Транспозоны появились как многообещающие вектора для генотерапии, которые в принципе могут преодолеть некоторые ограничения, обычно характерные для использования вирусных векторов. Транспозоны стабильно интегрируются в мишени генома клетки, что обеспечивает постоянную экспрессию находящихся в них терапевтических генов. Транспозоны используются в качестве базовых инструментов в биомедицинских исследованиях в качестве bona fide терапии. На сегодня наиболее многообещающие транспозоны для генотерапии происходят из Sleeping Beauty (SB) или piggyBac (PB). Стабильный перенос транспозонов нуждается с совместнойдоставке ДНК транспозона с соотв. геном transposase, мРНК или белка. Эффективная стабильная транспозиция может быть существенно усилена с помощью "следующего поколения" транспозоновых систем, которые комбинируют оптимизацию используемого кодона (codon-usage) с гипер-активирующими мутациями в SB или PB transposases. Благодаря своей относительно большой ёмкости, возможна генотерапия с относительно крупными терапевтическими трансгенами, такими как дистрофин полной длины. Был показан в данной статье и др. авт. эффективный и стабильный перенос генов, достигаемый с помощью этих транспозонов следующего поколения в некоторых клинически важных первичных клетках, таких как CD34+ гематопоэтические стволовые клетки и клетки предшественники, T клетки и мезенхимные и миогенные стволовые клетки и клетки предшественники, которые пригодны для ex vivo трансфекции. Альтернативно, in vivo доставке гена транспозоном используются не вирусные вектора или наночастицы или их комбинация с вирусными векторами. Терапевтический потенциал этих базирующихся на SB и PB транспозонов был продемонстрирован в преклинических моделях, которые воспроизводят соотв. болезни человека. Однако, всё ещё существуют проблемы, препятствующие к использованию транспозонов в клинике, возникающие в основном из-за типичных ограничений в эффективности большинства не вирусных методов трасфекции и прирожденная токсичность ДНК. Несмотря на это особенно обнадеживает то, что транспозоны теперь используются в клинических испытаниях по генотерапии. В частности, преобразованные транспозонами T клетки, экспрессирующие химерные антигенные рецепторы, начали давать многообещающие результаты у пациентов с гематологическим озлокачествлением.