Посещений:
НАРУШЕНИЯ ЯДРЫШКА
Роль при нарушениях развития, болезнях и опухолях
Nucleolar stress: From development to cancer M.Carmen Lafita-Navarro, Maralice Conacci-Sorrell et al.
Seminars in Cell & Developmental Biology
Volume 136, 28 February 2023, Pages 64-74 https://doi.org/10.1016/j.semcdb.2022.04.001
|
The nucleolus is a large nuclear membraneless organelle responsible for ribosome biogenesis. Ribosomes are cytoplasmic macromolecular complexes comprising RNA and proteins that link amino acids together to form new proteins. The biogenesis of ribosomes is an intricate multistep process that involves the transcription of ribosomal DNA (rDNA), the processing of ribosomal RNA (rRNA), and the assembly of rRNA with ribosomal proteins to form active ribosomes. Nearly all steps necessary for ribosome production and maturation occur in the nucleolus. Nucleolar shape, size, and number are directly linked to ribosome biogenesis. Errors in the steps of ribosomal biogenesis are sensed by the nucleolus causing global alterations in nucleolar function and morphology. This phenomenon, known as nucleolar stress, can lead to molecular changes such as stabilization of p53, which in turn activates cell cycle arrest or apoptosis. In this review, we discuss recent work on the association of nucleolar stress with degenerative diseases and developmental defects. In addition, we highlight the importance of de novo nucleotide biosynthesis for the enhanced nucleolar activity of cancer cells and discuss targeting nucleotide biosynthesis as a strategy to activate nucleolar stress to specifically target cancer cells.
|
Биогенез рибосом нуждается в потреблении энергии и является многоступечатым процессом с использованием транскрипции рибосомальной ДНК (rDNA), процессинга рибосомальной РНК (rRNA) и сборки rRNAs с рибосомальными белками. Большинство ступеней биогенеза рибосом осуществляется в специализированных органеллах, ядрышке. Ядрышко является лишенной мембраны органеллой, которая собирается вокруг локусов rDNA, которые кодируют 47 S precursor rRNA (pre-rRNA), и которые подвергаются процессингу с помощью endo- и exonucleases, чтобы создать зрелые18 S, 5.8 S, и 28 S rRNAs [1]. Диплоидная клетка человека содержит около 400 копий локусов rDNA, организованных в виде тандемных повторов в nucleolar organizer regions (NOR) [2], [3]. У людей, NORs картируются на коротких плачах акроцентрических хромосом 13, 14, 15, 21 и 22, и окружены с помощью центромерного и теломерного гетерохроматина [3], [4]. Ряд rDNA локусов варьирует в каждом NOR [3], [4]. Интересно, что из всех локусов rDNA loci, лишь 20% - 50% из них активно транскрибируются с помощью RNA polymerase (Pol) I, чтобы синтезировать pre-rRNA 47 S. 5 S rRNA является единственной rRNA, транскрибируемой вне ядрышка с помощью Pol III. Подобно pre-rRNA 47 S, гены 5 S rRNA человека также организованы в кластеры из тысяч повторов, при этом большинство из них картируется в хромосоме 1(q42-q43) [5], [6]. 5.8 S, 28 S и 5 S rRNA инкорпорируются в крупные рибосомальные субъединицы, тогда как 18 S rRNA включается в малую рибосомную субъединицу. Большая и малая субъединицы экспортируются их ядрышка в цитоплазму, где они формируют активные 80 S рибосомы вместе с mRNA [7].
Чтобы обеспечить собственно постепенную координацию созревания рибосом, ядрышки имеют 3 биохимически и функционально отличающиеся суб-компартменты (Fig. 1) [8]. Транскрипция rDNA происходит в fibrillar centers (FC), где располагаются аппарат транскрипции Pol I и rDNA гены. Первая ступень процессинга pre-rRNA 47 S происходит в месте контакта (interface) между FC и dense fibrillar component (DFC), где располагаются факторы процессинга rRNA, такие как fibrillarin остатки. Финальная ступень процессинга rRNA и сборка субъединиц рибосом происходит в granular component (GC), где располагаются факторы процессинга rRNA, структурные белки рибосом и др. ядрышковые организаторы, такие как nucleophosmin 1 (NPM1) [8].
Ощибки на любой из ступеней биогенеза рибосом могут вызывать ядрышковый стресс, который характеризуется нарушениями морфологии и функции ядрышка. Это может привести к активации путей, екоторые способствуют аресту клеточного цикла, что сопровождается или репарацией и нормализацией или апоптозом, если повреждение не может быть репарировано. При некоторых болезнях присутствуют специфические генетические мутации, которые нарушают биогенез рибосом. Это приводит к постоянной активации ядрышкового стресса, который в свою очередь запускает арест клеточного цикла или апоптоз в определенных типах клеток. Напротив, раковые клетки развивают стратегии, чтобы поддерживать биогенез рибосом, который необходим для усиления роста и пролиферации клеток. Эти стратегии включают использование альтернативных метаболических путей для усиления активности ядрышка. Появляются доказательства, что раковые клетки активируют de novo пути биосинтеза нуклеотидов, чтобы эффективно увеличить пул нуклеотидов для синтеза rRNA [9-12], [13]. Здесь мы обсуждаем связь между ядрышковым стрессом и болезнями, включая дегенеративные заболевания, дефекты развития и рак.
Section snippets
Morphological and biophysical aspects of nucleolar stress
Физическое разделение 3 субкомпартментов ядрышка возможно благодаря присутствию несмешивающихся жидких фаз [14]. Эти, подобные жидкости фазы, формируются с помощью специфических гетеротипических и гомотипических электростатических взаимодействий между компонентами субкомпартментов ядрышка и тем самым обеспечивая их сегрегацию [14-16]. Интересно, что разделение жидких фаз, которое приводит к сборке регионов ядрышка, что облегчается присутствием pre-rRNA [17]...
Pathways activated downstream of nucleolar stress
Одним из следствий физической реорганизации ядрышка в условиях ядрышкоого стресса является перераспределение рибосомальных белков, таких как RPL5 и RPL11 и RNAs, таких как 5 S rRNA в ядерной плазме (Fig. 1C). Когда это происходит, то p53 ubiquitin-ligases мышей double minute 2 и 4 (MDM2 and MDM4) [18] взаимодействуют с RPL5 и RPL11 в плазме ядра, а также с 5 S rRNA. Эти взаимодействия приводят к секвестрации MDM2 и MDM4, подавляя их способность связывать и убиквитинировать p53...
Nucleolar stress and developmental defects
Некоторые нарушения развития вызываются генетическими мутациями в специфических генах, связанных с продукцией рибосом; эти болезни в целом называются ribosomopathies. Принимая во внимание, что дефекты биогенеза рибосом связаны с ядрышковыми стрессами, очень возможно, что индивиды с рибосомопатией несут большой воз неразрешимых ядрышковых стрессов. Некоторые из наиболее хорошо охарактеризованных рибосомопатий, включая Treacher Collins syndrome, Diamond Blackfan anemia, Bowen-Conradi syndrome, и др...
Nucleolar stress in degenerative diseases
Дегенеративные заболевания часто характеризуются пониженной пролиферацией или повышенной гибелью специфических клеток, которые в свою очередь нарушают функцию органа. Эти болезни часто прогрессируют со временем из-за накоплений клеточных повреждений в определенных органах. Некоторые примеры показали, что ядрышковый стресс играть роль в прогрессировании дегенеративных болезнеЙ, таких как аневризма абдоминальной аорты [61], [62], amyotrophic lateral sclerosis [63], frontotemporal dementia [64], ataxia type III [65],...
Driving nucleolar stress by limiting nucleotide availability to target cancer cells
Дефекты развития и дегенеративные болезни обычно вызываются снижение пролиферации клеток или усилением клеточной гибели. Однако, противоположная картина поведения клеток вырисовывается для раковых клеток; они пролиферируют с очень высокой скоростью и м. избегать сигналов ареста клеточного цикла и клеточной гибели, приводя к формированию опухоли. Одной из характеристик раковых клеток является увеличение размера ядрышка, это отражает повышенную активность ядрышка и биогенеза рибосом...
Future perspectives on activating nucleolar stress to treat cancers
Индукция ядрышкового стресса, чтобы активировать p53 в раковых клетках является интересным подходом к лечению опухолей, несущих функциональные p53 и MDM2 белки. В нормальных клетках, p53 стабилизируется с помощью механизмов множественных стрессовых пропускных пунктов (checkpoint), которые нарушают способность MDM2/4 деградировать p53 (Fig. 4A). Эти механизмы включают стимуляцию онкогенных стрессов посредством ARF [84-86], повреждения ДНК посредством ATM [87], [88] или ядрышковый стресс посредством RPL5/11-5 S rRNA [21-25] (Fig. 4A)...
Concluding remarks
Структура ядрышка чрезвычайно динамична, ядрышко интегрирует ряд стимулов и реагирует на них путем наладки биогенеза рибосом, тем самым регулируя клеточный рост. Принимая во внимание, что ядрышковый стресс вызывает характерные изменения в размере и морфологии ядрышка, мы предложили использовать визуализацию ядрышка в комбинации с др. техниками, такими как секвенирование ДНК, для диагностики болезней. Определение размера, формы и количества ядрышков может предоставить информацию о мишенях, которая может быть использована...
|