A predominant role for the HLA class II region in the association of the MHC region with multiple sclerosis
Nature Genet. 37, 1108–1112 (2005) | ||
 (Рис.1.Из статьи Lincoln et al.) | Conditional logistic regression analysis of SNPs spanning the MHC genomic region.  (Табл.1) | Conditional logistic regression analysis of SNPs spanning the MHC genomic region.  (Рис.1.Из статьи D.Reich et al.) | Results of the genome-wide admixture scan  (Рис.2.) | The strongest peak of association spans the centromere of chromosome 1.  (Рис.3) | The 95% credible intervals for increased risk due to European ancestry at the chromosome 1 locus, for all African Americans (n = 605), all Afro-Caribbeans (n = 143) and both cohorts together (n = 748). (Табл.1) | Summary of results from admixture scans (Табл.2) | Summary of main scan results by chromosome (Табл.3) | Risk models evaluated in main admixture scan |
Установлено, что рассеянный склероз является наследственным заболеванием. Тем не менее, гены, контролирующие это расстройство, не были идентифицированы. Исследования, выполненные авторами, - один из шагов, приближающих нас к выявлению факторов риска, лежащих в основе рассеянного склероза. Единственная известная область генома, связанная с рассеянным склерозом – это основной комплекс гистосовместимости (MHC), локализованный на хромосоме 6 – крупная область, участвующая в иммунном ответе. Lincoln с соавторами использовали его как стартовую точку для поиска генов, усиливающих риск развития этого заболевания. Они генотипировали два независимых образца от лиц с рассеянным склерозом из Канады и Финляндии, используя плотную панель single nucleotide polymorphisms (SNPs), покрывающую MHC область. Они подтвердили связи между этими геномными регионами и рассеянным склерозом. Более того, им удалось сузить кандидатную область до HLA-DRB1 , которая является наиболее вероятным локусом чувствительности. В другом исследовании Reich с соавт. используя высокоразрешающий метод admixture картирования – метод, с помощью которого возможно идентифицировать геномные регионы с генами болезней через использование различий по частоте генетических маркеров среди разных популяций. Популяции от одного предка имели разные частоты генов чувствительности, каждая исходная популяция вносила свой вклад в геном индивидуума. Т.к. рассеянный склероз превалирует у евро-американцев в сравнении с афро-американцами, геномные области, содержащие гены риска, будут, следовательно, ассоциироваться в большей степени с европейским, чем с африканским «вкладом» у лиц афро-американского происхождения, страдающих рассеянным склерозом. Авторы исследовали группу афро-американцев и обнаружили значительную связь между распространением European ancestry и рассеянным склерозом вблизи центромеры хромососы 1. Но авторами не было найдено admixture ассоциаций с другими областями генома, включая МНС регион. Для объяснения этих находок потребуются дальнейшие исследования. Но уже сейчас можно говорить о генах-кандидатах этого заболевания. Успех применения метода admixture картирования подтверждает, что он может быть хорошим инструментом для выявления факторов риска при других сложных заболеваниях. T. R. Hammond, A. Gadea, J. Dupree, C. Kerninon, B. Nait-Oumesmar, A. Aguirre, V. Gallo, Astrocyte-derived endothelin-1 inhibits remyelination through Notch activation. Neuron 81, 588–602 (2014). | |