Посещений:
НАСЛЕДСТВЕННЫЕ СЕНСОРНЫЕ И АВТОНОМНЫЕ НЕЙРОПАТИИ

Роль DNMT1

DNMT1 links aberrant DNA methylation to hereditary sensory neuropathy
M Ghannad
Clinical Genetics Volume 80, Issue 3, pages 240–241, September 2011 | DOI: 10.1111/j.1399-0004.2011.01752.x



Mutations in DNMT1 cause hereditary sensory neuropathy with dementia and hearing loss
Klein et al. (2011)
Nature Genetics.
The hereditary sensory and autonomic neuropathies (HSANs), которые также обозначаются как наследственные сенсорные нейропатии в отсутствии существенных автономных признаков, являются генетически и клинически гетерогенной группой нарушений, ассоциированных с сенсорной дисфункцией. Их показатель подсчитан как 1 на 25,000. Пять клинических фенотипов были охарактеризованы как HSANs, и все они обнаруживают прогрессивную потерю функции периферических сенсорных нервов. HSAN1 наиболее распространена из HSANs. Это аутосомно доминантное заболевание характеризуется потерей ощущений в дистальных частях нижних конечностей, инфекциями, хроническими перфорирующими изъязвлениями стоп и прогрессирующей деструкцией подлежащих костей (1). Мутации в serine palmitoyltransferases (SPTLC1 и SPTLC2), atlastin-1 (ATL1) и Ras-related GTPase 7 (RAB7) оказались ассоциированными с некоторыми HSAN1 родословными. Однако большинство причинных генов для HSAN1 неизвестны. Недавно, используя две американские одну японскую и одну европейскую родословные, Klein et al. (1) идентифицировали новую связь между мутациями в DNA methyl transferase 1 (DNMT1) и HSAN1.
Анализ сцеплений по всему геному проведен в родословной 1, содержащей 137 индивидов в семи поколениях. Сцепление было картировано с 19p13.2 с LOD показателем 6.38. Тонкое картирование и гаплотипирование ещё больше сузило область до 3.4 Mb. Это сопровождалось Illumina and Roche 454 exome секвенированием для идентификации новой гетерозиготной мутации Tyr495Cys в гене DNMT1. Эта мутация сегрегирует с болезнью в крупной американской семье. Последующее секвенирование экзонов DNMT1 в трех др. родословных привело к идентификации той же самой мутации во второй американской и японской родословной. Европейская родословная обладала новой мутацией в DNMT1, Asp490Glu-Pro491Tyr в результате изменения в тех последовательных нуклеотидах.
DNMT1 экспрессируется на высоком уровне в постмитотических нейронах и в ЦНС взрослых (2) и является компонентом аппарата репликации ДНК во время S фазы клеточного цикла. Она обязательна для поддержания метилирования, стабильности хроматина и регуляции генов и регуляции клеточного цикла в пост-митотических нейронах, она испытывает влияние со стороны метилирования ДНК (3). DNMT1 постоянно присутствует на гетерохроматине после S фазы, поддерживая метилирование. Целевая последовательность DNMT1 важна для её функции. Мутации, идентифицированные Klein et al. (1), появляются в этом домене targeting последовательности, подтверждая наличие мутаций потери функции. В самом деле, мутантные конструкции DNMT1 были сгенерированы и сравнены с экспрессирующимся белком дикого типа, который был растворим, мутантные формы белка были нерастворимы и формировали внутриклеточные включения, указывающие на то, что они неправильно упакованы. Кроме того, в то время как белок дикого типа вступал в ядро и соединялся с фокусами репликации во время S фазы, два мутантных белка оставались в цитоплазме и были неспособны проникать в ядро. Кроме того, ферментативная активность мутантной DNMT1 была заметно снижена по сравнению с таковой дикого типа.
Дальнейшие исследования проверяли эффекты DNMT1 на глобальное метилирование, авт. проанализировали 12 выборок, как затронутых, так и не затронутых родственников из родословной 1 (American), используя масс-спектрометрию измеряли уровни 5-methyl-2?-deoxycytidine (5-mdC). 8% снижение уровней 5-mdC наблюдалось по сравнению с контрольной группой (p < 0.001). Поскольку метилирование зависело от возраста и пола, то авт. также сравнивали содержание 5-mdC между тремя парами siblings одного и того же пола и между двумя парами кузенов с разницей в возрасте менее 5 лет. наблюдалось постоянное снижение на 7-15% в уровне 5-mdC у затронутых индивидов.
Чтобы исследовать вклад центромерных и перицентромерных регионов, которые, как известно, влияют на глобальное метилирование, был использован метод pyrosequencing, чтобы исследовать CpG места в satellite 2, line 1, satellite α и Alu повторяющиеся элементы. результаты показали снижение метилирования определенных CpG сайтов в регионе satellite 2 у группы затронутых индивидов. Эти результаты согласуются со снижением 5-mdC, указывая, что глобальное гипометилирование, происходящее в satellite 2 повторяющихся элементах, может нарушать стабильность гетерохроматина.
В этом исследовании Klein et al. описали мутации у HSAN1 пациентов, приводящие к неправильной укладке DNMT1, это нарушало её способность связываться с гетерохроматином в post-S фазе, приводя к глобальному гипометилированию и локальному гиперметилированию. Эти находки указывают на прямую связь между мутациями DNMT1 и HSAN1. итак, эти данные показывают, что DNMT1 вносит вклад в динамичную регуляцию нервной системы и что даже умеренные изменения в метилировании могут вызывать тяжелые дефекты в жизнеспособности и функции нейронов. Кроме того, данное исследование указывает на альтерации в метилировании как на механизм, вносящий вклад в нейродегенерацию.
Сайт создан в системе uCoz