. Напр., в большинстве типов клеток SM присутствует в концентрациях, которые на порядок величин выше, чем таковые для ceramide; следовательно, незначительные изменения в SM могут приводить к выраженным изменениям в ceramide. Кроме того, ceramide часто обнаруживается в концентрациях, которые больше чем на порядок величин выше концентраций sphingosine. Следовательно, непосредственный гидролиз лишь 3-10% вновь образованного ceramide может удваивать уровни sphingosine. Сходным образом фосфорилирование 1-3% sphingosine может удваивать уровни S1P (Fig. 1).
Учитывая эти метаболические данные, становится возможным, что когда энзимы сфинголипидов участвуют в процессе, то непосредственный продукт этого энзима может не быть фактическим сигнальным эффектором. Следовательно, важно определить, какой липидный продукт или субстрат в действительности обеспечивает сигнал. Напр., с помощью участия SMase или SKs в клеточно специфических реакциях нельзя непосредственно придти к выводу, что это является ceramide или S1P, который непосредственно обеспечивает такую функцию. К счастью, сегодня доступны инструменты и подходы к этим процессам. Это высоко чувствительная масс спектрометрия для анализа сфинголипидов30,31, молекулярные инструменты, которые производят почти полную молекулярную идентификацию всех известных энзимов метаболизма сфинголипидов, и RNA interference, которая успешно используется в исследованиях клеточной биологии метаболизма и функции липидов.
Parallel networks of sphingolipid signalling. Множественность некоторых путей метаболизма сфинголипидов создает др. уровень сложности, который накладывается на основную кальку (blueprint) метаболизма сфинголипидов, обсужденного выше. Это лучше всего иллюстрируется на примере ceramide synthases15 (Fig. 3). Шесть индивидуальных ceramide synthases катализируют образование dihydroceramides или ceramides (в зависимости от того является ли субстратом dihydrosphingosine или sphingosine, соотв.). Важно, что эти ceramide synthases обнаруживают характерные предпочтения к различным fatty acyl-CoA субстратам и, следовательно, они генерируют разные ceramides с уникальными N-сцепленными жирными кислотами. Разные ceramides могут локализоваться в самостоятельных субкомпартментах и могут выполнять самостоятельные функции. В качестве др. примера ,
Subcellular localization of bioactive sphingolipids. Большинство энзимов метаболизма сфинголипидов обнаруживает специфическую субклеточную локализацию (Box 1), и это оказывает выраженные эффекты на передачу сигналов и регуляторные функции генерируемых сфинголипидов. Напр., acid SMase локализуется преимущественно в эндолизосомном пути, но при определенных условиях может также перемещаться на плазматическую мембрану, преимущественно на наружный листок32. Neutral SMase2, по-видимому, локализуется на внутреннем листке плазматической мембраны. SK1 и SK2 , по-видимому, действуют преимущественно на sphingosine субстрат, который располагается в мембранах, которые необходимы для транслокации SK энзимов из их цитозольного компартмента на плазматическую мембрану (и др. мембраны) и для соединения с анионными липидами33. Поэтому очень возможно, что SK энзимы обладают множественными субклеточными локализациями, что и диктует разные функциональные реакции.
Эти характеристики в купе с плохой растворимостью липидов (Box 2) в клетках, накладывают определенные ограничения на субклеточную локализацию биоактивных липидов. В отсутствие специфических механизмов транспорта этих липидов, места генерации биоактивных липидов и диктуют их место действия, если не доказано иное.
Биоактивные сфинголипиды (и липиды в целом) могут быть подразделены на отдельные классы, которые могут отличаться по своим биофизическим свойствам (Box 2). Некоторые биоактивные липиды, такие как C1P и phosphatidylinositol-3-phosphate, несут ионные заряды при нейтральном pH и содержат две гидрофобные цепочки. Эти липиды скорее всего располагаются в компартменте своего возникновения и вряд ли проникают спонтанно через бислой. Вторая группа, которая включает ceramide и DAG, представлена нейтральными гидрофобными молекулами, которые также ограничены компартментами своего формирования, но они могут легко проникать (flip-flop) через мембраны34.
Третья группа представлена одноцепочечными липидами и она включает sphingosine, S1P, lyso-sphingomyelin и lyso-phosphatidic acid. Эти молекулы обладают достаточной растворимостью в жидкости, чтобы перемещаться между мембранами. Напр., было подсчитано, что ~70% остатков sphingosine располагается в мембранах при физиологических условиях pH, а остальные 30% растворимы35. Эти молекулы могут, следовательно, быстро уравновешиваться в мембранах. Более важно, учитывая их amphipathic природу (т.е. растворимость как в воде, так и органических растворителях), что эти молекулы могут обладать surfactant активностью. Следовательно, не является сюрпризом, что их клеточные уровни обнаруживают тенденцию находиться среди наинизших из всех биоактивных липидов.
Transport and flipping of bioactive sphingolipids. Для биоактивных сфинголипидов, чтобы вызвать функциональные реакции, они д. быть доступны для взаимодействия с соотв. непосредственными медиаторами. Субклеточное ограничение биоактивных сфинголипидов и некоторых их мишеней ставят некоторые вопросы, как взаимодействующие партнеры способны встречаться (Fig. 4). Напр., S1P возможно генерируется на внутреннем листке плазматической мембраны в ответ на действие tumour necrosis factor-a (TNFa) и др. агонистов36, 37. Всё же очевидно, что он достигает наружного листка плазматической мембраны, чтобы взаимодействовать с S1P рецепторами (S1PRs)38. Соответственно, два члена
Как нейтральный липид, ceramide, по-видимому, может flip-flop через мембраны с непринужденностью, и в самом деле, исследования на модельных мембранах и мембранах эритроцитов подтверждают это предположение34 (Fig. 4). Однако, неясно может ли ceramide, который формируется на более сложных биологических мембранах проникать с такой же эффективностью или организация ceramide в микродомены (существуют специализированные липидные домены в плазматической мембране; see the review by van Meer and colleagues in this issue) может ограничивать перемещение ceramide с наружного листка на внутренний листок. Ограничение flipping (или flopping со внутреннего на наружный листок) д. оказывать значительные эффекты на сигнальные функции ceramide. Напр., ceramide, который генерируется с помощью acid SMase в наружном листке, может осуществлять иные функции по сравнению с ceramide, который генерируется на внутреннем листке с помощью neutral SMase2 (Ref. 22).
Итак, биофизические и метаболические характеристики, рассмотренные выше, вносят уровень сложности, который отсутствует в др. сигнальных путях. Имеется, по крайней мере, 26 самостоятельных энзимов. которые действуют на ceramide как их субстрат или продукт и которые, следовательно, обладают потенциалом регулировать уровни ceramide. Эти энзимы обнаруживают специфические и варьирующие субклеточные локализации. Более того, ceramide сам является семейством тесно родственных молекул с, по крайней мере, 50 самостоятельными молекулярными разновидностями, которые могут быть различены с помощью их acyl цепочек, hydroxylations и desaturation (Fig. 3). Следовательно, уровни ceramide могут регулироваться в разных компартментах с помощью самостоятельных механизмов в разные времена. Mechanisms of action: ceramide and S1P Понимание, как биоактивные липиды действуют и как они передают сигналы, требует выяснения механизмов, с помощью которых эти липиды действуют. Можно представить себе два общих механизма действия липидов: межлипидные взаимодействия, с помощью которых кандидаты биоактивных липидов влияют на структуру мембраны и/или взаимодействие мембранных белков внутри мембранного бислоя (see the review by van Meer and colleagues in this issue); или взаимодействия между липидом и белком, с помощью которых изменения в липидах модулирую функцию белков мишеней, которые взаимодействуют специфически с кандидатами биоактивных липидов.
Физиологические уровни биоактивных липидов четко влияют (или даже диктуют) механизмы их действия. Следы липидов, таких как S1P, взаимодействуют с рецепторами высокого сродства, которые способны чувствовать их низкие уровни. Липиды, которые обнаруживают промежуточные мембранные концентрации, такие как ceramide или DAG (которые часто составляют 0.1-1.0% от общих мембранных липидов), действуют на мишени с промежуточным сродством. Напротив, очень трудно предвидеть, сколько обильные липиды, такие как SM, могут иметь специфических мишеней, т.к. сродство взаимодействий должно быть низким. Это не исключает белки, которые могут соединяться с этими липидами с высоким сродством, но в таком случае такие белки не должны быть способны ощущать изменения в уровнях этих липидов. Наивысшие уровни таких липидов, однако, придают им способность изменять общие свойства и субструктуру мембран, если и когда их уровни меняются. Для ceramide и S1P, внимание сфокусировано на определении действия непосредственных белковых мишеней. Некоторые белки кандидаты, как было показано. взаимодействуют с ceramide in vitro и в клетках (Fig. 5). Сюда входят ceramide-activated Ser-Thr phosphatases (CAPPs), такие как PP1 и PP2A, которые связывают ceramide in vitro43. Они умеренно активируются с помощью ceramide и обнаруживают предпочтение к естественным стереоизомерам. Исследования на клетках связаны с действием ceramide на CAPPs и индукцией дефосфорилирования белка. Напр., ceramide-индуцируемые агенты (такие как TNFa или загрузка клеток palmitate) индуцируют дефосфорилирование продукта гена retinoblastoma RB44, PKCalpha45, protein kinase B (
Кроме того, как было показано, ceramide активируют
S1P является одним из наиболее растворимых сфинголипидов и присутствует в низких наномолярных концентрациях в клетках (но в высокой наномолекулярной концентрации в сыворотке, где он ассоциирует с липопротеинами и альбумином52). Он взаимодействует с S1PRs53, который является G protein-coupled receptors (GPCRs) высокого сродства и и является единственным из известных рецепторов для S1P , которые были идентифицированы. Пять S1PRs (S1PR1-5) обнаруживают избирательную тканевую экспрессию, это является критическим для их биологических функций и используют хорошо-известные пути GPCR внутриклеточной передачи сигналов, чтобы обеспечить свои специфические эффекты (Fig. 6). S1P кроме того осуществляет S1PR-независимые действия внутриклеточно, такие как индукция высвобождения кальция8, хотя их механизмы остаются неизвестными. Т.к. внутриклеточная молекулярная мишень для S1P не идентифицирована, то его внутриклеточная роль остается предметом спекуляций и неослабного интереса. Sphingolipid-mediated cell regulation Основное внимание будет уделено трем специфическим путям передачи сигналов ceramide и пути SK1-S1P в воспалении и ангиогенезе в порядке внесения ключевых игроков и предоставления некоторого представления о наших знаниях сфинголипидами обусловленной клеточной регуляции.
Несколько исследований выявили участие nSMase2 в цитотоксическом действии amyloid peptide-β, демонстрируя ослабление этих реакций в клетках, в которых nSMase2 послана в нокдаун с помощью siRNA86, 87. Долговременная индукция энзима наблюдается после слияния (confluence) клеток (энзим и был первоначально клонирован как cell confluence-associated (CCA) ген88) и участвует в обеспечении ареста клеточного цикла, который индуцируется при клеточном контакте89.
Механизмы. участвующие в активации nSMase2 выяснены недостаточно. TNFa , как было показано, индуцирует транслокацию энзима на плазматическую мембрану с помощью механизма, зависящего от активации p38 mitogen-activated protein kinase (MAPK)85. В сливающихся клетках и клетках ткани (гепатоцитах), nSMase2 располагается базально на плазматической мембране. Важно, что она, по-видимому, располагается на внутреннем листке плазматической мембраны, где может располагаться преимущественно минорный пул SM90.
SK1-S1P in inflammation and angiogenesis. Твердо установлено участие SK1-S1P-S1PR оси во множественных сигнальных путях38, 91. Многие факторы роста, такие как epidermal growth factor и platelet-derived growth factor, а также цитокины TNFa и IL-1, остро активируют SK1, приводя к временным повышениям уровней S1P (обычно в 2-3 раза)25. Эта стимуляция нуждается в PKC92, phospholipase D (PLD)93 и/ или в extracellular signal-regulated kinase (ERK) MAPKs, которая действует выше SK1 (Ref. 94). PKC может действовать непосредственно или косвенно посредством PLD и ERK, в то же время предполагается, что ERK непосредственно фосфорилирует SK1 по остатку Ser225 (Ref. 94), это необходимо для её транслокации на плазматическую мембрану. PLD генерирует phosphatidic кислоту, которая может непосредственно связывать SK1 и приводить к её ассоциации с мембраной33.
S1P, которая генерируется с помощью этого процесса, обнаруживается преимущественно во внеклеточном пространстве и, учитывая её zwitterionic характер, эти результаты подтверждают необходимость в механизмах активного транспорта. В самом деле, как было недавно предположено, ABC транспортер ABCC1 необходим для транспортировки S1P с внутреннего листка плазматической мембраны на внешнюю сторону клетки40. Альтернативно, SK1 сама также обнаруживается вне клеток. Оказавшись вне клетки, S1P соединяется с S1PRs с высоким сродством и запускает типичные GPCR сигнальные пути95 (Fig. 6).
На клеточном уровне путь SK1-S1P изучался в связи с действием цитокинов, с множественными функциями, связанными с про-воспалительным действием TNFa (and IL-1). После 10 мин стимуляции TNFa, активируется SK1 с помощью механизма, который зависит от TRAF (TNFa receptor-associated factor) и ERK96. Исследования нокдауна выявили участие SK1 в обеспечении эффектов TNFa на индукцию cyclooxygenase-2 (COX2), продукцию prostaglandins37, 97, индукцию адгезивных молекул98 и активацию eNOS83. Интересно, что нокдаун S1P phosphatase или S1P lyase (ключевых энзимов, метаболизирующих S1P) увеличивает продукцию prostaglandin, одновременно с увеличением уровней S1P37. Это указывает на то, что S1P является медиатором действия SK1, а не последующих метаболитов.
На уровне организма путь SK1-S1P-S1P1R без сомнения участвует в регуляции ангиогенеза, т.к. S1P1R присутствуют на высоких уровнях в эндотелиальных клетках и. как известно, выполняют важную роль в ангиогенезе; кроме того, нокаут S1P1R ведет к эмбриональной летальности из-за плохого развития сосудистой сети99. Комбинированный нокаут SK1 и SK2 также воспроизводитт этот фенотип100. Исследования эндотелиальных и гладкомышечных клеток подтверждают ключевую роль S1P в регуляции пролиферации, миграции эндотелиальных клеток и образовании ими трубок и в активации миграции и пролиферации гладкомышечных клеток101.
Более того, S1P1R вместе с S1P3R и S1P4R концентрируются в лимфатических органах и играют ключевые роли в регуляции лимфоидной секвестрации и/или в выходе из лимфатических узлов102. Недавно, FTY270, аналог sphingosine, как было установлено, фосфорилируется с помощью SK2 и действует как мощный агонист S1P рецепторов. FTY720 теперь находится на клинических испытаниях его роли в иммунной модуляции (напр., множественном склерозе103), тем самым подчеркивается важность S1P в регуляции функции лимфоцитов и иммунитета. l
Важно также вспомнить, что SK1 и SK2 выполняют ключевую метаболическую функцию в предпоследнем разрушении всех сфинголипидов, причем необратимые разрушения продукта S1P ведут к метаболическому выходу из sphingolipid пути. Т.о., изменения в активности SK могут оказывать долговременные эффекты не только на уровни S1P, но и также ceramide, сложные sphingolipids и sphingoid bases. Это прекрасно демонстрируется с помощью siRNA исследований, которые показывают достоверное накопление ceramide в ответ на нокдаун SK1
(Ref. 104). Conclusions and future directions The above examples focus on specific, regulated sphingolipid pathways and enzymes that have been more extensively studied than other enzymes and pathways, such as SM synthases, ceramidases, ceramide synthases, GCS, CERT, S1P phosphatase and S1P lyase, which are currently subject to intensive investigation. Sphingolipids other than ceramide and S1P are emerging as candidate bioeffector molecules. These include C1P, which has roles in activation of phospholipase A2 (Refs 105,106), regulation of vesicular trafficking, phagocytosis10, macrophage degranulation9 and in mitogenesis107. Glucosylceramide has been implicated in resistance to chemotherapeutic agents12, and may serve as the endogenous cargo for the P-glycoprotein transporter MDR1 (Ref. 108). Dihydroceramide, which had been shown to be inactive in apoptosis, has been implicated in mediating the growth inhibitory actions of fenretinide (a retinoid analogue used in the treatment of neuroblastoma), which has been shown to inhibit the activity of the desaturase109-111. Lyso-sphingomyelin has been shown to induce multiple cellular effects, possibly mediated by binding to specific GPCRs112. These additional pathways and bioactive metabolites clearly represent areas of future investigation.
The examples described here highlight important roles for sphingoid bases, ceramide and S1P in regulation of the cell cycle, stress responses, pro-inflammatory pathways and cell migration, with key roles in apoptosis, inflammation and angiogenesis. These cellular roles extend to organismal function and pathobiology and have implications for the understanding of cancer biology, arthritis and inflammation, diabetes, immune function and neurodegenerative disorders113-115. Notwithstanding the many difficulties and complexities in studying bioactive lipids, these examples demonstrate the power of modern cell biology and biochemistry in elucidating these pathways through the use of knockout mice, siRNA technology, liquid chromatography–mass spectrometry-based 'lipidomic' analysis, confocal microscopy, chemical biology, mathematical modelling and systems biology approaches.
There are several take-home messages. First, this ever-enlarging spectrum of bioactive lipids has, in effect, reversed our assumptions about the putative functions of lipid metabolism and the roles of minor lipids. Past generations of investigators may have been sceptical of the significance of lipids in cell biology, but we are now at a point where one can almost assume that lipids, which have regulated levels, are 'bioactive until proven otherwise'. Second, it is clear that these pathways are now accessible to the cell biologist, provided that due attention is given to the peculiarities of bioactive lipids and their pathways, as discussed in this review. Third, sphingolipid-mediated pathways operate at the level of individual organelles, and thus should be studied as such. Functions of ceramide in the ER are clearly different from those at the plasma membrane; even in the membrane, ceramide seems to regulate different functions depending on whether it is formed at the inner or outer leaflet. Similar considerations may apply to SK1 and SK2 (Ref. 116). Fourth, the complexity of sphingolipid metabolism and the metabolic interconversion of bioactive sphingolipids provide the cell with an extremely rich repertoire for not only generating multiple signals, but also for fine-tuning specific responses. Therefore, the field of bioactive sphingolipids constitutes its own area of biological '-omics', the 'sphingolipidome'. This generates the anticipation that many modern analytical techniques and the mathematical approaches of systems biology will be brought to bear on this field, as has been trialled with modelling of the sphingolipid metabolic pathways of yeast117.
The study of bioactive lipids is only now coming to the forefront of cell biology, representing possibly one of the last frontiers in molecular cell biology. Clearly, more work is required to dissect each of the many regulated pathways of bioactive sphingolipids and define the mechanisms of regulation of enzymes, roles of the pathways in specific cell responses, and mechanisms by which individual bioactive sphingolipids, which act in specific subcellular compartments, mediate those actions.
|