Посещений:
ФОРМИРОВАНИЕ РЕСНИЧЕК

Внутрижгутиковый Транспорт

Ciliogenesis: building the cell's antenna
Hiroaki Ishikawa & Wallace F. Marshall
Nature Reviews Molecular Cell Biology 12, 222-234 (April 2011) | doi:10.1038/nrm3085

The cilium is a complex organelle, the assembly of which requires the coordination of motor-driven intraflagellar transport (IFT), membrane trafficking and selective import of cilium-specific proteins through a barrier at the ciliary transition zone. Recent findings provide insights into how cilia assemble and disassemble in synchrony with the cell cycle and how the balance of ciliary assembly and disassembly determines the steady-state ciliary length, with the inherent length-dependence of IFT rendering the ciliary assembly rate a decreasing function of length. As cilia are important in sensing and processing developmental signals and directing the flow of fluids such as mucus, defects in ciliogenesis and length control are likely to underlie a range of cilium-related human diseases.


Рис.1.
 |  The architecture of cilia.


Рис.2.
 |  The architecture of cilia.


Рис.3.
 |  The architecture of cilia.


Рис.4.
 |  The architecture of cilia.


Рис.5.
 |  The architecture of cilia.

Табл.1 Components of the intraflagellar transport system*

BOX.1 Cilia in physiology and disease

Реснички присутствуют почти на всех типах клеток тела человека (Fig. 1a-d). После многих лет игнорирования учеными ресничка появилась как ключевая органелла в многочисленных физиологических и онтогенетических процессах (Box 1). Реснички обусловливают перемещение слизи и ток спинномозговой жидкости, а также левонаправленный ток в узелке мыши. Реснички также действуют как 'антенны' для восприятия внеклеточных сигналов, таких как ростовые факторы, гормоны, одоранты и онтогенетические морфогены1, 2. Дефекты в сборке и функции ресничек приводят к широкому кругу болезненных симптомов у человека, включая поликистозную почечную болезнь, гидроцефалию и дегенерацию сетчатки (Box 1). Недавний взрыв интереса к болезням. связанным с ресничками, способствовал систематическому анализу состава белков ресничек; Однако хотя были открыты сотни белков ресничек в последние годы3, в большинстве случаев их функция остается неясной.
Ресничка состоит из стержневой, базирующейся на микротрубочках, наз. аксонемой (axoneme), которая окружена оболочкой реснички, которая являются продолжением плазматической оболочки клетки (Fig. 1e-g). Аксонема сконструирована из 9 параллельных дублетов микротрубочек, известных как наружные дублеты, которые удлиняются от базального тельца. На ультраструктурном уровне наилучшим отличительным признаком микротрубочек аксонемы является их структура в виде дублетов, которая состоит из родной полной микротрубочки (трубочка A), соединенной с неполной второй микротрубочкой (трубочка B ), состоящей из немногих протофиламент (Fig. 1f,g). Тубулин наружных дублетов является предметом многочисленных посттрансляционных модификаций, включая ацетилирование, глютамилирование и глицилирование (glycylation)4, которые, по-видимому, изменяют сборку и подвижность ресничек5-10. Помимо тубулина структурными компонентами дублетов являются tektins11 и protofilament (pf) лентовидные белки12, которые вносят вклад в дополнительные структуры, которые видны на дублетах при ЭМ13-15. Структура дублетов составляет основу высокой стабильности аксонемных микротрубочек, которые не распадаются спонтанно in vitro.
реснички обычно подразделяют на две категории, первичные и подвижные реснички. Одиночная первичная ресничка обнаруживается на апикальной поверхности большинства клеток тела человека. Первичные реснички неподвижны, но они могут ощущать физические и биохимические внеклеточные сигналы1, 2. Подвижные реснички присутствуют в большом количестве на поверхности эпителиальных клеток трахей, яйцеводов и кооперативно они колеблются в виде волнообразных паттернов, вызывающих перемещение жидкости. Чтобы управлять их движениями изгиба подвижные реснички имеют две дополнительные микротрубочки в центре аксонемы, называемые центральной парой, а также радиальные спицы и dynein плечи, прикрепленные к микротрубочкам дублетам (Fig. 1f). Жгутики обнаруживаются в одноклеточных эукариотах и спермиях, их первичной функцией является способность к передвижению. Поскольку структура жгутика идентична таковой подвижной реснички, то оба названия часто используют равнозначно.
Сборка ресничек осуществляется с помощью упорядоченного пути в несколько ступеней16, 17. Во-первых, формируется базальное тельце (или из предсуществующих центриолей или de novo), мигрирует к клеточной поверхности и закрепляется в кортексе, богатом актином. На пути к кортексу базальное тельце ассоциирует с мембранными пузырьками, последующее слияние которых с плазматической оболочкой, скорее всего, и создает цилиарный компартмент оболочки. Расположение и ориентация базального тельца диктует центровку возникающей в результате реснички. Затем базальное тельце обеспечивает зарождение (nucleates) выростов аксонемных микротрубочек, которые выпячиваются ниже расширения мембраны (оболочки), создавая ресничку. Дистальный регион базального тельца, где начинают формироваться наружные дублеты, наз. переходной зоной. Цилиарный карман, инвагинация плазматической оболочки клетки вокруг корня реснички, обнаруживается в некоторых типах клеток млекопитающих и у трипаносомид18. Сборка наружных дублетов происходит исключительно на дистальном конце реснички19. Поскольку весь белковый синтез ограничен цитоплазмой, то продолжение элонгации реснички нуждается в избирательном импорте и транспорте белков реснички в её кончик посредством внутрижгутикового транспорта (intraflagellar transport (IFT)), который является молекулярным моторами управляемым процессом. Единственное исключение в нужде IFT для образования ресничек обнаружено у определенных видов, таких как Plasmodium falciparum20, который собирает аксонему в цитоплазме и затем выталкивает её в выпячивание плазматической мембраны. Специализированная система транспорта белков из цитоплазмы в кончик реснички нужна в этом редком примере, т.к. кончик аксонемы плавает в цитоплазме.
Когда рост реснички заканчивается, ресничка остается высоко динамичной. Новые tubulin постоянно инкорпорируются на кончике реснички в динамическом равновесии21, но ресничка не удлиняется т.к. сборка сбалансирована за счет постоянной реорганизации21-23. Разборка микротрубочек на кончике , по-видимому, не происходит за счет спонтанной деполимеризации, но нуждается в активном механизме, который скорее всего, использует молекулярный мотор Kinesin-1324-26. Тот факт, что реснички постоянно реорганизуются, поэтому элементы аппарата сборки необходимы для поддержания длины реснички (see below). Т.к. механизмы сборки, указанные выше, общие подвижным и неподвижным ресничкам, то дефекты IFT или др. аспектов сборки ресничек нарушают разнообразные физиологические функции, включая функции, связанные с подвижными и сенсорными ресничками.

Intraflagellar transport


Как упоминалось выше, транспорт белков ресничек из цитоплазмы в кончик ресничек обеспечивается IFT, двунаправленное перемещение мультипротеиновых комплексов (наз. IFT частицы или IFT поезда) вдоль аксонемы27, 28 (Fig. 2). IFT впервые был описан с помощью differential interference contrast (DIC) микроскопии, как двунаправленное перемещение гранулы-подобных частиц вдоль жгутиков зеленой водоросли Chlamydomonas reinhardtii29. IFT поезда наблюдались с помощью трансмиссионной ЭМ, состоящие из различного числа электрон-непрозрачные частиц, собирающихся в линейные массивы, контактирующие с В трубочками наружных дублетов, и лежащими поверх оболочки реснички29, 30. Недавний электронный томографический анализ жгутиков C. reinhardtii выявил детальную ультраструктуру IFT поездов и сгруппировал их в два разных класса31. Один класс IFT довольно длинных поездов (около 700 nm) и менее электрон-непрозрачных с периодичностью частиц ~40 nm. Др. класс приблизительно 250 nm длиной, с ~16 nm периодичностью. Эти длинные и короткие IFT поезда, как было предположено, вносят вклад в антероградные (от основания к кончику) и ретроградный (от кончика к основанию) транспорт, соотв., базируясь на наблюдении, что короткие поезда исчезают у ретроградных IFT мутантов31. Было также предположено, что изменения в периодичности цастиц д. отражать различия в переносимых грузах.
IFT motors. Перемещение грузовых белков вдоль микротрубочек катализируется моторными белками kinesin и dynein, при этом каждый определенный белок кинезин или динеин является специфичным для перемещения в одном направлении, или в направлении плюс конца или в направлении минус конца. IFT управляется противоположными моторами: членами семейства Kinesin-2 и цитоплазматическим dynein 2 (ранее обозначался как цитоплазматический dynein 1b). IFT поезда перемещаются к кончику реснички (anterograde) с помощью Kinesin-2 , а возвращаются в тело клетки (retrograde) с помощью цитоплазматического dynein 2 (Refs 27, 32).
Два Kinesin-2 мотора, гетеротримерные и гомодимерные, как известно, вносят вклад в антероградный IFT. Каноническим антероградным IFT мотором является гетеротримерный Kinesin-2, который состоит из двух гетеродимеризованных двигательных субъединиц Kinesin-2 и дополнительной субъединицы, kinesin-associated protein (KAP)33. Гетеротримерный Kinesin-2 обязателен для сборки и поддержания ресничек и жгутиков у большинства организмов с ресничками30, 34-36. Напр., у C. reinhardtii, нулевой мутант по flagellar-assembly impaired 10 (fla10) (одной из моторных субъединиц гетеротримерного Kinesin-2) не может собирать жгутики, а температурочувствительный мутант fla10 подвергается резорбции жгутиков при рестриктивной температуре30. Однако, Caenorhabditis elegans с мутацией в kinesin-like protein 11 (klp-11) или kap-1 гетеротримерных Kinesin-2 субъединицах имеют полной длины сенсорные реснички, поскольку гомодимерный Kinesin-2 мотор osmotic avoidance abnormal 3 (OSM-3) обладает частично перекрываемой функцией с гетеротримерным Kinesin-2 (Refs 37, 38). Генетические исследования на C. elegans показали, что OSM-3 транспортирует клеточно-специфичные белки, которые вносят вклад в различия в морфологи и функции ресничек37, 39, 40.
Цитоплазматический dynein 2 является мультибелковым комплексом, который возвращает IFT поезда из кончиков ресничек. Нокдаун или мутация компонентов цитоплазматического dynein 2 у C. reinhardtii, C. elegans, и мышей вызывает образование коротких или приземистых ресничек и жгутиков, которые заполнены скопившимися IFT частицами41-47. Такое накопление белков в ресничках и жгутиках после нарушения цитоплазматического dynein 2 согласуется с его ролью в качестве мотора для ретроградного IFT.
IFT complex proteins. IFT частицы впервые были изолированы из жгутиков C. reinhardtii и было установлено существование двух крупных, биохимически различающихся комплексов, наз. IFT комплекс A и комплекс B48, 49. IFT комплекс A и B, по-видимому, перемещаются вместе внутри реснички, но они м.б. диссоциированы др. от др. in vitro. Последующее исследование идентифицировало дополнительный IFT белок, составляющий этих комплексов. IFT частицы конструируются, по крайней мере, из 20 белков; IFT комплекс A содержит 6 известных белков (IFT43, IFT121, IFT122, IFT139, IFT140 и IFT144) , а IFT комплекс B содержит 14 известных белков (IFT20, IFT22, IFT25, IFT27, IFT46, IFT52, IFT54, IFT57, IFT70, IFT74 (также известен как IFT72), IFT80, IFT81, IFT88 и IFT172) (Table 1 and reviewed in Refs 27, 28). Большинство из этих IFT белков законсервированы среди организмов с ресничками и обогащены доменами межбелковых взаимодействий50, 51. Фосфопротеин IFT25 был идентифицирован недавно52-54 и установлено его взаимодействие с IFT27, малой GTPase из RAB семейства55. У C. elegans, IFT22 гомолог (IFT-associated 2 (IFTA-2)) является RAB-подобным белком, который не требуется для образования ресничек, но, как было установлено, необходим для передачи сигналов с помощью пути insulin-подобного фактора роста56. IFT70, гомолог C. elegans аномального dye-filling 1 (DYF-1) (Ref. 57) и у рыбок данио Fleer (также известного как Ttc30a)6, недавно был идентифицирован как интегральный компонент IFT комплекса B у C. reinhardtii58. IFT70 также необходим для polyglutamylation тубулина и образования В трубочек наружных дублетов у C. elegans, рыбок данио и Tetrahymena6, 59.
Два IFT комплекса выполняют комплементарные, но самостоятельные части в транспорте белков ресничек. IFT комплекс B вносит вклад в антероградный транспорт и важен для сборки и поддержания ресничек и жгутиков (Fig. 2). В большинстве случаев потеря любого белка IFT комплекса B приводит к укорочению или отсутствию ресничек55, 60-67. Напротив, IFT комплекс A необходим для ретроградного транспорта, который возвращает белки в тело клетки для преобразования (turnover), но он, по-видимому, не нужен для сборки ресничек68-73. Напр., C. reinhardtii с мутациями в fla15 и fla17 (которые кодируют IFT144 и IFT139, соотв.) формирует жгутики, но они имеют аномальные выпячивания, которые содержат накапливаемые белки IFT комплекса B68, 73, 74. Сегодня неизвестно несут ли IFT комплексы A и B разные наборы грузовых белков и специфические роли большинства IFT белков остаются неохарактеризованными.
IFT complex accessory proteins. Хотя IFT белки обычно рассматриваются как белки, которые были идентифицированы посредством биохимического анализа очищенных IFT частиц48-50, некоторые исследования идентифицировали предполагаемые компоненты IFT частиц независимо от анализа этого типа. Здесь мы классифицировали эти дополнительные IFT белки как добавочные белки IFT комплексов. Белковые продукты C. elegans dye-filling-defective мутантов dyf-3 и dyf-13 были идентифицированы как дополнительные белки IFT комплекса B с помощью генетического и биоинформационного анализа75-78. DYF-13 может быть необходим, чтобы активировать OSM-3 Kinesin-2 путем доставки этого мотора в IFT комплекс B57. Мутация dyf-3 также картирована у qilin (также известных как cluap1) мутантов с кистозом почек у рыбок данио66.
Tubby-like protein 3 (TULP3) взаимодействует с IFT комплексом A и способствует локализации в ресничке субнабора из G protein-coupled receptors (GPCRs), таких как somatostatin receptor 3 (SSTR3) и melanin-concentrating hormone receptor 1 (MCHR1)79.
Некоторые белки Bardet-Biedl syndrome (BBS), продукты BBS генов, как было установлено, подвергаются IFT-подобному перемещению вдоль аксонемы ресничек57, 78, 80, 81. У C. elegans,мутации потери функции в bbs-7 и bbs-8 ведут к структурным и функциональным дефектам ресничек. Это может быть из-за того, что эти мутации вызывают фрагментацию скомбинированных IFT доставляемых частиц на отдельные IFT комплексы A и B, которые затем транспортируются отдельно с помощью гетеротримерных и гомодимерных Kinesin-2, соотв.57, 80. Хотя остается неясным, почему раздельный транспорт комплексов A и B д. вызывать дефекты ресничек, предполагается, что взаимодействие между двумя комплексами может регулировать некоторые аспекты транспорта грузов. У Bbs-нокаутных мышей, реснички сохраняются в многочисленных типах клеток, хотя кончики ресничек временами раздуты или заострены82-85. В культивируемых эпителиальных клетках не наблюдалось существенных отличий между контрольными и BBS-knockdown клетками, за исключением BBS1 и BBS5 малыми interfering RNA-обработанных клеток, которые оказались неспособны формировать реснички81, 86. Хотя вообще-то не нужные для образования ресничек, BBS белки могут облегчать транспорт специфичных для типа клеток мембранных белков, таких как SSTR3, MCHR1 и OSM-9, которые неспособны локализоваться в первичных ресничках Bbs-нокаутных мышей и у C. elegans bbs мутантов87, 88. Недавно, bbs мутанты были идентифицированы у C. reinhardtii. Эти мутанты собирали подвижные. нормальной длины жгутики, которые аномально накапливали некоторые предположительно сигнальные белки, такие как phopholipase D и Ser/Thr protein kinase89. Это наблюдение согласуется с гипотезой, что BBS белки транспортируют специфические для ресничек грузы, иные, чем обязательные для компонентов аксонем.

Ciliary trafficking


Т.к. молекулярный состав системы IFT постепенно проясняется, ключевой областью интересов становится вопрос, как эта система функционирует как целое, обеспечивая сборку ресничек и как IFT взаимодействуют с др. транспортными системами клетки, чтобы правильно доставлять грузы в ресничку.
Cargo transport by IFT. Потребность в IFT, рассмотренная выше, отражает потребность перемещать грузы, включая компоненты аксонем, белки оболочки ресничек и белки сигнальной трансдукции вдоль длины реснички. Несколько линий доказательств подтверждают эту гипотезу. Аксонемные белки, такие как dynein плечи, которые продуцируют силу для управления подвижностью ресничек, ко-иммунопреципитируются с IFT частицами в экстрактах из жгутиков C. reinhardtii90, указывая тем самым на прямую ассоциацию между этими грузовыми белками и аппаратом IFT. Когда IFT ингибируется с помощью сдвига в C. reinhardtii температурочувствительных fla10-мутантных клетках в условия непереносимой температуры, то жгутики медленно резорбируются и не могут расти без восстановления IFT30, 91. Т.о., самое меньшее, IFT д. переносить аксонемные компоненты в жгутики и он, скорее всего, транспортирует этот груз к месту сборки аксонемы, на кончик жгутика. Определенные мембранные белки, нагруженные green fluorescent protein (GFP), (включая transient receptor potential vanilloid (TRPV) каналы OSM-9 и OCR-2 у C. elegans и polycystic kidney disease 2 (PKD2) у C. reinhardtii) обнаруживают IFT-подобные движения92, 93. Поскольку основной функцией ресничек является ощущение окружающей среды, то факт, что важные локализованные в мембранах ресничек, рецепторы и каналы подвергаются активным перемещениям, представляет большой интерес, но с этой точки зрения функциональные последствия этого транспорта остаются неясными. Одна из возможностей заключается в том. что активное перемещение важно для достижения униформного распределения рецепторов и каналов на поверхности оболочки реснички.
Информация о роли IFT в поддержании ресничек получена благодаря экспериментам по доставке белка радиальных спиц у C. reinhardtii. Радиальные спицы мультибелковые комплексы, которые участвуют в регуляции подвижности жгутиков (Fig. 1f). Комплексы радиальных спиц частично собираются к теле клетки и доставляются в жгутики, где они полностью собираются после инкорпорации в аксонему90. В нормальных клетках полностью собранные комплексы радиальных спиц можно видеть в цитоплазме. но только если присутствуют жгутики, указывая, что комплексы спиц, собираемые в жгутиках, могут быть возвращены в цитоплазму. Однако, когда IFT выключается у температурочувствительных fla10 мутантов, то частично собранные комплексы радиальных спиц исчезают из жгутиков а продукты полностью собранных радиальных спиц накапливаются в растворимой фракции жгутиков, указывая тем самым, что IFT обычно доставляет эти собранные комплексы радиальных спиц из жгутика и что собранные радиальные спицы накапливаются в жгутиках, когда нарушен IFT 90.
Частичная супрессорная мутация IFT46 продуцирует клетки, которые не могут рекрутировать наружные dynein плечи в жгутики, подтверждая тем самым роль IFT в транспорте груза94, 95. Однако потребность в IFT, чтобы локализовать специфические аксонемные белки, может зависеть от определенных участвующих белков, т.к. внутренние dynein плечи, по-видимому, обладают более сильной потребностью в IFT, чем наружные dynein плечи96. Принимая во внимание большое количество белков, которые д. быть собраны в растущей ресничке, было бы удивительным, если бы IFT поезд сам соединялся избирательно с каждым из них. В самом деле, имеются доказательства специфических адапторных белков, которые сцепляют определенные грузы с IFT системой. Напр., outer dynein arm 16 (ODA16) специфически необходим для IFT-обеспечиваемого транспорта из наружных dynein плеч95, 97.
Недавно двухцветное прижизненное окрашивание BBS4-GFP и IFT20-mCherry жгутиков C. reinhardtii продемонстрировало, что BBS4 транспортируется с помощью IFT поездов. Это взаимодействие временное, т.к. BBS4 спорадически нагружается ('boards') и сгружается ('falls off') с движущихся поездов89. Такие временные взаимодействия, с быстрыми не облагаемыми налогами тарифами (off-rates), могут быть желательны для IFT-груз взаимодействий, т.к. они облегчают высвобождение груза, когда IFT состав достигает кончика реснички.
Membrane trafficking to cilia. Образование ресничек нуждается в транспорте мембранных белков, чтобы сконструировать специализированную мембрану (оболочку) реснички (Fig. 3). C. reinhardtii IFT20 и IFT54 (гомолог C. elegans DYF-11, млекопитающих MIPT3 и рыбок данио elipsa) участвуют в везикулярном транспорте из аппарата Гольджи в ресничку53, 67, 98. IFT20 на сегодня единственный IFT белок, который локализуется в Гольджи помимо ресничек и базальных телец67. IFT54 идентифицирован недавно как белок IFT комплекса B, который непосредственно взаимодействует с IFT20 (Refs 53, 98, 99). IFT54 взаимодействует также с RAB8 посредством rabaptin 5 (также известного как RABEP1), регулятором эндоцитоза. Малая GTPase RAB8 способствует доставке пузырьков и частично участвует в формировании ресничек81, 100. Умеренный нокдаун IFT20 в клетках млекопитающих снижает количество проницаемых для кальция катионовых каналов PKD2 в ресничках, вообще-то благодаря снижения транспорта из Гольджи67. Более того, у C. elegans dyf-11 мутантов, OSM-9 неправильно локализуется на дистальных дендритных концах нейронов с ресничками98.
BBS белки также могут участвовать в транспорте пузырьков из Гольджи в базальные тельца и реснички. По крайней мере, семь BBS белков, как было установлено, формируют комплексы (наз. BBSome; see Table 1), которые ассоциируют с мембраной ресничек и связывают Rabin8, guanine nucleotide exchange factor (GEF) для RAB8 (Ref. 81). BBSome также взаимодействуют с ARF-like 6 (Arl6; также известным как BBS3), GTPase, чтобы сформировать покровный комплекс, чтобы отсортировывать мембранные белки, такие как SSTR3, в реснички101. Более того, некоторые IFT и BBS белки обладают общими структурными компонентами с clathrin-adaptin and coat protein I (COPI), которые образуют временные каркасы, которые управляют образованиями из транспортных пузырьков. Это сходство указывает на то, что IFT и BBS белки и пузырьки. доставляющие белки, могут иметь сходные эволюционные корни и осуществлять аналогичные функции51, 101, 102. Более того, определенные IFT белки экспрессируются в клетках без ресничек103, 104 и необходимы для поляризованного преобразования T-cell receptor-CD3 комплексов в иммунных синапсах103. Эти находки указывают на то, что IFT белки выполняют и более общую роль во внутриклеточном мембранном транспорте.
Gating access to the cilium. Белковое содержание ресничек заметно отличается от такового общей цитоплазмы, указывая на присутствие селективного барьера в основании реснички. ЭМ показала, что оболочка реснички тесно ассоциирована с аксонемными микротрубочками в переходной зоне105 (Fig. 1e), это в принципе может препятствовать свободному проникновению растворимых белков. Прямой анализ диффузии белков оболочки реснички подтвердил существование диффузионного барьера у основания реснички. Роль septins106 - ассоциированных с мембраной белков, которые образуют барьеры для латеральной диффузии во время цитокинеза - участвуют в этом барьере. Более того, связанный с болезнями ресничек centrosomal protein of 290 kDa (CEP290), как недавно было показано, является компонентом связей между оболочкой и микротрубочками в переходной зоне, а мутации в CEP290 ведут к снижению барьерной функции105.
Помимо барьеров д. существовать механизмы, которые делают возможным корректное селективное прохождение барьеров субнаборами белков и проникновение в ресничку. Было предположено, что такое избирательное прохождение может напоминать ядерные поры (аппарат транспорта для перемещения грузов между ядром и цитоплазмой), по крайней мере, на функциональном уровне32. RAN присутствует в ресничке, а недавние эксперименты по экспрессии мутантного RAN в цитоплазме указывают на то, что RAN-GTP градиент может участвовать в импорте белков ресничек аналогично способу, который действует при импорте в ядро107. При ядерном импорте ядерные поры сами по себе не обладают избирательными детерминантами, которые вместо этого присущи импортинам и ассоциированному аппарату, которые распознает сигналы ядерного импорта. Для реснички вполне возможно, что IFT частицы осуществляют селективное распознание грузов и затем используют свою активную подвижность, чтобы переправить этот груз через диффузионный барьер в переходной зоне.
Дальнейшая аналогия с ядерными порами, были предприняты пространные попытки идентифицировать цилиарный эквивалент ядерному локализационному сигналу (nuclear localization signal (NLS)). Такие исследования выявили сигналы направления в ресничку у ряда различных белков ресничек, включая PKD2, fibrocystin и rhodopsin88, 108-112. Однако в настоящее время нет четкого консенсуса последовательности, которая предопределяет локализацию в ресничке, а белковый аппарат, который детектирует эти индивидуальные направляющие последовательности также ещё предстоит определить. Более детальное обсуждение доставки белков в ресничку см в последнем обзоре Nachury et al.113.

Regulation of ciliogenesis


Т.к. для формирования ресничек необходима сложная программа синтеза и сборки макромолекул, поэтому она д. тщательно регулироваться. В делящихся клетках ресничка разбирается перед клеточным делением и центриоли наследуются дочерними клетками, в которых они действуют как матрицы для следующей генерации ресничек. Цилиогенез также регулируется в ответ на слияние клеток, ток жидкости114, 115 и распластывание клеток116.
Цикл рождения, роста и гибели реснички плохо изучен механистически. Однако динамические структуры, такие как реснички, имеют три потенциальные контрольные точки, в которые их сборка и разборка могут регулироваться: синтез предшественников; транспорт и сборка предшественников в растущую структуру; и динамическое поддержание этой структуры. Клетки используют все три контрольные точки, чтобы регулировать присутствие или отсутствие реснички.
Controlling the timing of ciliogenesis. Реснички обычно образуются во время G1 или G0 и разбираются приблизительно во время митоза (Fig. 4). Этот цикл не происходит в клетках со многими ресничками, которые дифференцируются окончательно и не подвергаются делениям. Причины циклов сборки и разборки реснички остаются неясными, хотя существует возможное объяснение, что разборка гарантирует собственно образование митотического веретена. Т.к. центриоли, которые специфицируют расположение полюсов веретена, прикреплены к основанию реснички, то изменение положения центриолей в глубину клетки обычно требует удаления реснички. Удаление ресничек перед делением может быть достигнуто с помощью двух механизмов, которые могут действовать одновременно. Один механизм связан с отщеплением реснички от центриоли, процесс, который использует katanin-обеспечиваемую разрезку дублетов микротрубочек в месте соединения между базальным тельцем и переходной зоной117. Альтернативно, реснички могут быть резорбированы путем разборки с кончика реснички. Этот активный механизм разборки регулируется с помощью собственного пути сигнальной трансдукции26, 118, 119. Два белка, которые недавно были обнаружены, регулируют разборку ресничек, это с базальным тельцем ассоциированный белок Pitchfork120 и каркасный белок human enhancer of filamentation 1 (HEF1)121, они обеспечивают резорбцию ресничек путем взаимодействия с Aurora A киназой. Aurora A, в свою очередь, может осуществлять некоторые из своих эффектов на разборку ресничек за счет позитивной регуляции tubulin деацетилазы histone deacetylase 6 (HDAC6)121, 122; снижение ацетилирования тубулина снижает стабильность микротрубочек. Время возобновления роста ресничек также тонко регулируется стадией клеточного цикла и возрастом центриолей, более старые центриоли формируют реснички быстрее, чем более молодые123.
Регулируемый синтез белков, специфичных для ресничек является др. ключевым регулятором цилиогенеза124, молекулярные основы которого понятны не до конца. Несколько сотен генов активируются, когда клетка формирует реснички125. Эта регуляция, по-видимому, использует транскрипционный фактор regulatory factor X (RFX) аномального образования dauer formation 19 (DAF-19) у C. elegans76 и forkhead box J1 (FOXJ1) в клетках позвоночных с подвижными ресничками126.
IFT control of ciliogenesis. После того как синтезируются цилиарные предшественники, такие как тубулин, они д. транспортироваться в ресничку из цитоплазмы и двигаться к месту сборки на кончик реснички с помощью IFT системы. Сложность аппарата IFT представляет многочисленные потенциальные точки для контроля образования ресничек; в самом деле, различные IFT параметры. такие как размер IFT состава и скорость, периодичность поступления составов и отбор грузов, скорее всего регулируются с помощью ещё неохарактеризованных механизмов.
Растущие реснички нуждаются в значительных количествах аксонемных предшественников на их кончиках, чтобы реснички оставались в устойчивом состоянии91, это указывает на необходимость регуляции транспорта. Во время регенерации жгутиков у C. reinhardtii, размер IFT поездов снижается по мере увеличения длины жгутика (Fig. 5a), тогда как частота IFT остается независимой от длины жгутика127. Т.о., кончики растущих жгутиков получают множество строительных материалов, доставляемых с помощью больших IFT составов с большей способностью переноса грузов. Однако пока неизвестно, как регулируется размер IFT составов. Т.к. большинство IFT белков и аксонемных белков накапливается в основании ресничек53, 90, то возможно. что сборка антероградных IFT поездов и избирательная загрузка происходит в переходной зоне, которая морфологически отличная область аксонемы, которая соединяет жгутик с базальным тельцем.
Регуляция IFT составов также, скорее всего, происходит в кончиках ресничек, где составы поворачивают и переключаются с Kinesin-2-управляемого на цитоплазматический dynein 2-управляемый локомотив. У C. reinhardtii, IFT172 участвует в обеспечении перехода на кончике с антероградного на ретроградный IFT128, 129. Предложена модель поворота IFT, согласно которой удаление Kinesin-2 от поезда в кончике жгутика базируется на ингибировании цитоплазматического dynein 2, делающего возможным ретроградный транспорт127. Однако эта модель нуждается в дополнительных исследованиях и подтверждена только в наблюдениях на C. reinhardtii, что KAP-GFP доказывает очень немногие события ретроградного транспорта и что Kinesin-2 может покидать жгутики в мутантных клетках, лишенных ретроградных IFT составов, при электронной томографии31 , это может быть использовано для тестирования моделей регуляции IFT на кончиках ресничек.
Среди IFT белков, IFT27 (Ref. 55), по-видимому, является вероятной мишенью IFT регуляции, поскольку является малой GTPase из семейства RAB, др. члены которого выполняют ключевые регуляторные роли в различных клеточных процессах доставки компонентов мембран. Понимание того, как состояние нуклеотидов в IFT27 регулирует IFT, и как вышестоящие факторы модулируют гидролиз IFT27 нуклеотидов, является очень важным для оценки регуляции цилиогенеза на уровне транспорта.
Molecular pathways controlling ciliary length. Те же самые три контрольные точки, которые могут быть переключены вкл. и выкл., чтобы сформировать или удалить реснички (синтез предшественников, IFT и оборот на кончике реснички) могут быть также модулированы менее крайним образом, чтобы контролировать постоянную длину ресничек.
Длина ресничек безусловно является предметом биологической регуляции, т.к. разные типы клеток обладают ресничками разной средней длины. Для подвижных ресничек, вполне возможно, что генерация формы волны ресничкой, также как и гидродинамические взаимодействия реснички с окружающей жидкостью, могут быть строгой функцией длины реснички. Следовательно, клетки данного типа будут иметь оптимальную длину ресничек, чтобы генерировать желательный тип биений ресничек и ток жидкости. Для каждой данной частоты биений скорость тока жидкости, генерируемого ресничками, может быть предсказана снижением функции от длины реснички, так что реснички, которые слишком длинные будут неспособны генерировать эффективный ток132. Для сенсорных ресничек менее очевидно, как длина ресничек может влиять на их функцию, но это может быть обусловлено нашим в настоящее время невежеством относительно телеологических причин использования ресничек для сенсорных функций. Некоторые болезни, связанные с ресничками, и модели болезней, по-видимому, вызывают отклонения в длине ресничек; это предоставляет информацию о молекулярных путях, которые могут контролировать длину ресничек. Напр., нокаут по tuberous sclerosis 1 (Tsc1)- или Tsc2 у мышей и нокдаун tsc1a у рыбок данио ведет к развитию почечных кист, при этом реснички длиннее, чем в клетках дикого типа133, 134, 135. Retinitis pigementosa 1 (RP1), как было установлено, также влияет на длину ресничек по сравнению с контролем136, как и белки, связанные с Meckel-Gruber синдромом Meckel syndrome 1 (MKS1) и MKS3 (также известен как meckelin и TMEM67) и nephronophthisis-related protein nephrocystin 4 (Refs 137, 138). До тех пор, пока механизмы определяющие длину ресничек не будут установлены, будет трудно вычленить прямое влияние отклонений в длине из др. эффектов этих мутаций, вызывающих болезнь.
Генетический скрининг C. reinhardtii выявил ряд мутаций, которые изменяют длину жгутиков и ресничек. которые были сгруппированы в 'short flagella' (shf) и 'long flagella' (lf) группы мутантов (Ref. 139). Некоторые гены, мутации которых приводят к длинным жгутикам, были клонированы, два из них кодируют киназы. Один из них член семейства cyclin-dependent kinase (CDK) наз. LF2 , а др. член семейства mitogen-activated protein (MAP) назван LF4 (Refs 140, 141), но их мишени неизвестны. Многие элементы этого генетического пути контроля длины, по-видимому, законсервированы у млекопитающих, включая ортолог LF4 млекопитающих, названный male germ cell-associated kinase (MAK), ортолог LF2 позвоночных, названный cell cycle-related kinase (CCRK) , и её партнер по связыванию, broad-minded136, 142. Несмотря на долгие годы исследований по генетическому анализу и постоянно увеличивающийся список генов, эти исследования не выявили действительного механизма, с помощью которого регулируется длина ресничек. Биохимические и исследования ингибиторов выявили участие и др. киназ, особенно glycogen synthase kinase 3? (GSK3?), и кальцием опосредованных сигнальных путей в контроле длины115, 119, 143, 144, но их функциональные мишени не6ясны и снова такие исследования не выясняли непосредственно механизма контроля длины (Fig. 5b), и в настоящее время нет доказательств, что активность любой из этих молекул связана с длиной ресничек.
Theoretical models for ciliary length control. Отсутствие механистической информации об индивидуальных функциях генов побудило к созданию теоретических моделей контроля длины в терминах клеточных процессов скорее, чем специфических молекул21, 91, 145-147. Современные модели контроля длины базируются на наблюдениях, что сборка ресничек на кончиках происходит не только когда ресничка растет, но и продолжается после того, как ресничка достигнет финальной длины21, 22, 23, 148. Эта устойчивая сборка сбалансирована благодаря непрерывному удалению субъединиц с кончика реснички. Непрерывная сборка и разборка реснички на её кончике ведет к её постоянному обновлению в устойчивом состоянии. Устойчивость сборки требует. чтобы IFT предоставлял новые аксонемные субъединицы21, 96, и если IFT будет выключен по всей длине реснички, то ресничка немедленно начнет резорбироваться30. Резорбция, которая происходит, когда IFT останавливается, происходит с постоянной скоростью в течение всего процесса резорбции. Это указывает на то, что скорость разборки на кончике не зависит от длины реснички21.
Поскольку сборка и разборка происходят постоянно в стационарном состоянии, то длина ресничек может поддерживаться только, если две скорости равны др. др. Т.к. разборка не зависит от длины безотносительно существующего механизма в ресничке, то чтобы регулировать длину д. действовать модулирование процесса сборки. Сборка, по-видимому, по крайней мере частично, предопределяется IFT, исходя из наблюдений, что частичное снижение скорости IFT дает реснички укороченной длины21. Следовательно, если длина есть результат баланса сборки и разборки, а разборка не зависит от длины, а сборка диктуется транспортом, то проблема контроля длины сводится к проблеме того, как IFT регулируется как функция длины реснички для того, чтобы достичь специфического стационарного равновесия длины. Одна из простых моделей контроля длины базируется на находке, что общее количество IFT белка в ресничке не зависит от длины реснички21. Это подразумевает, что количество IFT частиц в ресничке не зависит от её длины, хотя мы установили, что эти частицы, сгруппированные в небольшие или большие IFT поезда, коррелируют с длиной реснички127. Ясно, что время, затрачиваемое одиночной IFT частицей, чтобы переместиться со своим грузом из тела клетки в кончик, освободиться от своего груза и затем отправиться обратно в тело клетки, чтобы получить ещё груз, пропорционально длине - то более отдаленная частица будет путешествовать дольше. Следовательно, частота, с которой данная частица сможет доставить груз в кончик снижается по мере увеличения длины реснички. Если количество частиц постоянно, то нетто-коэффициент доставки груза с помощью IFT будет уменьшаться по мере увеличению длины реснички. Частота прибытия IFT поезда в кончик остается постоянной, то IFT частицы д. быть перераспределены в более короткие составы с пониженной способностью перевозить грузы. Исходя из того, что транспорт становится ограниченным скоростью по мере роста жгутика, мы приходим к заключению, что в состоянии устойчивости скорость сборки д. снижаться как функция длины. Должно существовать только единственное значение для длины, при которой зависимая от длины скорость сборки и независимой от длины разборки будут в точности сбалансированы, приводя к уникальному решению стабильности для стационарного состояния (Fig. 5a). Эта точка баланса ('balance-point') предопределяется скоростью транспорта, а также скоростью обновления (turnover). Некоторые специфические предсказания этой модели, напр., зависимость длины от количества жгутиков на клетку, подтверждены в экспериментальных тестах91.
Эта модель вступает в конфликт с сообщениями, что клетки, содержащие fla10-1 мутацию в моторной субъединице Kinesin-2 могут при определенных условиях иметь жгутики нормальной длины, несмотря на снижение уровней Kinesin-2 в жгутиках149. Однако это инициальное сообщение базировалось на количествах FLA10, которые были связаны с изолированными аксонемами, тогда как мы сегодня считаем, что кинезиновый мотор не является аксонемным компонентом, а скорее частью растворимой мембранной и матричной фракции ('membrane and matrix fraction')150. Дальнейший анализ fla10-1 мутантов при пермиссивной температуре показал, что, фактически, имеется мало или отсутствует уменьшение уровней IFT белков в жгутиках этих мутантов по сравнению с таковыми дикого типа30, 36, 52. Более того, наблюдения за живыми клетками показали, что ни скорость, ни частота IFT поездов достоверно не нарушены у fla10-1 мутантов при пермиссивной температуре68. Наконец. было показано, что частичное снижение функции FLA10, получаемое с усилением условных fla10 аллелей при промежуточных температурах между пермиссивной и полностью непереносимой температурой, дают жгутики промежуточной длины91, тем самым подтверждая роль IFT в регуляции длины жгутиков.
Эта модель точки баланса, базирующаяся на IFT и turnover приводит к открытому критическому вопросу, какова система поддержания постоянного количества IFT белков на ресничку. Мы предположили, что многие из генов, идентифицированные при скрининге мутантов, влияющих на длину, может использоваться в регуляции величины IFT. Один такой изменяющий рост мутант, lf3, идентифицированный при генетическом скрининге C. reinhardtii, как было предположено, влияет на уровни IFT белка в жгутике151, исходя из детекции увеличенных уровней IFT белков относительно уровней всех белков в жгутике мутантов lf3. Однако этот специфический аллель гена LF3 заставляет клетки формировать аномально короткий жгутик, это означает, что если одинаковый общий уровень белков жгутика загружается на гель, то колодцы (wells), загружаемыеlf3 будут содержать белки от значительно большего количества жгутиков, чем контрольные wells. Т.к. содержание IFT белка на жгутик не зависит от длины, то wells, загруженные выборкой от C. reinhardtii с более короткими жгутиками, будут содержать больше IFT белка, благодаря более высокому числу жгутиков, которые были загружены. Такие результаты не могут служить доказательством того, что LF3 ген действует, контролируя IFT. Помимо удержания количественно постоянным IFT, скорость IFT, по-видимому, не меняется драматически с длиной жгутика, как это достигается, даже когда состояние загрузки груза может существенно меняться во время роста ресничек, остается неясным. В некоторых системах взаимодействие между разными Kinesin-2 моторами может может участвовать в регуляции скорости38.
Рассматривая механизмы контроля длины, мы также д. задать вопрос, могут ли механизмы, которые регулируют устойчивое состояние длины в зрелых ресничках, нуждаться в том же самом, как и механизмы, которые контролируют увеличение длины во время роста ресничек. Когда ресничка достигает необходимой длины, то она должна, в принципе, возможно отключить оборот (turnover) аксонемных микротрубочек, после 'locking-in' длины реснички. В этом случае, истощение аппарата IFT или снижение синтеза аксонемных предшественников д. оказывать существенно меньший эффект на длину ресничек. Поэтому было бы интересно, провести детальные измерения скорости оборота в ресничке и транспорта как во время сборки, так и зрелого состояния реснички, чтобы выявить обнаружимые различия.

Conclusions


The assembly of cilia is a complex and fascinating process that is only now starting to be understood. The field has made great progress in enumerating the list of parts of the cilium itself and of the components of the IFT system that promotes ciliary assembly. By contrast, still very little is known about how these parts function and work together. A major goal of research on IFT must now be to determine what the individual proteins are actually doing, in terms of enzymatic functions and regulated interactions. At the same time, there is a clear need for integrative models to understand how the huge, and still-increasing, number of trafficking components and pathways all work together to produce the highly regulated assembly and disassembly of cilia.
Сайт создан в системе uCoz