Посещений:
del22q11 (DiGeorge) syndrome
ДиГеорга синдром:Генетическая обусловленность


VEGF: a modifier of the del22q11 (DiGeorge) syndrome.
Stalmans, I. et al.
Nature Med. 21 Jan 2003 (doi:10.1038/nm819) | PubMed
В вопросе о выяснении генетических причин DiGeorge syndrome, как полагают, Ingeborg Stalmans, Diether Lambrechts и др., важна идентификация модификаторов синдрома.

Когда было установлено, что большинство пациентов с синдромом DiGeorge имеют длецию в 3 million пар оснований в хромосоме 22, то стало казаться довольно очевидным, что гаплонедостаточность одного или нескольких генов в гемизиготной области (22q11) является его причиной. Исследования на мышах выявили ген транскрипционного фактора Tbx1 — ортолог TBX1 у людей — как главный подозреваемый.
Однако, этому противоречило то, что у некоторых пациентов с синдромом DiGeorge в отсутствие большой делеции гены TBX1 выглядели нормальными. Крайние фенотипические варианты синдрома также указывали на то, что TBX1 м. иметь сообщника или сообщников, которые были неизвестны.
Синдром DiGeorge характеризуется угрожающими жизни сердечно-сосудистыми врожденными дефектами, а также черепно-лицевыми, тимусными и паратироидными дефектами. Поэтому авт. анализировали ген, кодирующий vascular enthothelial growth factor (VEGF) из-за его критической роли в ангиогенезе и устанолили, что он является потенциальным сообщником.
Многообещающим казалось то, что врожденные дефекты у гомозиготных Vegf-мутантных мышей (Vegf120/120 и у Vegf188/188) были очень сходны с таковыми у пациентов с синдромом DiGeorge. Более того, авт. нашли, что горячие точки экспрессии Vegf коррелируют с местами, затрагиваемыми у индивидов с делецией del22q11.
Исследования на мышах предоставили хорошие доказательства того, что VEGF участвует в формировании синдрома DiGeorge, но более прямые указания получены на рыбках данио. Stalmans, Lambrechts и др. показали, что прогрессивный knock-down экспрессиии vegf, опять же на фоне постоянной дозы tbx1-специфического morpholino, дает в результате все увеличивающиеся по тяжести дефекты сердца.
Доказательства, полученные с помощью животных моделей, строги, но авт. было необходимо убедиться, что VEGF является столь же важным и для людей с синромом DiGeorge. Они целенаправленно изучали single nucleotide polymorphisms (SNPs) в промоторе и 5' нетранслируемой области VEGF, которая как известно подавляет экспрессию. Генотипирование 91 случая с DiGeorge и 316 неродственных контрольных людей по этому полиморфизму показало критическую роль для одного из аллелей (-1154A) в предопределении чувствительности пациентов с DiGeorge к сердечно-сосудистым дефектам, однако нельзя исключить участие и других.
Итак, VEGF — который картируется вне хромосомной области 22, которая делетируется у большинства del22q11 пациентов — является модификатором врожденных дефектов при этом синдроме.
Хотя их данные по ассоциации нуждаются в дальнейшем подтверждении при исследовании больших популяций, успех авт. в комбинированном генетическом подходе открывает широкие возможности, которые м.б. использованы для выяснения неблагоприятных генетических влияний и на др. сложные заболевания.
В большинстве случаев DGS проявляется спорадически, но имеются сообщения о семейных случаях этого синдрома. Предполагается аутосомно доминантный, аутосомно рецессивный и Х-сцепленный тип наследования. Было предположено, что DGS обусловливается гаплонедостаточностью по гену в районе 22q11 (см.Таб 2 в работе (Demczuk & Aurias, 1995) или выдержку из этой таблицы лишь с интерстициальными делециямиТабл.2. Проверка пациентов DGS с кажущимися нормальными хромосомами с использованием молекулярных зондов из проксимальной части хромосомы 22 показало, что свыше 90% пациентов имеет делецию 22q11.2(Carey et al.,1992;Desmaze et al.,1993; Driscoll et al.,1992; Goldmuntz et al.,1993)
     Описан случай DGS, связанный с делецией в области 22q11.2 настолько малой, что она не выявляется при кариотипическом анализе. 3 группами исследователей определены границы критической для DGS области (см. Рис. в работе(Demczuk & Aurias, 1995).Длина микроделеций была несколько отличной, но во всех случаях в нее входили участки N25(D22S75), H160B(D22S66) и R32(D22S259). Вместе эти зонды перекрывают около 1.6 мегабэйс геномной ДНК, которая оказывается делетированной у 30 из 33 пациентов DGS. Критическая область, ограниченая разрывами в pH11(D22S36)и t(X:22)областях и в рН11 и t(15;22), выявлена при анализе сбалансированной и несбалансированной транслокации. В результате критическую для DGS область (DG Critical Region = DGCR) удалось ограничить 200 т.п.н, в другой группе = 300 и в третьей - две DGCR= 500 т.п.н.(pBS84-4 м точка разрыва GM0578 t(10.22). Отмечается присутствие семейств повторяющихся последовательностей на каждой из сторон делеции. Предполагается, что эти мейтически нестабильные области часто могут приводить к негомологичной рекомбинации.

Делетированная область, называемая критической для синдрома ДиГеорга (DGCR), имеет протяженность в 1.2 Mb и содержит около 30 генов.
     В области нехвати расположены гены, перечисленные от дистального к проксималному концу: LZTR-1 (он не попадает внутрь DGCR, но делетирован у 7 из 8 проанализированных CATCH 22 пациентов, кодирует белок в 552 аминокислоты, гомологичный гену tramtrunk дрозофилы, репрессирующего гомеобоксный ген fushi-tarazu); ZNF74/cos40 ( делетирован у 23 из 24 DGS пациентов, содержит мотив цинковые пальчики Cys2-His2 Kruppel/TFIIIA семейства,регулятор транскрипции экспрессируется у плодов мыши и человека); Catechl-Oomethyl-transferase (COMT) (фермент, катализирующий метаболизм катехоламинов таких как норэпинефрин, эпинефрин и дофамин до О-мктил эфиров. Предполагается, что пациенты VCFS несут аллель СОМТ с низкой активностью); HP500/D22S134 (зонд, его последовательности обнаруживают частичную гомологию с геном цепи предшественника проколлагена а2 (IV)человека и мыши); Т10 (выделен из кдНК мыши, но не человека. Кодирует белок в 276 аминокислот, который экспрессируется в реннем эмбриогенезе в зачатках рта: трахеи, легких, вело-фарингеальной области, артериальном стволе.печени. нижних конечностях и др. Делетирован у 78/80 DGS и 16/21 VCFS пациентов, но не является частью критической области); Glycoprotein Ibbeta (основной рецептор тромбоцитов фактора Виллебранда, картируется непосредственно дистальнее DGCR);TUPLE1 (транскрипт в 3,4 т.п.н. выявляется во всех исследованных тканях плода человека. Белок в 766 аминокислот, по-видимому, частично отвечает за фенотип DGS);HIRA (кодирует белок в 1017 аминокислот, полностью аналогичен TUPLE1); DGCR2 ((DiGeorge syndrome critical region gene 2)ген в 4,4 т.п.н. кодирует белок в 550 аминоксилот, его 3' конец картируется на 10 т.п.н. теломернее от точки разрыва ADU и следователно, не разрывается транслокацией. Часто затронут у пациентов DGS.Предполагается, что этот белок адгезивным рецептором и способствует миграции клеток нервного гребня в глоточные карманы. Предполагается, что гаплонедостаточность по этому гену ведет к недостатку адгезивных рецепторов и неспособности поддерживать миграцию достаточного количества клеток нервного гребня).
    Картирован человеческий гомолог в DGCR гена для транспортного белка цитрата грызунов.Неясно, участвует ли этот ген citrate transport protein в DGS или других синдромов, связанных с делецией 22q11 (Goldmuntz et al., 1996).
    Идентифицирован, клонирован и охарактеризован TBX1 ген человека,который картируется в DiGeorge chromosomal region. TBX1 является членом филогенетич. законсервированного семейства генов с общим связывающим ДНК доменом( T-box). T-box гены являются транскрипционными факторами,регулирующими процессы развития. Выявлено 98% идентичных аминокислот между белками TBX1 человека и мыши в целом и T-box домене. Белки отличны лишь по 2 аминокислотам. Экспрессия TBX1 человека во взрослых и плодных тканях сходна с таковой у мышей. Используя 3'RACE, получены по разному сплайсированные мРНК во взрослых скелетных мышцах. Ген Tbx1 мыши экспрессируется во время раннего эмбриогенеза в глоточных дугах, карманах и слуховом пузырьке. Позднее его экспрессия обнаруживается в позвоночном столбе и зачатках зубов. Ген TBX1 человека является геном кандидатом, отвечающим за некоторые признаки при 22q11 делеционном синдроме (Chieffo et al., 1997).
    Характерные признаки,такие как черепно-лицевые, кардиальные и тимусные нарушения, возникающие в результате взаимодействия между клетками нервного гребня заднего мозга и энтодермой глоточных карманов. Выделено несколько эмбриональных кДНК DiGeorge syndrome candidate gene HIRA. Идентифицировано несколько альтернативно сплайсированных транскриптов. Секвенирование показало, что Hira обнаруживает гомологию с p60 субъединицей human Chromatin Assembly Factor I и hir1p и Hir2p генов дрожжей, подтверждается, что Hira может играть определенную роль в сборке хроматина и/или регуляции гистонов.Было установлено, что Hira экспрессируется повсеместно.Однако более высокие уровни транскриптов обнаруживаются в краниальных нервных складках, фтронтоназальных массах и первых двух фарингеальных дугах, окологлоточных клетках нервного гребня и зачатках конечностей. Предполагается, что гаплонедостаточность по HIRA вносит свой вклад ,по крайней мере, в возникновение некоторых признаков DiGeorge [Wilming et al., 1997).
    Выявлена самая маленькая делеция связанная с DG синдромом , это 250 kb область , the minimal DGS critical region (MDGCR), которая включает в себя локус D22S75 (N25). Выделен и охарактеризован новый, чрезвычайно консервативный ген , DGSI,внутри MDGCR. DGSI имеет 10 экзонов и 9 интронов encompassing 1702 bp of cDNA sequence and 11 kb of genomic DNA. кодируемый белок состоит из 476 аминокислот предположительно с М.в. в 52.6 kDa. Анализ границ intron-exon выявил consensus GT/AG мотив.Соответствующий ген мыши Dgsi выделен и локализован в проксимальной части хромосомы 16. Ген мыши содержит те же самы экзоны и интроны и кодирует белок в 479 аминокислот с 93.2% сходством с человечьим DGSI геном. Существенная гомологич обнаружена с Caenorhabditis elegans белком F42H10.7. Проведен мутационный анализ 16 пациентов , у которых не обнаруживалась делеция 22q11.2 и некоторые характерные клинические признаки DGS/VCFS. Выявлено 8 вариантов последовательностей в гене DGSI. Они обнаруживались в 5'-нетранслируемой области, кодирующей области и интронных областях, соседних с границами игтрон/экзон. 7 изи 8 вариантов обнаружены у нормальных контрольных или у незатронутых членов семей Это указывает на то, что они не могут иметь этиологического значения (Gong et al., 1997).
     Идентифицирована de novo конституциональная сбалансированная транслокация в DIGeorge syndrome/velocardiofacial syndrome (DGS/VCFS) minimal critical region (MDGCR) . Пациент имеет некоторые признаки, характерные для DGS/VCFS, включая: facial dysmorphia, mental retardation, long slender digits and genital anomalies. Точки разрывов этой транслокации были клонированы и было установлено, что она разрывает ген clathrin heavy chain-like (CLTCL) внутри MDGCR. Другая точка разрыва транслокации приходится на повторяющуюся область, расположенную ближе к теломеру, чем rDNA кластер на хромосоме 21p. След., маловероятно, что этот второй разрыв последовательностей в 21p может обусловливать фенотипические аномалии. Точка разрыва в chromosome 22 , разрывает 3' кодирующую область гена CLTCL и ведет к считыванию укороченных транскриптов. Это указывает на то, что именно нарушения этого гена отвечают за аномальный фенотип у данного пациента . Более того частичный DGS/VCFS фенотип у данного пациента указывает на то, что за дополнительные фенотипические отклонения DGS/VCFS должны отвечать другие гены из области phenotype MDGCR. Таким образом, гаплонедостаточность более чем по одному гену в MDGCR может быть причиной (etiologic) DGS/VCFS (Holms et al., 1997).
    Тем не менее описаны и другие цитогенетические аномалии, ассоциированные с DGS, в частности моносомии 10р13(см.Таб 2 в работе (Demczuk & Aurias, 1995) Всего 10 DGS пациентов описано с 10р13 делециями, при этом кардиальные дефекты не были связаны с крупными сосудами у одного и отсутствовали у двух.Гипокальцемия проявлялась у всех, аплазия тимуса или иммунодефицит обнаружены у всех за исключением одного случая. Признаки дисморфии лица были другими. Следоватльно еще, один локус обусловливает DGS-подобную патологию в 10р13 области.

Сайт создан в системе uCoz