Факторы

Farny, N. G., Hurt, J. A. & Silver, P. A. Definition of global and transcript-specific mRNA export pathways in metazoans. Genes Dev. 17 Dec 2007 (doi: 10.1101/gad.1616008) Article
Pamela Silver and colleagues report the first genome-wide RNA interference (RNAi) screen for factors that are required for the nuclear export of mRNAs in a metazoan system. Рисунки в оригинале статьи \| FURTHER READING Kohler, A. & Hurt, E. Exporting RNA from the nucleus to the cytoplasm. Nature Rev. Mol. Cell Biol. 8, 761–773 (2007)	Визуальный скрининг, который базируется на субклеточной локализации мРНК в RNAi-обработанных клетках (клетках, которые дефектны по фактору ядерного транспорта, накапливющих мРНК в ядре), привел к идентификации 72 факторов, которые необходимы для экспорта из ядра МРНК у Drosophila melanogaster. Из низ, 18 были необходимы для экспорта мРНК как у дрожже, так и у мух, тогда как 54 дополнительных факторов могут быть рассмотрены как обладающие функцией процессинга, трансляции РНК, клеточного цикла и неизвестных процессов При сравнении потребности в ядерном экспорте двух хит-шоком индуцируемых транскриптов мух - безинтронной HSP70 мРНК и интрон-содержащей HSP83 мРНК - авт. установили, что эти факторы экспорта, которые необходимы для экспорта HSP70 мРНК, также необходимы для экспорта HSP83 мРНК. Напротив, однако HSP83 мРНК нуждается в дополнительных факторах экспорта, это может отражать дополнительные потребности в процессинге мРНК для интрон-содержащих генов. Эти дифференциальные потребности в факторах ядерного экспорта скорее всего означают увеличение сложности геномов metazoan по сравнению с дрожжами. Среди вновь идентифицированных факторов ядерного экспорта, некоторые обнаруживали взаимодействие с главным аппаратом экспорта мРНК или были частью компенсаторной транскрипционной сети. которая была способна позитивно регулировать основные экспортные факторы в ответ на блокаду экспорта. В то время как эти новые факторы нуждаются в детальной характеристике, некоторые являются прямыми участниками экспорта мРНК. Идентификация др. новых факторов выявляет связи между экспортом мРНК, трансляцией и регуляцией клеточного цикла. Один такой фактор, dmPCID2, ассоциирует с активно транслирующими рибосомами и это взаимодействие зависит от присутствия домена PCI (домена межбелкового взаимодействия, который также присутствует в факторах инициации трансляции eIF3). Авт. полагают, что dmPCID2 может действовать как мостик между экспортом и трансляцией мРНК , возможно благодаря взаимодействию между аппаратом экспорта и PCI-содержащим eIF3 комплексом.

Визуальный скрининг, который базируется на субклеточной локализации мРНК в RNAi-обработанных клетках (клетках, которые дефектны по фактору ядерного транспорта, накапливющих мРНК в ядре), привел к идентификации 72 факторов, которые необходимы для экспорта из ядра МРНК у Drosophila melanogaster. Из низ, 18 были необходимы для экспорта мРНК как у дрожже, так и у мух, тогда как 54 дополнительных факторов могут быть рассмотрены как обладающие функцией процессинга, трансляции РНК, клеточного цикла и неизвестных процессов

При сравнении потребности в ядерном экспорте двух хит-шоком индуцируемых транскриптов мух - безинтронной HSP70 мРНК и интрон-содержащей HSP83 мРНК - авт. установили, что эти факторы экспорта, которые необходимы для экспорта HSP70 мРНК, также необходимы для экспорта HSP83 мРНК. Напротив, однако HSP83 мРНК нуждается в дополнительных факторах экспорта, это может отражать дополнительные потребности в процессинге мРНК для интрон-содержащих генов. Эти дифференциальные потребности в факторах ядерного экспорта скорее всего означают увеличение сложности геномов metazoan по сравнению с дрожжами.

Среди вновь идентифицированных факторов ядерного экспорта, некоторые обнаруживали взаимодействие с главным аппаратом экспорта мРНК или были частью компенсаторной транскрипционной сети. которая была способна позитивно регулировать основные экспортные факторы в ответ на блокаду экспорта. В то время как эти новые факторы нуждаются в детальной характеристике, некоторые являются прямыми участниками экспорта мРНК.

Идентификация др. новых факторов выявляет связи между экспортом мРНК, трансляцией и регуляцией клеточного цикла. Один такой фактор, dmPCID2, ассоциирует с активно транслирующими рибосомами и это взаимодействие зависит от присутствия домена PCI (домена межбелкового взаимодействия, который также присутствует в факторах инициации трансляции eIF3). Авт. полагают, что dmPCID2 может действовать как мостик между экспортом и трансляцией мРНК , возможно благодаря взаимодействию между аппаратом экспорта и PCI-содержащим eIF3 комплексом.