Новый подход к диагностике

Meaburn, K. J., Gudla, P. R., Khan, S., Lockett, S. J. & Misteli, T. Disease-specific gene repositioning in breast cancer. J. Cell Biol. 187, 801–812 (2009) Article
FURTHER READING Lancto^t, C., Cheutin, T., Cremer, M., Cavalli, G. & Cremer, T. Dynamic genome architecture in the nuclear space: regulation of gene expression in three dimensions. Nature Rev. Genet. 8, 104–115 (2007) Article	Одним из величайших затруднений в собственно диагностике рака является очень незначительная величина ткани, которая забирается иглой при биопсии при подозрении на рак молочной железы. Диагностика нуждается в опытном цитопатологе и не может быть автоматизирована. Исходя из своих предыдущих демонстраций геномных перестроек при раке, Meaburn et al. подтвердили, что метод fluorescence in situ hybridization (FISH) для специфических генов может стать новым диагностическим тестом. Большое число работ последних 5 лет показало, что расположение генов в клетке не случайно; пространственное расположение ДНК в ядре открывает новый слой передачи информации в геноме человека. Такое расположение ДНК, как было установлено, изменяет нормальные процессы, такие как дифференцировка, а также имеет аномальное состояние при многих раках. Karen Meaburn, Tom Misteli с коллегами поэтому исследовали возможность обнаружения одного или нескольких генов, которое может реально использоваться в клинике в FISH методе для воспроизводимо измененного расположения их при раке. Было исследовано 20 генетических локусов в нормальных и раковых клетках и их положение было количественно оценено как позиция FISH генного сигнала относительно края ядра, нормализованного по отношению к размеру ядра. Комбинация подобных значений для сотен ядер в ткани дает одно значение, которое может быть сравнено у нормальных и раковых клеток. 8 из 20 генов обнаруживали четкое изменение позиции в более 50% раковых тканей молочных желез при сравнении с нормальными не-раковыми тканями молочных желез. Чтобы адаптировать этот подход к клиническому использованию авт. намереваются исследовать чувствительность и специфичность. Один ген hairy и enhancer of split 5 (^HES5), почти нулевой ложно позитивный и ложно негативный результат в ограниченном количестве протестированных выборок. Изменение позиции HES5 может быть также определено в смеси нормальных и раковых ядер, как и должно быть в биоптате. Если эти результаты удастся расширить на большее количество и разнообразие типов ткани, то это может стать новым диагностиком рака, сравнимых с теми, что уже используются в клинических лаб. WEB SITES * Tom Misteli's laboratory * The Cell Nucleus Web Ring

Одним из величайших затруднений в собственно диагностике рака является очень незначительная величина ткани, которая забирается иглой при биопсии при подозрении на рак молочной железы. Диагностика нуждается в опытном цитопатологе и не может быть автоматизирована. Исходя из своих предыдущих демонстраций геномных перестроек при раке, Meaburn et al. подтвердили, что метод fluorescence in situ hybridization (FISH) для специфических генов может стать новым диагностическим тестом.

Большое число работ последних 5 лет показало, что расположение генов в клетке не случайно; пространственное расположение ДНК в ядре открывает новый слой передачи информации в геноме человека. Такое расположение ДНК, как было установлено, изменяет нормальные процессы, такие как дифференцировка, а также имеет аномальное состояние при многих раках.

Karen Meaburn, Tom Misteli с коллегами поэтому исследовали возможность обнаружения одного или нескольких генов, которое может реально использоваться в клинике в FISH методе для воспроизводимо измененного расположения их при раке. Было исследовано 20 генетических локусов в нормальных и раковых клетках и их положение было количественно оценено как позиция FISH генного сигнала относительно края ядра, нормализованного по отношению к размеру ядра. Комбинация подобных значений для сотен ядер в ткани дает одно значение, которое может быть сравнено у нормальных и раковых клеток.

8 из 20 генов обнаруживали четкое изменение позиции в более 50% раковых тканей молочных желез при сравнении с нормальными не-раковыми тканями молочных желез. Чтобы адаптировать этот подход к клиническому использованию авт. намереваются исследовать чувствительность и специфичность. Один ген hairy и enhancer of split 5 (^HES5), почти нулевой ложно позитивный и ложно негативный результат в ограниченном количестве протестированных выборок. Изменение позиции HES5 может быть также определено в смеси нормальных и раковых ядер, как и должно быть в биоптате.

Если эти результаты удастся расширить на большее количество и разнообразие типов ткани, то это может стать новым диагностиком рака, сравнимых с теми, что уже используются в клинических лаб.

WEB SITES

* Tom Misteli's laboratory * The Cell Nucleus Web Ring