Посещений:
Трансляция

Наблюдение Одиночной Рибосомы
Jin-Der Wen, Laura Lancaster, Courtney Hodges, Ana-Carolina Zeri, Shige H. Yoshimura, Harry F. Noller, Carlos Bustamante & Ignacio Tinoco
Following translation by single ribosomes one codon at a time.
Nature 452, No 7187, 598-603(3 April 2008) (doi: 10.1038/nature06716)
Article
Из-за стохастической динамики рибосом необходимо анализировать одиночные рибосомы для изучения поэтапной трансляции мРНК. Wen et al. останавливали одиночную рибосому на 5'-конце шпилько-образной молекулы мРНК, которая удерживалась оптическими щипчиками. Это позволило авт. измерить трансляцию в реальном времени и достичь прогресса трансляции с помощью определения размера остаточной шпильки.
Трансляция не является непрерывным процессом; она следует паттерну повторяющихся транслокаций и пауз. Каждое транслокационное событие имеет размер ступени приблизительно в 3 основания (или один кодон) и происходит в течение менее 0.1 сек. Короткие врожденные паузы между событиями транслокаций занимают приблизительно 2.8 сек. и прекращаются, как только трансляция продолжается, с помощью более длинных пауз, которые длятся 1-2 мин. и которые могут быть важны для регуляции трансляции.
Анализ времени транслокаций выявил, что существуют три идентичных субступени в каждом транслокационном шаге. Единственным возможным объяснением является то, что рибосома движется поверх длины одного кодона с тремя субступенями на каждое основание. Авт. также продемонстрировали, что длины пауз, а значит и скорость трансляции, зависят от вторичной структуры мРНК; прикладываемые силы оптических щипчиков дестабилизируют вторичную структуру мРНК и снижают продолжительность пауз, но не влияют на время трансляции.
Это исследование первый проблеск в процессе трансляции с помощью одной рибосомы. Необходимо проведение сходных исследований с матрицами, которые более напоминают естественно возникающие мРНК. Из-за стохастической динамики рибосом необходимо анализировать одиночные рибосомы для изучения поэтапной трансляции мРНК. Wen et al. останавливали одиночную рибосому на 5'-конце шпилько-образной молекулы мРНК, которая удерживалась оптическими щипчиками. Это позволило авт. измерить трансляцию в реальном времени и достичь прогресса трансляции с помощью определения размера остаточной шпильки.
Трансляция не является непрерывным процессом; она следует паттерну повторяющихся транслокаций и пауз. Каждое транслокационное событие имеет размер ступени приблизительно в 3 основания (или один кодон) и происходит в течение менее 0.1 сек. Короткие вржденные паузы между событиями транслокаций занимают приблизительно 2.8 сек. и прекращаются, как только трансляция продолжается, с помощью более длинных пауз, которые длятся 1–2 мин. и которые могут быть важны для регуляции трансляции.
Анализ времени транслокаций выявил, что существуют три идентичных субступени в каждом транслокационном шаге. Единственным возможным объяснением является то, что рибосома движется поверх длины одного кодона с тремя субступенями на каждое основание. Авт. также продемонстрировали, что длины пауз, а значит и скорость трансляции, зависят от вторичной структуры мРНК; прикладываемые силы оптических щипчиков дестабилизируют вторисную структуру мРНК и снижают продолжительность пауз, но не влияют на время трансляции.
Это исследование первый проблеск в процессе трансляции с помощью одной рибосомы. Необходимо проведение сходных исследований с матрицами, которые более напоминают естественно возникаюющие мРНК.
Сайт создан в системе uCoz