Посещений:
Piwi-взаимодействующие РНК

21U-РНК в зардышевой линии Caenorhabditis elegans
Wang, G. & Reinke, V. A.
C. elegans Piwi, PRG-1, regulates 21U-RNAs during spermatogenesis.
Curr. Biol. 18, 861–867 (2008) Article

Batista, P. J. et al.
PRG-1 and 21U-RNAs interact to form the piRNA complex required for fertility in C. elegans.
Mol. Cell 19 June 2008 (doi: 10.1016/j.molcel.2008.06.002) Article

Das, P. P. et al.
Piwi and piRNAs act upstream of an endogenous siRNA pathway to suppress Tc3 transposon mobility in the Caenorhabditis elegans germline.
Mol. Cell 19 June 2008 (doi: 10.1016/j.molcel.2008.06.003) Article


FURTHER READING

Stefani, G. & Slack, F. J.
Small non-coding RNAs in animal development.
Nature Rev. Mol. Cell Biol. 9, 219–230 (2008) Article

Hutvagner, G. & Simard, M. J.
Argonaute proteins: key players in RNA silencing.
Nature Rev. Mol. Cell Biol. 9, 22–32 (2008) Article


Piwi субкласс белков Argonaute ассоциирует с 24-30-nucleotide РНК, называемыми Piwi-interacting RNAs (piRNAs) у плодовых мух, рыбок данио, мышей и крыс. Три новых исследования описывают идентификацию родственных классов 21-nucleotide РНК, 21U-RNAs, в качестве piRNAs у Caenorhabditis elegans и предполагают, что Piwi и 21U-RNAs функционируют в зародышевой линии. i
C. elegans имеют два Piwi белка, PRG-1 и PRG-2. Оба гена были мутированы, что исследовать ранее предположенную роль Piwi белков в зародышевой линии. Данные Wang и Reinke указывают на то, что основной причиной снижения плодовитости у prg-1 мутантов является дефект сперматогенеза на очень поздней стадии. Напротив, две др. группы пришли к заключению, что Piwi выполняют широкую роль в гаметах как самцов. так и самок.
Итак, какой класс малых РНК у C. elegans представлен piRNAs? 21U-RNAs обладают некоторыми общими свойствами с piRNAs из плодовых мух и млекопитающих, поэтому попытались понять, зависят ли эти короткие РНК от Piwi. Das et al. получили библиотеку малых РНК от дикого типа и двойных мутантов (обозначенных как piwi мутанты), и установили, что 21U-RNAs или отсутствовали или присутствовали в низких количествах в библиотеке piwi-мутантов по сравнению с контрольной. Wang and Reinke тестировали уровни экспрессии двух 21U-RNAs, которые были редуцированы у prg-1 мутантов. Batista et al. and Das et al. использовали высокопроизводительное секвенирование популяций малых РНК из prg-1 и prg-2 мутантов и наблюдали драматическое истощение 21U-RNAs у мутантов по сравнению с червями дикого типа. Batista et al. также показали, что PRG-1 иммунопреципитаты сильно обогащены 21U-RNAs. Эти находки указывают на то, что PRG-1 скорее всего необходим для накопления всего класса 21U-RNAs.
Группы Batista et al. и Das et al. показали, что экспрессиия 21U-RNAs и PRG-1 ограничена зародышевой линией самцов и самок. Но как PRG-1 функционирует во время развития зародышевой линии? При сравнении изолированных гонад от самцов дикого типа и мутантов prg-1 Wang and Reinke установили, что потеря prg-1 вызывает заметное снижение экспрессии субнабора специфичных для сперматогенеза транскриптов. Batista et al. отмечают существенную позитивную регуляцию мРНК транспозона Tc3 у мутантов prg-1, которая также отмечалась Das et al., которые также показали значительное увеличение транспозиций Tc3 у этих мутантов - подтверждая тем самым роль Piwi в замалчивании транспозонов. в
Кажется вполне вероятным, что Piwi и 21U-RNAs участвуют в регуляции генов помимо регуляции мобильности транспозонов во время развития зародышевой линии. Однако вообще-то наиболее интригующим аспектом piRNAs у червей является отсутствие у них явных мишеней; среди более 15,000 типов piRNA, которые были обнаружены, единственная мишень транспозоны.
Сайт создан в системе uCoz