Посещений:
СИНДРОМ СТРОММА



Мутации в гене CENPF

Str∅mme Syndrome Is a Ciliary Disorder Caused by Mutations in CENPF
Isabel Filges,Elisabeth Bruder,Kristin Brandal, Stephanie Meier,Dag Erik Undlien, Trine Rygvold Waage, Irene Hoesli, Max Schubach, Tjaart de Beer, Ying Sheng, Sylvia Hoeller, Sven Schulzke,Oddveig Rosby, Peter Miny, Sevgi Tercanli, Truls Oppedal, Peter Meyer, Kaja Kristine Selmer, Petter Stromme
Hum. Mut. Volume 37, Issue 4 April 2016 Pages 359–363

Синдром Стрёмма (Str∅mme) впервые описанный в 1993 г.( Str∅mme et al.,1993) у сестёр, имевших атрезию тонкого кишечника (“apple peel”), аномалии глаза и микроцефалию. Мы описали многолетние повторные данные клинических исследований оргинальной, описанной Стрёммром пары сибсов и пары прежде неизвестных сибсов, имевших, несмотря на большую вариабельность клинического проявления, значительное фенотипическое перекрывание с синдромом Стрёмма. При секвенировании полного экзома были идентифицированы мутации (Waters et al. 2015), ассоциирующиеся с мутациями гена CENPF (*600236), члена большого семейства генов, кодирующего центромерные белки, Эти мутации, вызывающие аутосомный летальный эффект в эмбриональном периоде, наследовались по аутосомно-рецессивному типу, образовывали у каждого индивида компаундное биаллельное состояние. В семье А, идентифицированы две мутации гена CENPF : нонсенс мутация в экзоне 12 (g.214814415; c.2734C>T, p.Glu912*) и мутация сдвига рамки считывания в экзоне 3 (g. 214788176–214788205; c.165_193del, p.Asn57Lysfs*11). В семье B были идентифицированы нонсенс мутации в экзоне 12 (g.214813425; c.1744G>T; p.Glu582*) и в экзоне 20 (g.214837072; c.9280C>T; p.3094Arg*). Согласно базе данных ExAC (http://www.exac.broadinstitute.org), три варианта нонсенс мутации соответствуют предельно низким частотам аллелей (Supp. Table S1), и ни одна не найдена в гомозиготном состоянии, что присуще редким болезням. По своим фенотипическим и функциональным данным мутации сходны с цилиопатией человека (Waters et al., 2015). Показано, что мутации потери функции гена CENPF, вызывающие синдромальные пороки развития у человека, представляют широчайшее фенотипическое разнообразие. Ген CENPF - это пример функциональной связи между регуляцией клеточного цикла, цитокинезом и первичной ресничкой. CENPF важен для прикрепления микротрубочек к кинетохору (Bomont et al., 2005; Laoukili et al, 2005; Yang et al., 2005). Истощение белка CENPF в разных типах клеток приводит к продолжительной задержке митоза и уменьшению натяжения между кинетохорами, связанными с микротрубочками, и полюсами веретена.


Рисунки к статье


Совсем недавно описан ген CENPF (Waters et al. ,2015) как новый ген центриолярной болезни, сопричастный цилиопатии и микроэнцефалии у человека. Двойственна роль белка кинетохора ENPF в ориентации веретена и цилиогенезе была подтверждена работами на рыбке данио модели.
A: Pedigree of family A. B: Frontal view of AII-1 at age 25 with a prosthesis of the right eye indicated by lack of dilatatory response on atropine. C: Profile of AII-1 showing a receding forehead and microcephaly. D: Eye findings in AII-2 with synechiae of the left eye and corneal clouding in the upper left region indicating attachment of the iris to the cornea. E: Pedigree of family B. F: Autopsy findings of BII-2 12 days after birth (30+4 gestational weeks): whole body in frontal and profile view. G: "Apple peel" atresia. H: Macroscopic autopsy pictures of the right and left eye in BII-2. For detailed description, see text. I: Autopsy findings of BII-3 at 22 gestational weeks showing the whole body. J: Left preaxial polydactyly and intestinal atresia with string of pearls appearance. K: Family B, histologic sections: (a) myocardial and (b) intestinal section of BII-3 with myopathic changes including hypotrophic muscular tissue with little cytoplasm, crowding of nuclei, and a substantial number of binucleated cells indicated by arrows in comparison to age-matched controls. c: Liver and (d) duodenal section of BII-2: binucleated cells are indicated by arrows.

Мы сообщили здесь о результатах секвенирования целого экзома(WES), выполненных на метериале о оригинальной семьи, описанной Стрёммом с соавторами (Str?mme et al. ,1993) (Family A) described by Str?mme et al. (1993) и дополнительными сибсами siblings (Family B), которые недавно привлекли наше внимание --Девочку с чертами, напоминающими это состояние и плод мальчика с фенотипом , подобным фенотипу при цилиопатии. В обоих семьям идентифицировано и подтверждено наличие в гетерозиготном состоянии мутаций урезания гена CENPF. Phenotypic details are summarized in Table 1. Первыми пациентами с синдромом Стрёмма были две норвежские сестры (Family A, II-1 and II-2; Fig. 1A-C), дети неродственных родителей, у которых была рвота желчью и которые после рождения быстро умерли из-за врожденной аномалии кошечника с зарашением просвета [Str?mme et al., 1993]. Обеим была сделана немедленная резекция тощей кишки, свернутой в виде кожуры чищенного яблока, и анастомоз с дистальной частью подвздошной кишки. Были отмечены микроцефалия и аномалии глаз. Проявлений в других органах не выявлено.

Table 1. Comparison of Phenotypes and Genotypes of the Affected Individuals in Family A and B and the Patients Reported in Waters et al. (2015)

Было найдено, что две мутации гена CENPF (RefSeq NM_016343.3; MIM #600235) сегрегируют с фенотипом в каждом семействе, согласуясь с гетерозиготными мутациями, образовавшими компаунд. В семье А, идентифицированы две мутации гена CENPF : нонсенс мутация в экзоне 12 (g.214814415; c.2734C>T, p.Glu912*) и мутация сдвига рамки считывания в экзоне 3 (g. 214788176-214788205; c.165_193del, p.Asn57Lysfs*11). В семье B, были идентифицированы нонсенс мутации в экзоне exon 12 (g.214813425; c.1744G>T; p.Glu582*) и в экзоне20 (g.214837072; c.9280C>T; p.3094Arg*). Все варианты были представлены в базе данных LOVD CENPF database http://www.lovd.nl/CENPF). Мутация p.Glu582* была описана у четырех плодов первоначального семейства (Waters et al.,2015) так же, как и у пациента с микроцефалией. Согласно с базой данных ExAC (http://www.exac.broadinstitute.org), три варианта нонсенс мутации соответствуют предельно низким частотам аллелей (Supp. Table S1), и ни одна не найдена в гомозиготном состоянии, соответствуя редким болезням по аналогии с частотами носителей других редких наследственных болезней. Copy-number analysis using the Affymetrix CytoScan® HD array (Affymetrix) was repeated На DNA, полученной от фибробластов у одного пациента найдена мозаичная разнохарактерная анеуплоидия [Bower et al., 2003], но не обнаружено других аномалий. Совсем недавно описан первый фенотип человека Waters et al. (2015), ассоциирующийся с мутациями гена CENPF (*600236), члена большого семейства, кодирующего центромерные белки. Было найдено, что мутации, укорачивающие ген, вызывают аутосомный летальный эффект в эмбриональном периоде с аутосомно-рецессивным наследованием, по фенотипу напоминающие цилиопатию в некровнородственных родословных. Исследовано четыре эмбриона и один неродственный пациент, проявлявший изолированно микроцефалию. Используя WES, были открыты биаллельно инактивируюшие мутации в одном и том ж гене у двух сестер с оригинально описанным синдромом Стрёмма (AII-1, AII-2) и двумя сибсами второй , несвязанно с ними родством семьи (BII-2, BII-3). Девочка BII-2 была фенотопически совместима с синдромом Стрёмма , но с летальным исходом, тогда как у эмбриона мальчика (BII-3) была атрезия кишечника и преаксиальная полидактилия. Последнее является типичным клиническим проявлением цилиопатии. При исследовании функции ресничек, показано, что белок CENPF локализуется совместно с IFT88 вдоль аксонемы реснички (Waters et al., 2015). Опыты с нокдауном у рыбок подтвердили, что ген CENPF играет важную роль в цилиогенезе и функционировании ресничек. Прежде было показано, что центромерный белок F, названный митозином, который, как показано, связан с кинетохором и митотическим веретеном, необходим для сегрегации хромосом в митозе. Он представляет собой большой белок в 350-kDa в виде двойной спирали, динамически экспрессируемый на протяжении клеточного цикла, оставаясь на низком уровне во время фазы S, но аккумулирующийся во время G2 в ядре и ядерной оболочке. После релокализации в кинетохоры в переходный период G2/M transition [Liao et al., 1995] CENPF остаётся связанным с кинетохорами до анафазы, когда он локализуется в средней зоне веретена до момента деградации последнего [Zhu et al., 1995; Gurden et al., 2010]. CENPF важен для прикрепления микротрубочек к кинетохору [Bomont et al., 2005; Laoukili et al, 2005; Yang et al., 2005]. Исчерпание белка CENPF в разных типах клеток приводит к продолжительной задержке митоза и уменьшению натяжения между кинетохорами, связанными с микротрубочками. Т.о., CENPF - это дополнительный пример функциональной связи между регуляцией клеточного цикла, цитокинезом и первичной ресничкой. Гены, вовлекаемые в процесс клеточного деления, должны, следовательно, рассматриваться как важные кандидаты в гены, проливающие свет на раннее развитие человека. Биологическая роль гена CENPF в цилиогенезе так же, как и в процессе клеточного деления объясняет его фундаментальную роль в формировании органов в период раннего эмбрионального развития. Ген CENPF специфически экспрессируется разных тканях мозга, (роговица, сетчатка, зрительный нерв и хрусталик), лицевые структуры так же, как и конечности, печень, легкие, желудок, кишечник, мочевыводящие пути и репродуктивная система во время эмбрионального развития на стадии 14.5 (эквивалентной стадии1 развития человека по Carnegie; 6 неделям беременности), и также в мейотических ооцитах у взрослых (http://www.informatics.jax.org). Спектр затронутых органов у пациентов с биаллельными вредными мутациями гена CENPF в значительной степени отражает тканевой профиль экспрессии CENPF. Наши находки подтверждают, что мутации потери функции гена CENPF, вызывают синдромальные пороки развития у человека, представляющие широкое фенотипическое разнообразие. Цилиарный фенотип погибшего эмбриона (BII-3 in this study and Family 1 described by Waters et al. (2015)) представляет тяжелый вариант спектра фенотипов. При промежуточных формах индивиды живут продолжительное время после хирургического исправления кишечной атрезии. Несиндромальная микроцефалия, по-видимому, представляет случай аномального фенотипа умеренной выраженности. [Waters et al., 2015]. Напротив, блокирование развития на эмбриональной 8 клеточной стадии преимплантационного эмбриона жвачных из-за истощения белка ENPF с резким уменьшением способности к развитию после эмбриональной активации генома [Toralov? et al., 2009] может быть рассмотрено как предельный летальный фенотип. При повторном исследовании гистологических срезов сердца и кишечника у пациентов из пары B обнаружены миопатичекие изменения, гипоплазию мышечной ткани, аномально маленькие кардиомиоциты с малым количеством цитоплазмы, и неожиданно высокое количество двуядерных клеток в сравнении контрольными индивидами того же возраста (Fig. 1K), что согласуется с находками, полученными у мутантных мышей, и описанными функциями CENPF. Фенотипическая связь с одними и теми же мутациями хорошо известна из ряда нарушений ресничек, несмотря на то, что клинические признаки имеют тенденцию перкрываться [Coppieters et al.,2010]. Интересно, что у затронутых индивидов из двух семей, описанных by Waters et al. (2015) и семьи B из этого сообщения у всех была одна и та же нонсенс мутация c.1744G>T в экзоне 12. Индивиды оригинального синдрома Стрёмма в семье A имели разные нонсенс мутации в экзоне 12. У всех индивидов мутация в экзоне 12 комбинировалась к второй c урезающей нонсенс мутацией сдвига рамки считывания или мутации сплайс-сайта в функционально соответствующих доменах гена. В семье B, вторая мутация в экзоне 20 соответствовала сигнальной области ядерной локализации, ослабляющая локализацию белка области в ядре, предотвращая связь с центомерами во время митоза. Может ли экзон 12 представлять горячую точку, нужно ещё определить, если будут идентифицированы новые пациенты. На сегодня роль миссенс мутаций в CENPF и ассоциированные с этим фенотипы остаются неизвестными. Итак, мы продемонстрировали, что укорачивающая мутация гена CENPF вызывает синдром Str?mme так же, как и при эмбриональном цилиарном фенотипе, включающем полидактилию так, что синдром Стрёмма может быть рассмотрен как проявление цилиопатии. Фундаментальная роль гена CENPF в клеточном делении и эмбриональном развитии органов, зависит, по-видимому, от ресничек, и объясняет широкое разнообразие сопутствующих клинических фенотипов. Ключевой клинический признак для будущего пренатального или постнатального распознавания нарушений, относящихся к CENPF, может быть наличие дуоденальной или другой атрезии кишечника.